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人类多囊肾病相关蛋白TMEM130基因的克隆及生物信息学分析

齐兴柱, 胡文婷, 张俊芳, 黄俊生, 李军

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齐兴柱, 胡文婷, 张俊芳, 黄俊生, 李军. 人类多囊肾病相关蛋白TMEM130基因的克隆及生物信息学分析[J]. 热带生物学报（中英文）, 2010, 1(2): 114-120. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2010.02.018

引用本文:

齐兴柱, 胡文婷, 张俊芳, 黄俊生, 李军. 人类多囊肾病相关蛋白TMEM130基因的克隆及生物信息学分析[J]. 热带生物学报（中英文）, 2010, 1(2): 114-120. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2010.02.018

QI Xing-zhu, HU Wen-ting, ZHANG Jun-fang, HUANG Jun-sheng, LI Jun. Cloning and Bioinformatics Analysis of Human Polycystic Kidney Disease-related Protein TMEM130[J]. Journal of Tropical Biology, 2010, 1(2): 114-120. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2010.02.018

Citation:

QI Xing-zhu, HU Wen-ting, ZHANG Jun-fang, HUANG Jun-sheng, LI Jun. Cloning and Bioinformatics Analysis of Human Polycystic Kidney Disease-related Protein TMEM130[J]. Journal of Tropical Biology, 2010, 1(2): 114-120. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2010.02.018

人类多囊肾病相关蛋白TMEM130基因的克隆及生物信息学分析

DOI: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2010.02.018

齐兴柱^1,2,
胡文婷¹,
张俊芳^2,3,
黄俊生^2,3,
李军¹

1. 海南大学海洋学院, 海南海口 570228;
2. 海南大学农学院, 海南海口 570228;
3. 中国热带农业科学院环境与植物保护研究所, 海南儋州 571737

基金项目:

海南省教育厅高等学校科研项目(Hjkj2010-13)

海南省自然科学基金(808122)

海南热带水生生物技术重点实验室开放基金(shkyjj0801)

第一作者:
齐兴柱(1973-)，男，湖南津市人，海南大学农学院2009级在职博士研究生.

中图分类号: R318.04

Cloning and Bioinformatics Analysis of Human Polycystic Kidney Disease-related Protein TMEM130

1. Ocean College, Hainan University, Haikou 570228, China;
2. Agricultural College, Hainan University, Danzhou 571737, China;
3. Environment and Plant Protection Institute, CATAS, Danzhou 571737, China

摘要: 以递交到GenBank上的TMEM130蛋白基因序列(nm-152913)为模板设计引物,以人大脑cDNA文库为模板进行巢氏PCR扩增,并将PCR产物克隆到pMD18-T载体上,成功获得TMEM130蛋白基因编码序列,测序结果显示,获得的序列为TMEM130蛋白基因转录变异体2,其编码序列长1272bp。该基因定位在人类第7条染色体7q22.1区域,有3个转录变异体。生物信息学分析显示该序列可编码1个含423个氨基酸的蛋白质;Smartmode程序显示该蛋白质是1个跨膜蛋白,在100～250号氨基酸序列之间有1个与多囊肾病(PKD)相关的结构域。因此,鉴定TMEM130蛋白是一个与人类多囊肾病相关的蛋白。
- TMEM130蛋白 /
- 多囊肾病 /
- 生物信息学 /
- 克隆
Abstract: According to TMEM130 gene sequence（NM-152913） information,human brain cDNA library was used as the template and the specific primers were designed.The nPCR amplification product was separated by agarose gel and the band was cloned into PMD18T-vector and sequenced.The analysis results showed that the sequence is the transcript variant 2 of TMEM130,as a transmembrane protein,which contains an open reading frame of 1272 nucleotides and encodes a protein with 423 amino acids and contains a polycystic kidney disease（PKD）-related domain between 100 and 250 amino acid.
- TMEM130 protein /
- polycystic kidney disease /
- bioinformatics /
- cloning

[1]	郑超凡, 仲崇浩, 王猛, 盛佳颖, 王艺凯, 黄家权, 陈庆河, 李东栋, 汤华. 榴莲LEA基因家族鉴定及低温胁迫表达分析 . 热带生物学报（中英文）, 2026, 17(): 1-15. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.20250167
[2]	张佳雯, 石胜梅, 温泽文, 李佩玉, 余治健, 杨琼, 李烁, 汤明星, 韦露. 切离酶XisF4的生信特征、调控与进化分析 . 热带生物学报（中英文）, 2026, 17(): 1-12. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.20250198
[3]	羊娥月, 李杨, 莫明珠, 杨东梅, 刘亚, 吴友根, 于靖. 越南油茶CdMYC2基因克隆、生物信息学分析与表达模式研究 . 热带生物学报（中英文）, 2026, 17(4): 578-586. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.20250031
[4]	段祺骅, 梅文莉, 杨琢, 朱家红, 戴好富, 谭志琼, 陈惠琴. 益智III型聚酮合酶基因AoPKS5的克隆及其表达分析 . 热带生物学报（中英文）, 2025, 17(): 1-12. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.20250148
[5]	金海峰, 王朝政, 侯清芳, 咸利民, 张华剑, 吴少英. 普通大蓟马MuRhodopsin基因的全长克隆及生物信息学分析 . 热带生物学报（中英文）, 2023, 14(6): 651-659. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.20220105
[6]	符丹凤, 刘洪涛, 杨明秋, 何玉贵. 斑节对虾PmML1和PmML2基因的鉴定及表达分析 . 热带生物学报（中英文）, 2022, 13(5): 440-450. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2022.05.003
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[12]	张玉叶, 黄宁, 肖新换, 黄珑, 苏炜华, 许莉萍, 阙友雄. 甘蔗B12D基因全长cDNA克隆与表达分析 . 热带生物学报（中英文）, 2014, 5(2): 111-119. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2014.02.011
[13]	乔莹, 王军, 钟声平, 刘洪涛, 毛勇. 日本囊对虾apo-14基因的全克隆及序列分析 . 热带生物学报（中英文）, 2013, 4(1): 17-24. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2013.01.001
[14]	张秀春, 吴坤鑫, 孙建波, 夏亦荠, 彭明, 李文彬. 拟南芥AtNUDT2启动子的分离及其功能分析 . 热带生物学报（中英文）, 2012, 3(2): 116-120. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2012.02.001
[15]	叶可勇, 陈瑶, 李瑞梅, 符少萍, 郭建春. 小果野蕉microRNAs及其靶基因的生物信息学预测 . 热带生物学报（中英文）, 2012, 3(3): 222-227. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2012.03.013
[16]	张晓茹, 匡文华, 成鹰, 杜丽, 雷明, 焦寒伟, 张冬琳, 郝永昌, 祁超, 王凤阳. 水牛Cdc42 cDNA的克隆与生物信息学分析 . 热带生物学报（中英文）, 2011, 2(4): 349-354. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2011.04.019
[17]	张鲲, 徐立, 丛汉卿, 丁静, 郝宏刚, 李志英. 受乙烯诱导表达的蜻蜓凤梨MAPKK基因的克隆与序列分析 . 热带生物学报（中英文）, 2011, 2(2): 107-112. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2011.02.013
[18]	杜丽, 谢少林, 成鹰, 张晓茹, 匡文华, 焦寒伟, 张冬琳, 郝永昌, 雷明, 刘涛, 王凤阳. 海南坡鹿MD2 cDNA的克隆及其生物信息学分析 . 热带生物学报（中英文）, 2011, 2(1): 1-5. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2011.01.001
[19]	林生, 潘大仁, 周以飞, 陈观水, 张绪璋, 吴子峰. 果蔗SoSgt1基因的克隆表达与植物反义表达载体的构建 . 热带生物学报（中英文）, 2010, 1(1): 1-7. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2010.01.010
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人类多囊肾病相关蛋白TMEM130基因的克隆及生物信息学分析

DOI: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2010.02.018

1. 海南大学海洋学院, 海南海口 570228;

2. 海南大学农学院, 海南海口 570228;

3. 中国热带农业科学院环境与植物保护研究所, 海南儋州 571737

基金项目:

海南省教育厅高等学校科研项目(Hjkj2010-13)

海南省自然科学基金(808122)

海南热带水生生物技术重点实验室开放基金(shkyjj0801)

作者简介:
齐兴柱(1973-)，男，湖南津市人，海南大学农学院2009级在职博士研究生.

收稿日期: 2010-03-19

中图分类号: R318.04

关键词:

TMEM130蛋白 /

生物信息学 /

摘要: 以递交到GenBank上的TMEM130蛋白基因序列(nm-152913)为模板设计引物,以人大脑cDNA文库为模板进行巢氏PCR扩增,并将PCR产物克隆到pMD18-T载体上,成功获得TMEM130蛋白基因编码序列,测序结果显示,获得的序列为TMEM130蛋白基因转录变异体2,其编码序列长1272bp。该基因定位在人类第7条染色体7q22.1区域,有3个转录变异体。生物信息学分析显示该序列可编码1个含423个氨基酸的蛋白质;Smartmode程序显示该蛋白质是1个跨膜蛋白,在100～250号氨基酸序列之间有1个与多囊肾病(PKD)相关的结构域。因此,鉴定TMEM130蛋白是一个与人类多囊肾病相关的蛋白。

English Abstract

齐兴柱, 胡文婷, 张俊芳, 黄俊生, 李军. 人类多囊肾病相关蛋白TMEM130基因的克隆及生物信息学分析[J]. 热带生物学报（中英文）, 2010, 1(2): 114-120. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2010.02.018

引用本文:

齐兴柱, 胡文婷, 张俊芳, 黄俊生, 李军. 人类多囊肾病相关蛋白TMEM130基因的克隆及生物信息学分析[J]. 热带生物学报（中英文）, 2010, 1(2): 114-120. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2010.02.018

QI Xing-zhu, HU Wen-ting, ZHANG Jun-fang, HUANG Jun-sheng, LI Jun. Cloning and Bioinformatics Analysis of Human Polycystic Kidney Disease-related Protein TMEM130[J]. Journal of Tropical Biology, 2010, 1(2): 114-120. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2010.02.018

Citation:

QI Xing-zhu, HU Wen-ting, ZHANG Jun-fang, HUANG Jun-sheng, LI Jun. Cloning and Bioinformatics Analysis of Human Polycystic Kidney Disease-related Protein TMEM130[J]. Journal of Tropical Biology, 2010, 1(2): 114-120. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2010.02.018

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