濒危兰科植物DNA的提取方法

潘英文; 张凌; 王安石; 李佳潼; 谢添伟; 陈施明; 刘福秀; 林明光

doi:10.15886/j.cnki.rdswxb.2019.01.016

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濒危兰科植物DNA的提取方法

潘英文, 张凌, 王安石, 李佳潼, 谢添伟, 陈施明, 刘福秀, 林明光

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潘英文, 张凌, 王安石, 李佳潼, 谢添伟, 陈施明, 刘福秀, 林明光. 濒危兰科植物DNA的提取方法[J]. 热带生物学报, 2019, 10(1): 94-98. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2019.01.016

引用本文:

PAN Yingwen, ZHANG Ling, WANG Anshi, LI Jiatong, XIE Tianwei, CHEN Shiming, LIU Fuxiu, LIN Mingguang. Extraction of Genome DNA from Endangered Orchid Plants[J]. Journal of Tropical Biology, 2019, 10(1): 94-98. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2019.01.016

Citation:

PAN Yingwen, ZHANG Ling, WANG Anshi, LI Jiatong, XIE Tianwei, CHEN Shiming, LIU Fuxiu, LIN Mingguang. Extraction of Genome DNA from Endangered Orchid Plants[J]. Journal of Tropical Biology, 2019, 10(1): 94-98. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2019.01.016

濒危兰科植物DNA的提取方法

doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2019.01.016

海南出入境检验检疫局热带植物隔离检疫中心, 海口 570311

基金项目:

海南省自然科学基金项目(317293)

国家质量监督检验检疫总局科技计划项目(2016IK095)

详细信息

第一作者:
潘英文(1981-),男,高级农艺师.研究方向:植物检疫与生物技术.E-mail:pyw910@163.com

通信作者:
林明光(1962-),男,研究员,博士.研究方向:植物检疫与热带花卉研究.E-mail:linmingguang@yahoo.com

中图分类号: S682.31;Q52

Extraction of Genome DNA from Endangered Orchid Plants

Post-Entry Quarantine Station for Tropical Plants, Hainan Entry-Exit Inspection and Quarantine Bureau, Haikou, Hainan 570311, China

摘要: 濒危兰科植物组织富含多糖和多酚类物质,提取高质量的DNA较困难。为优化濒危兰科植物基因组DNA提取方法,采用改良CTAB法、改良SDS法和试剂盒法对多种濒危兰科植物基因组DNA进行提取,对获得的DNA质量、浓度和纯度进行比较。结果表明,用改良CTAB法和试剂盒法可有效去除多糖类和多酚类物质的干扰,DNA提取效果较理想,改良SDS法较差;CTAB法获得的DNA浓度高于试剂盒法,且后续PCR扩增效果也优于试剂盒法。
- 濒危兰科 /
- 基因组DNA /
- 提取方法
Abstract: Endangered Orchid plants contain polysaccharides and polyphenols, and it is difficult to extract high-quality DNA from these plants. Three extraction methods, i.e. improved CTAB method, improved SDS method and Kit method, were used to extract genomic DNA of endangered Orchid plants（Dendrobium nobile, Paphiopedilum appletonianum, Cymbidium goeringii var. goeringii, Vanda pumila, Renanthera imschootiana and Phalaenopsis equestris）, and the extracted DNA was compared in quality, concentration and purity to optimize DNA extraction methods for these orchid plants. The results showed that the improved CTAB method and Kit method removed effectively polysaccharides and polyphenols from the Orchidaceae plants and had a higher positive effect on DNA extraction, while the improved SDS method was poorest in DNA extraction. The DNA extracted by the improved CTAB method was higher in concentration than that by the Kit method, and its follow-up PCR amplification was better as well.
- Endangered Orchidaceae /
- genomic DNA /
- extraction methods

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濒危兰科植物DNA的提取方法

doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2019.01.016

海南出入境检验检疫局热带植物隔离检疫中心, 海口 570311

基金项目:

海南省自然科学基金项目(317293)

国家质量监督检验检疫总局科技计划项目(2016IK095)

作者简介:
潘英文(1981-),男,高级农艺师.研究方向:植物检疫与生物技术.E-mail:pyw910@163.com

通讯作者: 林明光(1962-),男,研究员,博士.研究方向:植物检疫与热带花卉研究.E-mail:linmingguang@yahoo.com

收稿日期: 2018-12-05
修回日期: 2019-01-12

中图分类号: S682.31;Q52

关键词:

濒危兰科 /

基因组DNA /

提取方法

摘要: 濒危兰科植物组织富含多糖和多酚类物质,提取高质量的DNA较困难。为优化濒危兰科植物基因组DNA提取方法,采用改良CTAB法、改良SDS法和试剂盒法对多种濒危兰科植物基因组DNA进行提取,对获得的DNA质量、浓度和纯度进行比较。结果表明,用改良CTAB法和试剂盒法可有效去除多糖类和多酚类物质的干扰,DNA提取效果较理想,改良SDS法较差;CTAB法获得的DNA浓度高于试剂盒法,且后续PCR扩增效果也优于试剂盒法。