巢蕨基因组DNA提取与RAPD反应体系优化

王雪兵; 于旭东; 朱会军; 吴繁花; 黄小凤; 胡新文

doi:10.15886/j.cnki.rdswxb.2012.04.019

巢蕨基因组DNA提取与RAPD反应体系优化

doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2012.04.019

王雪兵^1,4,
于旭东^1,3,
朱会军^1,2,
吴繁花¹,
黄小凤⁴,
胡新文^1, ,

1. 海南大学农学院, 海南海口 570228;
2. 贵州大学精细化工研究开发中心/绿色农药与农业生物工程国家重点实验室培育基地/教育部重点实验室, 贵州贵阳 550000;
3. 海南大学热带作物种质资源保护与开发利用教育部重点实验室, 海南海口 570228;
4. 东莞植物园, 广东东莞 523086

基金项目:

国家自然科学基金项目(31060123,30760025)

东莞市高等院校、科研机构科技计划项目(2011108102039,2012108102054)

海南省自然科学基金项目(311021,312056)

海南大学教育教学研究课题立项项目(hdjy0920)

详细信息

第一作者:
王雪兵(1985-),男,四川广安人,东莞植物园研究实习员,硕士.

通信作者:
胡新文,男,教授.E-mail:hqx888999@163.com

中图分类号: Q949.36

Extraction of Genomic DNA of Neottopteris nidus and Optimization of the RAPD Reaction System

1. College of Agronomy, Hainan University, Haikou 570228, China;
2. Research and Development Center for Fine Chemicals/State Key Laboratory Breeding Base for Green Pesticide and Agricultural Bioengineering/Ministry of Education Key Laboratory, Guiyang, Guizhou 550000, China;
3. Ministry of Education Key Laboratory for Conservation and Utilization of Tropical Crops Germplasm Resources, Haikou 570228, China;
4. Dongguan Botanic Garden, Dongguan, Guangdong 523086, China

摘要: 以新鲜幼嫩的巢蕨叶片为材料,优化了巢蕨叶片基因组DNA的提取方法与RAPD反应体系。结果表明,利用改进的CTAB方法,能够提取出高质量的巢蕨基因组DNA;优化的巢蕨RAPD的最终反应体系(25μL)为:模板DNA(50mg.L^-1)1.5μL,引物(1mmol.L^-1)1.5μL,2×EasyTaqPCRSuperMiX12.5μL。
- 巢蕨 Neottopteris nidus /
- DNA 提取 /
- RAPD /
- 分子标记
Abstract: In order to study the genitic diversity and genetic structure of Bird’s nest fern（Neottopteris nidus） populations,fresh tender fronds of the Bird’s nest fern were collected and resorted to genomic DNA extraction through optimized RAPD reaction system by using different concentrations of CTAB and NaCl,different volumes of template DNA and primer.The improved CTAB DNA extraction method was the best to extract the genomic DNA of the fronds of the Bird’s nest fern.The optimum reaction system（25 μL） for RAPD amplification of the Bird’s nest fern DNA was listed as follows:The template DNA（50 mg·L^-1）1.5μL;the primer（1 mmol·L^-1） 1.5 μL;2×EasyTaq PCR SuperMiX 12.5 μL.
- Bird’s nest fern /
- Neottopteris nidus /
- Asplenium nidus /
- extration of genomic DNA

[1]	HOLTTUM R E.Asplenium Linn.sect.Thamnopteris Presl[J].Gardens'Bulletin,Singapore,1974,27:143-154.
[2]	BENZING D H.Vascular Epiphytes:General Biology and Related Biota[M].Cambridge:University of Cambridge Press,1990:354.
[3]	HUANG T C.Flora of Taiwan[M].Taipei:Editorial Committee of the Flora of Taiwan,1994:648.
[4]	ELLWOOD M D F,FOSTER W A.Doubling the estimate of invertebrate biomass in a rainforest canopy[J].Nature,2004,429:549-551.
[5]	王雪兵,黄勇,杨琪,等.巢蕨基质的形成及其对雨林生态的影响[J].仙湖,2010,9(3/4):66 -68.
[6]	王艇,苏应娟.中国特有极度濒危植物猪血木的保护遗传学研究[J].中山大学学报:自然科学版,2005,44(1):68-71.
[7]	李建辉,金则新,李钧敏.濒危植物长叶榧群体遗传多样性的RAPD分析应用[J].应用生态学报,2007,18(12):2661-2667.
[8]	刘建锋,肖文发.濒危植物崖柏遗传多样性的RAPD分析[J].江西农业大学学报,2008,30(1):68-72.
[9]	王艇,苏应娟,欧阳蒲月,等.利用RAPD标记分析濒危植物白豆杉种群的遗传结构[J].生态学报,2006,26(7):2313-2316.
[10]	张颖娟,王玉山.濒危灌木长叶红砂遗传多样性RAPD的分析[J].生物学杂志,2008,27(2):157-161.
[11]	DOYLE J J,DOYLE J L.A rapid DNA isolation procedure for small quantities of fresh leaf tissue[J].Phytochem Bul,1987,19:11-15.
[12]	邹喻苹,葛颂,王晓东.系统与进化植物学中的分子标记[M].北京:科学出版社,2001:128.
[13]	周延清,杨清香,张改娜.生物遗传标记与应用[M].北京:化学工业出版社,2008:28-93.
[14]	付再萍.狗脊蕨(Woodwardia japonica(L.f.)Sm)基因组DNA提取与随机扩增多态性DNA(RAPD)的优化[J].杭州师范学院学报:自然科学版,2007,6(2):129-132.
[15]	沈洁,罗安才.提取蕨类植物DNA方法比较[J].安徽农业科学,2010,38(4):1738-1740.
[16]	陈进明,王青峰.珍稀濒危蕨类植物东方水韭的遗传多样性[J].武汉植物学研究,2006,24(6):569-573.
[17]	陈进明,刘星,王青峰.中国珍稀濒危特有蕨类植物——云贵水韭的遗传多样性[J].武汉大学学报:理学版,2005,51(6):767-770.
[18]	陈进明,王晶苑,刘星.中华水韭遗传多样性的RAPD分析[J].生物多样性,2004(12):348-353.
[19]	李先进,彭正松,张正英,等.四种药用蕨类DNA提取的比较研究[J].绵阳师范学院学报,2008,27(8):67-69.
[20]	AITCHITT M,AINSWORTH C C,THANGAVELU M.A rapid and efficient method for the extraction of total DNA from mature leaves of the date palm(Phoenix dactylifera L.)[J].Plant Molecular Biology Reporter,1993,11(4):317-319.
[21]	MAGUIRE T L,COLLINS G G,SEDGLEY M.A modifies CTAB DNA extraction procedure for plants belong to the family Proteaceae[J].Plant Molecular Biology Report,1994,12(2):106-109.
[22]	钱韦,葛颂,洪德元.采用RAPD和ISSR标记探讨中国疣粒野生稻的遗传多样性[J].植物学报,2000,42(7):741-750.

[1]	杨敏, 黄婧, 曹毓杰, 李东栋, 郑育声. 基于转录组的蛇皮果雌雄株差异基因的筛选和性别鉴定 . 热带生物学报, 2025, 16(1): 13-20. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.20240110
[2]	刘良旺, 臧彧伟, 冉方芳, 闵义, 王大勇. FtsZ靶向多肽抑制剂的分子对接、分子动力学分析及抗菌活性评价 . 热带生物学报, 2023, 14(3): 269-278. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2023.03.004
[3]	王宇航, 孟秀利, 黄山春, 林兆威, 宋薇薇, 唐庆华, 覃伟权. 双条拂粉蚧基因组DNA提取方法的比较和优化 . 热带生物学报, 2023, 14(6): 636-641. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.20220085
[4]	蔡颖, 段继煜, 朱思奇, 任明迅, 唐亮. 基于SSR标记的无翼坡垒遗传多样性研究 . 热带生物学报, 2022, 13(2): 127-135. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2022.02.004
[5]	陈婉姨, 李新佳, 罗素兰, 长孙东亭. 信号芋螺基因组DNA提取方法的优化 . 热带生物学报, 2020, 11(2): 238-244, 250. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2020.00.015
[6]	陈弟, 李可增, 吴琼, 何应对, 殷晓敏. 火龙果根际土壤微生物2种DNA提取方法的比较 . 热带生物学报, 2019, 10(2): 184-189. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2019.02.014
[7]	潘英文, 张凌, 王安石, 李佳潼, 谢添伟, 陈施明, 刘福秀, 林明光. 濒危兰科植物DNA的提取方法 . 热带生物学报, 2019, 10(1): 94-98. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2019.01.016
[8]	刘秋婷, 田雨顺, 云龙, 罗鹏, 胡超群. 噬菌体基因组DNA快速提取方法 . 热带生物学报, 2017, 8(2): 232-235. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2017.02.018
[9]	战欣, 陈琼, 顾志峰, 石耀华, 王爱民. 马氏珠母贝贝壳珍珠质层厚度性状与微卫星标记的相关性分析 . 热带生物学报, 2016, 7(3): 290-295. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2016.03.002
[10]	叶琳雄, 符清流, 胡荣, 李加慧. 粉蚧科无损形态基因组DNA提取技术 . 热带生物学报, 2016, 7(4): 497-499. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2016.04.015
[11]	郑云柯, 胡翔宇, 宋希强, 王健. 石斛属植物基因组DNA提取方法的对比 . 热带生物学报, 2015, 6(2): 168-172. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2015.02.011
[12]	赖茂良, 孙仁毅, 程江波, 聂风琴, 邢诒旺, 林道哲, 符文英. 海巴戟DNA提取方法及SRAP分子标记聚类分析 . 热带生物学报, 2014, 5(4): 368-373. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2014.04.011
[13]	赵峰, 刘国民, 李娟玲, 张其文, 符伟, 张恩华. 女贞RAPD-PCR实验条件的优化 . 热带生物学报, 2014, 5(4): 374-380. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2014.04.012
[14]	李德军, 夏志辉, 李晓兵, 朱立煌. OsRRM1基因标记开发及生物信息学分析 . 热带生物学报, 2013, 4(4): 308-312. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2013.04.002
[15]	翟丽艳, 李娟玲, 刘国民, 谢俊, 罗轶奇, 成善汉, 潘学峰. 与苦丁茶炭疽病抗性基因连锁的RAPD标记 . 热带生物学报, 2013, 4(1): 25-30. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2013.01.006
[16]	周亚东, 吴繁花, 徐诗涛, 易显良, 赵原森, 于旭东. 荫蔽度对巢蕨生长的影响 . 热带生物学报, 2012, 3(4): 375-378. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2012.04.018
[17]	彭军, 曾凡云, 龙海波, 黄俊生, 郭建荣. 热带果树基因组DNA提取方法的改良及Southern blot分析 . 热带生物学报, 2012, 3(3): 252-257. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2012.03.014
[18]	罗轶奇, 李娟玲, 刘国民, 成善汉, 潘学峰, 翟丽艳. 与苦丁茶冬青雄性性状连锁的RAPD标记 . 热带生物学报, 2012, 3(3): 208-215. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2012.03.008
[19]	王晓音, 赵婷婷, 冯翠莲, 张树珍. DNA提取方法对转基因甘蔗PCR检测的影响 . 热带生物学报, 2011, 2(2): 138-142. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2011.02.011
[20]	高建明, 代真真, 江程记, 张世清, 陈河龙, 郑金龙, 刘巧莲, 易克贤. 芦笋DNA提取方法的比较研究 . 热带生物学报, 2011, 2(2): 153-156. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2011.02.014

点击查看大图

计量

文章访问数: 0
HTML全文浏览量: 0
PDF下载量: 0
被引次数: 0

姓名
邮箱
手机号码
标题
留言内容
验证码

留言板

巢蕨基因组DNA提取与RAPD反应体系优化

doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2012.04.019

第一作者:
王雪兵(1985-),男,四川广安人,东莞植物园研究实习员,硕士.

通信作者:
胡新文,男,教授.E-mail:hqx888999@163.com

Extraction of Genomic DNA of Neottopteris nidus and Optimization of the RAPD Reaction System

计量

巢蕨基因组DNA提取与RAPD反应体系优化

doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2012.04.019

作者简介:
王雪兵(1985-),男,四川广安人,东莞植物园研究实习员,硕士.

通讯作者: 胡新文,男,教授.E-mail:hqx888999@163.com

English Abstract

Extraction of Genomic DNA of Neottopteris nidus and Optimization of the RAPD Reaction System

全文HTML

目录

留言板

巢蕨基因组DNA提取与RAPD反应体系优化

doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2012.04.019

第一作者: 王雪兵(1985-),男,四川广安人,东莞植物园研究实习员,硕士.

通信作者: 胡新文,男,教授.E-mail:hqx888999@163.com

Extraction of Genomic DNA of Neottopteris nidus and Optimization of the RAPD Reaction System

计量

出版历程

巢蕨基因组DNA提取与RAPD反应体系优化

doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2012.04.019

作者简介: 王雪兵(1985-),男,四川广安人,东莞植物园研究实习员,硕士.

通讯作者: 胡新文,男,教授.E-mail:hqx888999@163.com

English Abstract

Extraction of Genomic DNA of Neottopteris nidus and Optimization of the RAPD Reaction System

全文HTML

目录

第一作者:
王雪兵(1985-),男,四川广安人,东莞植物园研究实习员,硕士.

通信作者:
胡新文,男,教授.E-mail:hqx888999@163.com

作者简介:
王雪兵(1985-),男,四川广安人,东莞植物园研究实习员,硕士.