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蓖麻WRKY14基因的鉴别与信息分析

黄启星 郭安平 杨礼富 邹智

黄启星, 郭安平, 杨礼富, 邹智. 蓖麻WRKY14基因的鉴别与信息分析[J]. 热带生物学报, 2012, 3(4): 305-313. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2012.04.005
引用本文: 黄启星, 郭安平, 杨礼富, 邹智. 蓖麻WRKY14基因的鉴别与信息分析[J]. 热带生物学报, 2012, 3(4): 305-313. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2012.04.005
HUANG Qixing, GUO Anping, YANG Lifu, ZOU Zhi. In silico Identification and Bioinformatic Analysis of Castor Bean WRKY14 Gene[J]. Journal of Tropical Biology, 2012, 3(4): 305-313. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2012.04.005
Citation: HUANG Qixing, GUO Anping, YANG Lifu, ZOU Zhi. In silico Identification and Bioinformatic Analysis of Castor Bean WRKY14 Gene[J]. Journal of Tropical Biology, 2012, 3(4): 305-313. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2012.04.005

蓖麻WRKY14基因的鉴别与信息分析

doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2012.04.005
基金项目: 

海南省自然科学基金(312026)

中国热带农业科学院橡胶研究所基本科研业务费专项(1630022011014)

转基因新品种培育重大专项(008ZX08012-04)

海南省重点科技项目(90107)

详细信息
    第一作者:

    黄启星(1981-),男,广东南雄人,中国热带农业科学院橡胶研究所助理研究员,博士.

    通信作者:

    邹智(1982-),男,助理研究员,硕士.研究方向:植物抗逆生物学.E-mail:zouzhi2008@126.com

  • 中图分类号: S565.6

In silico Identification and Bioinformatic Analysis of Castor Bean WRKY14 Gene

  • 摘要: 基于已公布的蓖麻基因组序列,利用电子克隆技术纠正了拼接错误的WRKY基因序列,获得蓖麻WRKY14基因信息。结果表明:该基因含有3个内含子,编码318个氨基酸的多肽,理论相对分子质量为35.49×103,等电点为8.64,总平均亲水性为-0.803,不稳定系数为46.88,核定位,属于不稳定的亲水性核定位蛋白;该蛋白含有1个WRKY结构域,其基序为WRKYGQK_X_13_C_X_5_C_X_23_H_X_1_H_,保守内含子位于199位的K和200位的V之间,可归为Ⅱ大类a亚类;RcWRKY14的启动子区含有多种激素和胁迫应答相关元件RcWRKY14在叶片、花、胚乳和种子中都有表达,其中在花中的表达量最高,种子和叶片中次之,胚乳中最低。
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    出版历程
    • 收稿日期:  2012-09-26

    蓖麻WRKY14基因的鉴别与信息分析

    doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2012.04.005
      基金项目:

      海南省自然科学基金(312026)

      中国热带农业科学院橡胶研究所基本科研业务费专项(1630022011014)

      转基因新品种培育重大专项(008ZX08012-04)

      海南省重点科技项目(90107)

      作者简介:

      黄启星(1981-),男,广东南雄人,中国热带农业科学院橡胶研究所助理研究员,博士.

      通讯作者: 邹智(1982-),男,助理研究员,硕士.研究方向:植物抗逆生物学.E-mail:zouzhi2008@126.com
    • 中图分类号: S565.6

    摘要: 基于已公布的蓖麻基因组序列,利用电子克隆技术纠正了拼接错误的WRKY基因序列,获得蓖麻WRKY14基因信息。结果表明:该基因含有3个内含子,编码318个氨基酸的多肽,理论相对分子质量为35.49×103,等电点为8.64,总平均亲水性为-0.803,不稳定系数为46.88,核定位,属于不稳定的亲水性核定位蛋白;该蛋白含有1个WRKY结构域,其基序为WRKYGQK_X_13_C_X_5_C_X_23_H_X_1_H_,保守内含子位于199位的K和200位的V之间,可归为Ⅱ大类a亚类;RcWRKY14的启动子区含有多种激素和胁迫应答相关元件RcWRKY14在叶片、花、胚乳和种子中都有表达,其中在花中的表达量最高,种子和叶片中次之,胚乳中最低。

    English Abstract

    黄启星, 郭安平, 杨礼富, 邹智. 蓖麻WRKY14基因的鉴别与信息分析[J]. 热带生物学报, 2012, 3(4): 305-313. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2012.04.005
    引用本文: 黄启星, 郭安平, 杨礼富, 邹智. 蓖麻WRKY14基因的鉴别与信息分析[J]. 热带生物学报, 2012, 3(4): 305-313. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2012.04.005
    HUANG Qixing, GUO Anping, YANG Lifu, ZOU Zhi. In silico Identification and Bioinformatic Analysis of Castor Bean WRKY14 Gene[J]. Journal of Tropical Biology, 2012, 3(4): 305-313. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2012.04.005
    Citation: HUANG Qixing, GUO Anping, YANG Lifu, ZOU Zhi. In silico Identification and Bioinformatic Analysis of Castor Bean WRKY14 Gene[J]. Journal of Tropical Biology, 2012, 3(4): 305-313. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2012.04.005
    参考文献 (33)

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