木薯25个WRKY家族转录因子在生物胁迫下的表达分析

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木薯25个WRKY家族转录因子在生物胁迫下的表达分析

李可, 熊茜, 肖晓蓉, 李玉敏, 牛晓磊, 李春霞, 陈银华

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李可, 熊茜, 肖晓蓉, 李玉敏, 牛晓磊, 李春霞, 陈银华. 木薯25个WRKY家族转录因子在生物胁迫下的表达分析[J]. 热带生物学报, 2017, 8(1): 14-21,28. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2017.01.003

引用本文:

李可, 熊茜, 肖晓蓉, 李玉敏, 牛晓磊, 李春霞, 陈银华. 木薯25个WRKY家族转录因子在生物胁迫下的表达分析[J]. 热带生物学报, 2017, 8(1): 14-21,28. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2017.01.003

LI Ke, XIONG Xi, XIAO Xiaorong, LI Yumin, NIU Xiaolei, LI Chunxia, CHEN Yinhua. Expression Analysis of 25 WRKY Transcription Factors in Cassava under Biotic Stresses[J]. Journal of Tropical Biology, 2017, 8(1): 14-21,28. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2017.01.003

Citation:

LI Ke, XIONG Xi, XIAO Xiaorong, LI Yumin, NIU Xiaolei, LI Chunxia, CHEN Yinhua. Expression Analysis of 25 WRKY Transcription Factors in Cassava under Biotic Stresses[J]. Journal of Tropical Biology, 2017, 8(1): 14-21,28. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2017.01.003

木薯25个WRKY家族转录因子在生物胁迫下的表达分析

doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2017.01.003

海南大学海南省热带生物资源利用重点实验室/热带农林学院, 海口 570228

基金项目:

国家自然科学基金(31260345,31560497)

第一作者:
李可(1993-),女,海南大学农学院2014级硕士研究生.E-mail:18976325180@163.com

通信作者:
李春霞(1980-),女,副教授.研究方向:植物病原菌致病分子机理.E-mail:chun_xia_li@126.com

中图分类号: S533

Expression Analysis of 25 WRKY Transcription Factors in Cassava under Biotic Stresses

Hainan Key Laboratory for Sustainable Utilization of Tropical Bioresources, Hainan University/College of Agronomy, Hainan University, Haikou, Hainan 570228, china

摘要: 根据拟南芥和水稻的WRKY基因和木薯基因组序列,利用生物信息学方法预测木薯Me WRKY转录因子家族成员,并对其进行系统进化关系和保守结构域的分析。通过病原菌接种处理,分析不同Me WRKY转录因子的表达差异。结果显示,木薯共编码25个与抗病相关WRKY蛋白,在病原菌胁迫条件下,其中16个Me WRKY基因的表达受到显著影响,表明这些WRKY蛋白可能参与木薯的防御应答反应。
- 木薯 /
- WRKY转录因子 /
- 表达模式
Abstract: WRKY family is one of the largest families of transcription factors in higher plants. The WRKY transcription factors play a central role in signal networks and plant growth. The WRKY transcription factors have been extensively studied in response to biotic stresses in model plants,but little information about their roles in cassava is available. According to the WRKY sequences of Arabidopsis and rice,and cassava genome sequences,25 WRKY genes in cassava were predicted and analyzed including their phylogenetic relationships and conserved domains. Expression profiles of these genes in response to pathogen were analyzed by quantitative PCR. The results showed that the 25 identified Me WRKY genes in cassava had the conserved WRKY domain and zinc-finger structure and had distinct expression patterns in response to pathogen infection,out of which 16 were significantly up-or down-regulated,implying that these members might participate in defense response to biotic stresses in cassava.
- Cassava /
- WRKY transcriptional factor /
- expression pattern

[1]	郑永清, 李开绵, 李伯松, 马旭东, 陈松笔. 木薯品种不同收获期块根淀粉积累规律分析 . 热带生物学报, 2025, 16(2): 172-180. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.20240051
[2]	彭晓莹, 金海峰, 闫文乾, 咸利民, 席羽, 张宝琴. 三叶草斑潜蝇过氧化氢酶基因的克隆、表达及其对温度的响应 . 热带生物学报, 2025, 16(): 1-10. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.20240033
[3]	胥梦洋, 刘钰, 王海博, 徐文鑫, 张秀丽, 冯顺, 李茂富. 油梨乙酰辅酶A羧化酶基因家族鉴定及表达分析 . 热带生物学报, 2025, 16(): 1-11. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.20250037
[4]	唐璐芝, 吴竞远, 陈元来, 朱彬彬, 赵惠萍. 木薯RXam2的原核蛋白表达及抗病功能分析 . 热带生物学报, 2025, 16(): 1-9. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.20240147
[5]	张子赫, 郑蔺玲, 李可, 陈银华, 高豫. 木薯ERF基因家族Ⅶ亚族的鉴定与表达分析 . 热带生物学报, 2025, 16(): 1-15. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.20250035
[6]	吴竞远, 唐璐芝, 朱彬彬, 赵惠萍. 木薯生长素响应因子MeARF的克隆及互作蛋白的筛选 . 热带生物学报, 2025, 16(): 1-9. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.20240148
[7]	张圆雷, 张宏图, 徐子寅, 李淑霞, 于晓玲, 赵平娟, 李文彬, 张秀春, 于晓惠, 阮孟斌. 干旱模式下木薯气孔密度及生理指标的比较分析 . 热带生物学报, 2025, 16(2): 163-171. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.20240056
[8]	胡文成, 朱寿松, 王艺璇, 阳达, 陈银华. 木薯茉莉酸氧化酶JOXs基因家族的鉴定及表达模式分析 . 热带生物学报, 2025, 16(): 1-10. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.20240199
[9]	贾素行, 朱寿松, 符仁稳, 李春霞, 陈银华. 木薯MePPD3基因的克隆及功能分析 . 热带生物学报, 2024, 15(1): 10-18. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.20230035
[10]	张逸杰, 王思琦, 陆小静, 宋记明, 王睿, 曹敏, 张瑞, 王红刚, 吴金山. 木薯块根灰分和水分近红外光谱预测模型的构建与优化 . 热带生物学报, 2024, 15(3): 259-267. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.20230031
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[17]	唐枝娟, 朱寿松, 于心怡, 赵锐, 牛晓磊, 陈银华, 耿梦婷. 木薯MeRbohE基因的克隆及表达分析 . 热带生物学报, 2018, 9(2): 170-175. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2018.02.007
[18]	周亚秋, 孙琪, 陈霞, 赖杭桂, 陈松笔, 叶剑秋. 木薯花粉原位萌发及柱头可授性观察 . 热带生物学报, 2017, 8(1): 52-57. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2017.01.009
[19]	张长正, 刘进平, 时涛, 李超萍, 陈奕鹏, 黄贵修. 木薯地毯草黄单胞菌转化子T-DNA插入模式分析 . 热带生物学报, 2016, 7(2): 246-252. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2016.02.018
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木薯25个WRKY家族转录因子在生物胁迫下的表达分析

doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2017.01.003

海南大学海南省热带生物资源利用重点实验室/热带农林学院, 海口 570228

基金项目:

国家自然科学基金(31260345,31560497)

作者简介:
李可(1993-),女,海南大学农学院2014级硕士研究生.E-mail:18976325180@163.com

通讯作者: 李春霞(1980-),女,副教授.研究方向:植物病原菌致病分子机理.E-mail:chun_xia_li@126.com

收稿日期: 2016-12-07
修回日期: 2017-01-29

中图分类号: S533

关键词:

WRKY转录因子 /

摘要: 根据拟南芥和水稻的WRKY基因和木薯基因组序列,利用生物信息学方法预测木薯Me WRKY转录因子家族成员,并对其进行系统进化关系和保守结构域的分析。通过病原菌接种处理,分析不同Me WRKY转录因子的表达差异。结果显示,木薯共编码25个与抗病相关WRKY蛋白,在病原菌胁迫条件下,其中16个Me WRKY基因的表达受到显著影响,表明这些WRKY蛋白可能参与木薯的防御应答反应。

English Abstract

李可, 熊茜, 肖晓蓉, 李玉敏, 牛晓磊, 李春霞, 陈银华. 木薯25个WRKY家族转录因子在生物胁迫下的表达分析[J]. 热带生物学报, 2017, 8(1): 14-21,28. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2017.01.003

引用本文:

李可, 熊茜, 肖晓蓉, 李玉敏, 牛晓磊, 李春霞, 陈银华. 木薯25个WRKY家族转录因子在生物胁迫下的表达分析[J]. 热带生物学报, 2017, 8(1): 14-21,28. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2017.01.003

LI Ke, XIONG Xi, XIAO Xiaorong, LI Yumin, NIU Xiaolei, LI Chunxia, CHEN Yinhua. Expression Analysis of 25 WRKY Transcription Factors in Cassava under Biotic Stresses[J]. Journal of Tropical Biology, 2017, 8(1): 14-21,28. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2017.01.003

Citation:

LI Ke, XIONG Xi, XIAO Xiaorong, LI Yumin, NIU Xiaolei, LI Chunxia, CHEN Yinhua. Expression Analysis of 25 WRKY Transcription Factors in Cassava under Biotic Stresses[J]. Journal of Tropical Biology, 2017, 8(1): 14-21,28. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2017.01.003

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