石斛属植物基因组DNA提取方法的对比

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石斛属植物基因组DNA提取方法的对比

郑云柯, 胡翔宇, 宋希强, 王健

文章导航 > 热带生物学报 > 2015 > 6(2): 168-172

郑云柯, 胡翔宇, 宋希强, 王健. 石斛属植物基因组DNA提取方法的对比[J]. 热带生物学报, 2015, 6(2): 168-172. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2015.02.011

引用本文:

郑云柯, 胡翔宇, 宋希强, 王健. 石斛属植物基因组DNA提取方法的对比[J]. 热带生物学报, 2015, 6(2): 168-172. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2015.02.011

ZHENG Yunke, HU Xiangyu, Song Xiqiang, WANG Jian. Optimized Extraction Method for Genomic DNA from Dendrobium Species（ Orchidaceae）[J]. Journal of Tropical Biology, 2015, 6(2): 168-172. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2015.02.011

Citation:

ZHENG Yunke, HU Xiangyu, Song Xiqiang, WANG Jian. Optimized Extraction Method for Genomic DNA from Dendrobium Species（ Orchidaceae）[J]. Journal of Tropical Biology, 2015, 6(2): 168-172. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2015.02.011

石斛属植物基因组DNA提取方法的对比

doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2015.02.011

海南大学园艺园林学院/热带作物种质资源保护与开发利用教育部重点实验室, 海南海口 570228

基金项目:

国家自然科学基金(31160178)

国家农业公益性行业科研专项(201303117)

海南省应用技术研发与示范推广专项(ZDXM2014129)

第一作者:
郑云柯(1990-),男,2012级海南大学园艺园林学院硕士研究生.E-mail:309196177@qq.com

通信作者:
宋希强(1972-),男,教授,研究方向:生态学.E-mail:songstrong@hainu.edu.cn

中图分类号: Q52

Optimized Extraction Method for Genomic DNA from Dendrobium Species（ Orchidaceae）

College of Horticulture and Landscape Architecture Hainan University/Ministry of Education Key Laboratory of Protection and Developmental Utilization of Tropical Crop Germplasm Resources, Haikou 570228, China

摘要: 笔者使用6种DNA提取方法提取7种含糖量较高的石斛属植物的DNA,比较不同方法提取DNA的效果,结果表明:改良PEX法和改良CTAB法对含有丰富多糖和多酚类的石斛属植物的DNA提取效果较好。改良PEX法与其他5种方法对比,可以更好地去除多糖类和多酚物质的干扰,能够满足后续的分子生物学实验的要求。改良CTAB法和改良SDS法与CTAB法和SDS法相比,可获得较高的DNA产率,并且可以较好地去除多糖类杂质的干扰。
- 石斛 /
- 含糖量 /
- DNA提取方法 /
- 多酚
Abstract: Extracting high quality DNA is very important for molecular experiments. Dendrobium species under the family Orchidaceae contain more sucrose and polyphenol substances and,it is hence difficult to extract high quality DNA from Dendrobium species. Six methods were used to extract DNA from 7 Dendrobium species,and compared to develop an optimal extracting method for DNA. Both PEX-improved method and CTAB-improved method had positive effect on DNA extraction from Dendrobium spp. which contained more polysaccharides and polyphenols. Compared with other 5 methods,the PEX-improved method removed higher content of polysaccharides and phenolics from Dendrobium spp and met the need of molecular biology experiments. The CTAB-improved method and the SDS-improved method removed more content of polysaccharides,and produced higher yield DNA samples as compared with the CTAB method and the SDS method.
- Dendrobium /
- sucrose content /
- DNA extraction method /
- polyphenols

[1]	刘辉曜, 罗天雄, 王玲, 杨福孙. 金钗石斛菌根真菌和内生细菌自然共生关系探究 . 热带生物学报, 2025, 16(2): 243-253. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.20240098
[2]	孟明民, 徐鹏舒, 李如雯, 胡碧煌, 刘中强. 利用颜色反应鉴别儿茶酚及其保护类型 . 热带生物学报, 2024, 15(2): 232-240. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.20220091
[3]	李香凝, 赵瑾, 李东栋, 郑育声. 槟榔愈伤中槟榔碱的提取方法 . 热带生物学报, 2024, 15(1): 36-41. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.20230038
[4]	吉南焕, 侯耀辉, 王开济, 赖杭桂, 庞真真. 不同施肥模式对越南油茶饼的总多酚含量和抗氧化活性的影响 . 热带生物学报, 2024, 15(2): 165-170. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.20220045
[5]	蔡波, 赵晨阳, 李芬, 陈施明, 贾静, 刘福秀, 吴少英. DNA条形码技术在快速鉴定石斛兰斑翅康瘿蚊（Contarinia maculipennis Felt）上的应用 . 热带生物学报, 2024, 15(4): 493-498. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.20230114
[6]	王宇航, 孟秀利, 黄山春, 林兆威, 宋薇薇, 唐庆华, 覃伟权. 双条拂粉蚧基因组DNA提取方法的比较和优化 . 热带生物学报, 2023, 14(6): 636-641. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.20220085
[7]	王洁, 王蓓蓓, 尚方剑, 苏兰茜, 赵少官, 洪珊, 赵青云. 香草兰酚酸类自毒物质降解菌的筛选和鉴定及其抑菌效果 . 热带生物学报, 2022, 13(6): 595-604. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2022.06.009
[8]	陈婉姨, 李新佳, 罗素兰, 长孙东亭. 信号芋螺基因组DNA提取方法的优化 . 热带生物学报, 2020, 11(2): 238-244, 250. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2020.00.015
[9]	陈弟, 李可增, 吴琼, 何应对, 殷晓敏. 火龙果根际土壤微生物2种DNA提取方法的比较 . 热带生物学报, 2019, 10(2): 184-189. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2019.02.014
[10]	潘英文, 张凌, 王安石, 李佳潼, 谢添伟, 陈施明, 刘福秀, 林明光. 濒危兰科植物DNA的提取方法 . 热带生物学报, 2019, 10(1): 94-98. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2019.01.016
[11]	孔伟浩, 高薇珊, 范咏梅. 多杀菌素和乙基多杀菌素对斑马鱼胚胎发育的影响 . 热带生物学报, 2018, 9(3): 267-273,338. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2018.03.001
[12]	陈丽璇, 陈淳, 陈菲, 柯合作. 外源无机硒肥对铁皮石斛生长及多糖含量的影响 . 热带生物学报, 2018, 9(4): 423-426. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2018.04.009
[13]	王童欣, 戚山江, 宋希强, 孟千万, 于旭东. 华石斛种群动态与繁殖策略的相关性分析 . 热带生物学报, 2018, 9(2): 189-197. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2018.02.010
[14]	刘积光, 李昂, 刘平怀. 3种微藻生物量监测方法的比较 . 热带生物学报, 2018, 9(4): 457-463. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2018.04.015
[15]	魏祯, 曹献英, 陈健, 刘桂华. QuEChERS方法在软体类海产品兽药多残留检测中的应用 . 热带生物学报, 2018, 9(4): 377-387. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2018.04.003
[16]	谢冬惠, 徐静, 李治明, 梁振益. 小叶榕气生根总酚酸和总黄酮含量测定及其抗氧化活性比较 . 热带生物学报, 2016, 7(3): 373-375. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2016.03.017
[17]	侯晓婉, 刘培卫, 孙佩文, 孟慧, 张争. 多年生白木香茎干不同部位总RNA提取方法的改良 . 热带生物学报, 2016, 7(3): 376-380. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2016.03.018
[18]	叶琳雄, 符清流, 胡荣, 李加慧. 粉蚧科无损形态基因组DNA提取技术 . 热带生物学报, 2016, 7(4): 497-499. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2016.04.015
[19]	范玉龙, 姜达, 李明容, 黄惜, 夏志辉. 适合于高通量测序的槟榔总RNA的提取方法 . 热带生物学报, 2015, 6(1): 87-90. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2015.01.013
[20]	李骜, 宋希强. 海南岛华石斛根部可培养的共生细菌的多样性 . 热带生物学报, 2015, 6(3): 279-284. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2015.03.010

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石斛属植物基因组DNA提取方法的对比

doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2015.02.011

海南大学园艺园林学院/热带作物种质资源保护与开发利用教育部重点实验室, 海南海口 570228

基金项目:

国家自然科学基金(31160178)

国家农业公益性行业科研专项(201303117)

海南省应用技术研发与示范推广专项(ZDXM2014129)

作者简介:
郑云柯(1990-),男,2012级海南大学园艺园林学院硕士研究生.E-mail:309196177@qq.com

通讯作者: 宋希强(1972-),男,教授,研究方向:生态学.E-mail:songstrong@hainu.edu.cn

收稿日期: 2015-04-01

中图分类号: Q52

关键词:

DNA提取方法 /

摘要: 笔者使用6种DNA提取方法提取7种含糖量较高的石斛属植物的DNA,比较不同方法提取DNA的效果,结果表明:改良PEX法和改良CTAB法对含有丰富多糖和多酚类的石斛属植物的DNA提取效果较好。改良PEX法与其他5种方法对比,可以更好地去除多糖类和多酚物质的干扰,能够满足后续的分子生物学实验的要求。改良CTAB法和改良SDS法与CTAB法和SDS法相比,可获得较高的DNA产率,并且可以较好地去除多糖类杂质的干扰。

English Abstract

郑云柯, 胡翔宇, 宋希强, 王健. 石斛属植物基因组DNA提取方法的对比[J]. 热带生物学报, 2015, 6(2): 168-172. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2015.02.011

引用本文:

郑云柯, 胡翔宇, 宋希强, 王健. 石斛属植物基因组DNA提取方法的对比[J]. 热带生物学报, 2015, 6(2): 168-172. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2015.02.011

ZHENG Yunke, HU Xiangyu, Song Xiqiang, WANG Jian. Optimized Extraction Method for Genomic DNA from Dendrobium Species（ Orchidaceae）[J]. Journal of Tropical Biology, 2015, 6(2): 168-172. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2015.02.011

Citation:

ZHENG Yunke, HU Xiangyu, Song Xiqiang, WANG Jian. Optimized Extraction Method for Genomic DNA from Dendrobium Species（ Orchidaceae）[J]. Journal of Tropical Biology, 2015, 6(2): 168-172. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2015.02.011

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