木薯赤霉素途径DELLA蛋白基因克隆及其对干旱胁迫的响应

廖文彬; 彭明

doi:10.15886/j.cnki.rdswxb.2012.04.004

《中国科技核心期刊》数据库收录期刊
《中国学术期刊（光盘版）》全文收录期刊
《中文科技期刊数据库》收录期刊
《美国乌利希国际期刊指南（Ulrichsweb）》数据库收录期刊

高级检索

留言板

尊敬的读者、作者、审稿人, 关于本刊的投稿、审稿、编辑和出版的任何问题, 您可以本页添加留言。我们将尽快给您答复。谢谢您的支持!

姓名
邮箱
手机号码
标题
留言内容
验证码

木薯赤霉素途径DELLA蛋白基因克隆及其对干旱胁迫的响应

廖文彬, 彭明

文章导航 > 热带生物学报 > 2012 > 3(4): 298-304

廖文彬, 彭明. 木薯赤霉素途径DELLA蛋白基因克隆及其对干旱胁迫的响应[J]. 热带生物学报, 2012, 3(4): 298-304. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2012.04.004

引用本文:

廖文彬, 彭明. 木薯赤霉素途径DELLA蛋白基因克隆及其对干旱胁迫的响应[J]. 热带生物学报, 2012, 3(4): 298-304. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2012.04.004

LIAO Wenbin, PENG Ming. Gene Cloning of DELLA Protein from Cassava and Its Expression Patterns Under Drought Stress[J]. Journal of Tropical Biology, 2012, 3(4): 298-304. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2012.04.004

Citation:

LIAO Wenbin, PENG Ming. Gene Cloning of DELLA Protein from Cassava and Its Expression Patterns Under Drought Stress[J]. Journal of Tropical Biology, 2012, 3(4): 298-304. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2012.04.004

木薯赤霉素途径DELLA蛋白基因克隆及其对干旱胁迫的响应

doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2012.04.004

廖文彬,
彭明^,

中国热带农业科学院热带生物技术研究所/农业部热带作物生物学与遗传资源利用重点实验室, 海南海口 571101

基金项目:

国家国际科技合作专项(2013DFA32020)

国家863计划项目资助(2012AA101204-2)

详细信息

第一作者:
廖文彬(1975-),男,湖南邵阳人,中国热带农业科学院热带生物技术研究所副研究员.

通信作者:
彭明.E-mail:mmpeng_2000@yahoo.com

中图分类号: Q344⁺.12

Gene Cloning of DELLA Protein from Cassava and Its Expression Patterns Under Drought Stress

LIAO Wenbin,
PENG Ming^,

Institute of Tropical Bioscience and Biotechnology, Chinese Academy of Tropical Agricultural Sciences;Ministry of Agriculture Key Laboratory for Biology and Genetic Resources of Tropical Crops, Haikou 571101, China

摘要: 赤霉素(GA)信号转导途径是通过DELLA抑制蛋白来调控的。笔者利用拟南芥DELLA蛋白基因序列,通过电子克隆方法首次克隆了1个木薯DELLA蛋白基因,长度为1857bp,具有完整的蛋白编码框的cDNA序列,命名为MeGAI。生物信息学分析显示,该蛋白具有与拟南芥DELLA蛋白一样的保守结构域,如DELLA结构域、VHYNP结构域、POLY(S/T)结构域、核定位信号、VHVID结构域、亮氨酸结构域、GRAS结构域;该基因在干旱胁迫下的表达模式研究结果表明,该基因在干旱胁迫下是下调表达的;GA生物合成重要基因GA20-氧化酶基因在干旱胁迫下的表达模式研究结果表明,两者在干旱胁迫下的表达模式具有良好的相关性,这说明GA途径可能参与木薯抗旱机制。
- 木薯DELLA蛋白 /
- 基因克隆 /
- 生物信息学分析 /
- 干旱胁迫响应
Abstract: The GA signaling pathway is regulated by the DELLA proteins.A cassava nucleotide with high sequence homology to Arabidopsis thaliana GAI（AtGAI） was identified in the JGI database with the NCBI BLAST program.This nucleotide,named MeGAI,has a full length of 1 857 bp and contained genomic coding sequences.Sequence comparisons between the MeGAI sequence and all of DELLA proteins in Arabidopsis indicated that MeGAI also has similar conserved domains to the DELLA proteins of the Arabidopsis,such as DELLA domain,VHYNP domain,POLY（S /T） domain,NLS domain,VHVID domain,leu zipper domain,GRAS domain.All these domains indicted that MeGAI is an ortholog of AtGAI.Analysis of expression patterns of this gene in response to drought stress treatment showed that this gene is down regulated.Moreover,analysis of the expression patterns of the GA20ox gene,a key gene on GA biosynthesis process,indicated that the GA20ox gene has similar expression patterns to MeGAI.All these results give the clues to possible involvement of GA signal in resistance to drought stress.
- DELLA protein /
- gene cloning /
- bioinformatics analysis /
- drought stress

[1]	HEDDEN P,PHILLIPS A L.Gibberellin metabolism:new insights revealed by the genes[J].Trends Plant Sci,2000(5):523-530.
[2]	OLSZEWSKI N,SUN T P,GUBLER F.Gibberellinsignaling:biosynthesis,catabolism,andresponse pathways[J].Plant Cell,2002(14):S61-S80.
[3]	黄先忠,蒋才富,廖立力,等.赤霉素作用机理的分子基础与调控模式研究进展[J].植物学通报,2006,23(5):499-510.
[4]	王荣,崔百明,彭明,等.赤霉素信号转导与棉纤维的分子发育[J].遗传,2007,29(3):276-282.
[5]	HARTWECK L M,OISZWSKI N E.Rice GIBBERELLIN INSENSITIVE DWARF1is a gibberellin receptor that illuminates and raises questions about GA signaling[J].Plant cell,2006,18(2):278-282.
[6]	THOMAS S G,SUN T P.Update on Gibberellin Signaling.A Tale of the Tall and the Short[J].Plant Physiology,2004,135(2):668-676.
[7]	LIAO W B,RUAN M B,CUI B M,et al.Isolation and Characterization of a GAI/RGA-like gene from Gossypium hirsutum[J].Plant Growth Regulation,2009,58(1):34-45.
[8]	HUSSAIN A,PENG J R.DELLA Proteins and GA Signalling in Arabidopsis[J].J Plant Growth Regul,2003,22:134-140.
[9]	FU X,SUDHAKAR D,PENG J,et al.Expression of Arabidopsis GAI in transgenic rice represses multiple gibberellin respon-ses[J].Plant Cell,2001,13(8):1791-802.
[10]	ZENTELLA W,ZHANG Z L,PARK M,et al.Global Analysis of DELLA Direct Targets in Early Gibberellin Signaling in Ar-abidopsis[J].The Plant Cell,2007(19):3037-305.
[11]	KANEKO M,ITOH H,INUKAI Y,et al.Where do gibberellin biosynthesis and signaling occur in rice plants?[J].Plant J,2003,34:1-12.

[1]	吴书桦, 刘建成, 宁佳慧, 汪志伟. 一年生辣椒CaMYB44基因功能的初步解析 . 热带生物学报, 2025, 16(): 1-9. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.20240067
[2]	唐璐芝, 吴竞远, 陈元来, 朱彬彬, 赵惠萍. 木薯RXam2的原核蛋白表达及抗病功能分析 . 热带生物学报, 2025, 16(): 1-9. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.20240147
[3]	羊娥月, 李杨, 莫明珠, 杨东梅, 刘亚, 吴友根, 于靖. 越南油茶CdMYC2基因克隆、生物信息学分析与表达模式研究 . 热带生物学报, 2025, 16(): 1-9. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.20250031
[4]	刘梓权, 朱家红, 王颖, 李辉亮, 李玉姬, 唐燕琼, 郭冬. 橡胶树HbbZIP74基因的表达分析及蛋白原核表达纯化 . 热带生物学报, 2025, 16(): 1-11. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.20250015
[5]	贾素行, 朱寿松, 符仁稳, 李春霞, 陈银华. 木薯MePPD3基因的克隆及功能分析 . 热带生物学报, 2024, 15(1): 10-18. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.20230035
[6]	金海峰, 王朝政, 侯清芳, 咸利民, 张华剑, 吴少英. 普通大蓟马MuRhodopsin基因的全长克隆及生物信息学分析 . 热带生物学报, 2023, 14(6): 651-659. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.20220105
[7]	刘红东, 党一敏, 王英, 高和琼, 庄南生. 巴西橡胶树雄性不育相关候选基因HbXTH23的表达 . 热带生物学报, 2022, 13(6): 550-557. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2022.06.002
[8]	潘雪莲, 杨磊, 袁琳琳, 陈龙威, 吴少英. 豆大蓟马钠离子通道基因克隆及分析 . 热带生物学报, 2022, 13(3): 249-258. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2022.03.007
[9]	武映宏, 黄东益, 王永, 张大鹏, 刘蕊, 孙熹微, 肖勇. 椰子ALDH基因家族的鉴定及生物信息学分析 . 热带生物学报, 2022, 13(6): 541-549. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2022.06.001
[10]	朱晓菲, 黄娇媚, 原昊, 万逸. Class2 CRISPR-Cas系统发掘及分析方法 . 热带生物学报, 2021, 12(1): 115-123. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2021.01.017
[11]	曹欣, 唐燕琼, 李宏, 马香, 刘柱. Flag-ALD融合载体构建及蛋白表达 . 热带生物学报, 2020, 11(2): 132-137, 155. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2020.02.002
[12]	白雪杨, 陈秀珍, 黄天帆, 江行玉, 周扬. 盐胁迫下拟南芥SCAMP基因克隆和表达的生物信息学分析 . 热带生物学报, 2020, 11(2): 138-144. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2020.02.003
[13]	任宁, 陈秀珍, 夏幽泉, 白雪杨, 江行玉, 周扬. 木薯MeNRT2.5基因的克隆及表达分析 . 热带生物学报, 2019, 10(2): 111-118. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2019.02.003
[14]	杨署光, 吴绍华, 陈月异, 李言, 张世鑫, 史敏晶, 田维敏. 巴西橡胶树HbGSK1的基因克隆与表达分析 . 热带生物学报, 2018, 9(3): 302-311. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2018.03.006
[15]	王树昌, 于晓玲, 李淑霞, 阮孟斌, 彭明. 木薯MeHDS09基因克隆及其对逆境信号的响应 . 热带生物学报, 2017, 8(4): 409-414. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2017.04.006
[16]	彭赟, 龙海飞, 贺瑞, 徐敏, 曾灿彬, 骆娟, 齐钊, 闫臻, 阮云泽, 何朝族, 汤华. 香蕉miRNA及其靶基因的生物信息学预测 . 热带生物学报, 2016, 7(2): 237-245. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2016.02.017
[17]	张珍珍, 肖慧琳, 李小溪, 潘秋红. 葡萄莽草酸激酶基因(VvSK)的克隆与表达分析 . 热带生物学报, 2012, 3(2): 109-115. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2012.02.013
[18]	黄启星, 郭安平, 杨礼富, 邹智. 蓖麻WRKY14基因的鉴别与信息分析 . 热带生物学报, 2012, 3(4): 305-313. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2012.04.005
[19]	杜丽, 谢少林, 成鹰, 张晓茹, 匡文华, 焦寒伟, 张冬琳, 郝永昌, 雷明, 刘涛, 王凤阳. 海南坡鹿MD2 cDNA的克隆及其生物信息学分析 . 热带生物学报, 2011, 2(1): 1-5. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2011.01.001
[20]	张晓茹, 匡文华, 成鹰, 杜丽, 雷明, 焦寒伟, 张冬琳, 郝永昌, 祁超, 王凤阳. 水牛Cdc42 cDNA的克隆与生物信息学分析 . 热带生物学报, 2011, 2(4): 349-354. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2011.04.019

点击查看大图

计量

文章访问数: 8
HTML全文浏览量: 0
PDF下载量: 0
被引次数: 0

木薯赤霉素途径DELLA蛋白基因克隆及其对干旱胁迫的响应

doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2012.04.004

廖文彬,
彭明^,

中国热带农业科学院热带生物技术研究所/农业部热带作物生物学与遗传资源利用重点实验室, 海南海口 571101

基金项目:

国家国际科技合作专项(2013DFA32020)

国家863计划项目资助(2012AA101204-2)

作者简介:
廖文彬(1975-),男,湖南邵阳人,中国热带农业科学院热带生物技术研究所副研究员.

通讯作者: 彭明.E-mail:mmpeng_2000@yahoo.com

收稿日期: 2012-10-10

中图分类号: Q344⁺.12

关键词:

摘要: 赤霉素(GA)信号转导途径是通过DELLA抑制蛋白来调控的。笔者利用拟南芥DELLA蛋白基因序列,通过电子克隆方法首次克隆了1个木薯DELLA蛋白基因,长度为1857bp,具有完整的蛋白编码框的cDNA序列,命名为MeGAI。生物信息学分析显示,该蛋白具有与拟南芥DELLA蛋白一样的保守结构域,如DELLA结构域、VHYNP结构域、POLY(S/T)结构域、核定位信号、VHVID结构域、亮氨酸结构域、GRAS结构域;该基因在干旱胁迫下的表达模式研究结果表明,该基因在干旱胁迫下是下调表达的;GA生物合成重要基因GA20-氧化酶基因在干旱胁迫下的表达模式研究结果表明,两者在干旱胁迫下的表达模式具有良好的相关性,这说明GA途径可能参与木薯抗旱机制。