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主持人:朱国鹏
火龙果是仙人掌科(Cactaceae)量天尺属(Hylocereus)或蛇鞭柱属(Seleniereus)的植物,原产于中美洲热带地区,是热带地区重要的经济作物[1-3]。随着消费升级,人们对火龙果的品质要求越来越高,火龙果新品种的研发也日益重要。火龙果育种中,不同种属、不同倍性材料的杂交是常用方法,对火龙果种质资源及杂交后代进行倍性鉴定是火龙果新品种选育的重要环节。黄黎芳等[4]对18份火龙果种质资源及8份杂交后代的倍性进行鉴定,发现自然界种主要存在二倍体和四倍体,杂交后代中存在三倍体。刘顺枝等[5-6]利用火龙果根尖和气生根对红肉火龙果和白肉火龙果进行核型分析,发现2种火龙果都是二倍体,染色体数目均为2n=2x=22。常规的植物倍性鉴定是采用染色体制片技术和染色体核型分析,火龙果的染色体制片多选择根尖和气生根为材料,但火龙果根多为须根,操作困难;气生根难以催生,获取不易。Soltis等[7]将未复制的配子核基因组中的DNA含量称为1C-value(1C),并根据1C值大小将基因组分成5大类,分别是极小型基因组(1C≤1.34 Gb)、小型基因组(1.35 Gb≤1C≤3.34 Gb)、中型基因组(3.35 Gb≤1C≤13.36 Gb)、大型基因组(13.37 Gb≤1C≤33.42 Gb)、特大型基因组(1C≥33.43 Gb)。流式细胞技术可以快速鉴定植物种质资源的倍性,预估基因组大小[8]。科学家使用流式细胞技术对草莓(Fragaria ananassa)[9]、油茶(Camellia oleifera )[10]、石斛(Dendrobium nobile)[11]、猕猴桃(Actinidia chinensis)[12]等植物进行倍性鉴定,证明流式细胞技术在植物倍性鉴定中的可行性。但流式细胞技术在火龙果方面的研究少有报道。本研究利用茎尖染色体制片技术与流式细胞技术对42份火龙果种质资源进行倍性鉴定以及基因组大小的估测,旨在为火龙果杂交育种亲本材料的选择提供参考。
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供试的42份种质资源材料取自海南恩红农业科技有限公司的种质资源圃(表1)。对照材料‘金都一号’的基因组大小为1.4 Gb。
表 1 火龙果种质资源名称及编号
Table 1. The name and number of pitaya germplasm resources
编号Number 品种名称Name 编号Number 品种名称Name 编号Number 品种名称Name 1 澳洲黄龙Aozhouhuanglong 15 红水晶Hongshuijing 29 偷心6号Touxin No.6 2 白肉Bairou 16 黄皮Huangpi 30 陀2Tuo No.2 3 白水晶Baishuijing 17 金都一号Jindu No.1 31 陀红肉小果Tuohongrouxiaoguo 4 粗砂Cusha 18 玫瑰1号Meigui No.1 32 无刺红龙Wucihonglong 5 大红Dahong 19 玫红4号Meihong No.4 33 无刺黄龙Wucihuanglong 6 帝龙Dilong 20 美龙Meilong 34 细致Xizhi 7 富贵红450 Fuguihong450 21 美龙3号Meilong No.3 35 香蜜龙Xiangmilong 8 光明白肉Guangmingbairou 22 蜜宝Mibao 36 小圆果Xiaoyuanguo 9 光明红肉Guangminghongrou 23 蜜玄龙Mixuanlong 37 燕窝果Yanwoguo 10 广西450Guangxi 450 24 蔷薇3号Qiangwei No.3 38 越南白肉Yuenanbairou 11 桂红龙Guihonglong 25 软枝大红Ruanzhidahong 39 紫蜜龙Zimilong 12 红宝龙Hongbaolong 26 石火泉Shihuoquan 40 紫肉Zirou 13 红皮Hongpi 27 双色Shuangse 41 紫肉1号Zirou No.1 14 红肉Hongrou 28 台湾红肉Taiwanhongrou 42 紫肉2号Zirou No.2 -
以已知的二倍体‘金都一号’(2n=2x=22)为对照材料,对42份火龙果种质资源进行流式细胞倍性鉴定,测得‘金都一号’染色体的峰值荧光强度为5 121,其具有良好的二倍体单峰;四倍体品种染色体的峰值荧光强度在2倍的二倍体荧光强度处有较好的单峰,且四倍体品种的DNA相对含量也是二倍体含量的2倍(图6)。
经流式细胞检测收集的42份火龙果种质资源的染色体倍性见表2。其中,有41份荧光强度值在4 219~6 612之间,呈二倍体荧光强度(0.82~1.29),为二倍体材料;1份荧光强度值为10 939,是2.14倍的二倍体的荧光强度值,为四倍体材料。四倍体材料为‘燕窝果’。在42份火龙果种质资源材料中并未发现三倍体材料。
表 2 不同火龙果种质资源的基因组大小、倍性及染色体数目
Table 2. The genome size, ploidy and chromosome number of different pitaya germplasm resources
品种Variety name 染色体数目/条Chromosome number 峰值荧光强度Peak fluorescence intensity DNA含量/%DNA content/% 预估基因组大小(1C)/GbGenome size/Gb 倍性Ploidy 金都一号Jindu No.1 2n=2x=22 5 121 100.00 1.40 二倍体2X 澳洲黄龙Aozhouhuanglong 2n=2x=22 5 097 99.53 1.39 二倍体2X 白肉Bairou 2n=2x=22 5 313 103.75 1.45 二倍体2X 白水晶Baishuijing 2n=2x=22 6 035 117.85 1.65 二倍体2X 粗砂Cusha 2n=2x=22 5 121 100.00 1.40 二倍体2X 大红Dahong 2n=2x=22 5 205 101.64 1.42 二倍体2X 帝龙Dilong 2n=2x=22 4 712 92.01 1.29 二倍体2X 富贵红450Fuguihong450 2n=2x=22 5 109 99.77 1.40 二倍体2X 光明白肉Guangmingbairou 2n=2x=22 4 941 96.49 1.35 二倍体2X 光明红肉Guangminghongrou 2n=2x=22 4 496 87.80 1.23 二倍体2X 广西450Guangxi 450 2n=2x=22 4 784 93.42 1.31 二倍体2X 桂红龙Guihonglong 2n=2x=22 4 340 84.75 1.19 二倍体2X 红宝龙Hongbaolong 2n=2x=22 5 409 105.62 1.48 二倍体2X 红皮Hongpi 2n=2x=22 6 311 123.24 1.73 二倍体2X 红肉Hongrou 2n=2x=22 5 025 98.13 1.37 二倍体2X 红水晶Hongshuijing 2n=2x=22 4 592 89.67 1.26 二倍体2X 续表2 Tab.2 Continued -
根据植物基因组的1C值大小,将基因组分成5类。以‘金都一号’为对照,对其余41种火龙果基因组大小进行预估,发现预估基因组大小在1.15~2.99 Gb之间(表2),预估基因组的平均大小为1.45 Gb,其中有15份火龙果种质资源的1C≤1.34 Gb,属于极小型基因组;其余27份火龙果种质资源的1C值在1.35 Gb~3.34 Gb之间,属于小型基因组。42份火龙果种质资源的预估基因组大小主要集中在1.35~3.34 Gb之间,其次在1.15~1.34 Gb之间,并未发现其他种类的基因组,其中‘蜜宝’的基因组最小,仅有1.15 Gb;‘燕窝果’的基因组最大,达到了2.99 Gb。两者的预估基因组大小相差2.6倍。
品种Variety name 染色体数目/条Chromosome number 峰值荧光强度Peak fluorescence intensity DNA含量/%DNA content/% 预估基因组大小(1C)/GbGenome size/Gb 倍性Ploidy 黄皮Huangpi 2n=2x=22 4 484 87.56 1.23 二倍体2X 玫瑰1号Meigui No.1 2n=2x=22 5 349 104.45 1.46 二倍体2X 玫红4号Meihong No.4 2n=2x=22 4 520 88.26 1.24 二倍体2X 美龙Meilong 2n=2x=22 5 506 107.52 1.51 二倍体2X 美龙3号Meilong No.3 2n=2x=22 6 107 119.25 1.67 二倍体2X 蜜宝Mibao 2n=2x=22 4 219 82.39 1.15 二倍体2X 蜜玄龙Mixuanlong 2n=2x=22 5 602 109.39 1.53 二倍体2X 蔷薇3号Qiangwei No.3 2n=2x=22 4 496 87.80 1.23 二倍体2X 软枝大红Ruanzhidahong 2n=2x=22 4 941 96.49 1.35 二倍体2X 石火泉Shihuoquan 2n=2x=22 4 748 92.72 1.30 二倍体2X 双色Shuangse 2n=2x=22 5 397 105.39 1.48 二倍体2X 台湾红肉Taiwanhongrou 2n=2x=22 4 832 94.36 1.32 二倍体2X 偷心6号Touxin No.6 2n=2x=22 5 277 103.05 1.44 二倍体2X 陀2Tuo No.2 2n=2x=22 4 905 95.78 1.34 二倍体2X 陀红肉小果Tuohongrouxiaoguo 2n=2x=22 6 503 126.99 1.78 二倍体2X 无刺红龙Wucihonglong 2n=2x=22 5 854 114.31 1.60 二倍体2X 无刺黄龙Wucihuanglong 2n=2x=22 5 446 106.35 1.49 二倍体2X 细致Xizhi 2n=2x=22 6 612 129.12 1.81 二倍体2X 香蜜龙Xiangmilong 2n=2x=22 5 446 106.35 1.49 二倍体2X 小圆果Xiaoyuanguo 2n=2x=22 4 484 87.56 1.23 二倍体2X 燕窝果Yanwoguo 2n=4x=44 10 939 213.61 2.99 四倍体4X 越南白肉Yuenanbairou 2n=2x=22 4 496 87.80 1.23 二倍体2X 紫蜜龙Zimilong 2n=2x=22 6 503 126.99 1.78 二倍体2X 紫肉Zirou 2n=2x=22 5 217 101.87 1.43 二倍体2X 续表2 Tab.2 Continued 品种Variety name 染色体数目/条Chromosome number 峰值荧光强度Peak fluorescence intensity DNA含量/%DNA content/% 预估基因组大小(1C)/GbGenome size/Gb 倍性Ploidy 紫肉2号Zirou No.1 2n=2x=22 5 049 105.62 1.48 二倍体2X 紫色1号Zirou No.2 2n=2x=22 4 340 84.75 1.19 二倍体2X 注: ‘金都一号’为对照。Note: ‘Jindu-1’ was selected as control.
Ploidy identification and genome size analysis of 42 Pitaya germplasm resources
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摘要: 为了满足火龙果的产业发展需求,必须开展火龙果高产优质新品种的选育工作。收集和评价火龙果种质资源,并开展火龙果的杂交育种,是火龙果育种的主要路径。火龙果种质资源多样,遗传倍性情况不明,对种质资源的倍性进行鉴定是育种创新不可缺少的环节。本研究建立了火龙果茎尖染色体制片体系,并采用茎尖染色体制片技术以及流式细胞技术对42份火龙果种质资源进行倍性鉴定。结果表明:1)火龙果茎尖染色体制片在前低渗时间为2 h、解离时间为1.5 h、酶解时间为1 h、后低渗时间为30 min时,染色体分散程度较好,背景清晰,没有出现重叠的现象,具有完整的细胞。2)火龙果茎尖倍性稳定,是最可靠的检测材料,老熟的茎条含有大量的四倍体和八倍体细胞,不宜做倍性鉴定材料。3)42份火龙果种质资源中有二倍体材料41份,四倍体材料1份,无三倍体材料。4)以‘金都一号’为参照,进行基因组大小的预估,发现有15份火龙果种质资源的1C-value(1C)≤1.34 Gb,为极小型基因组,27份火龙果种质资源的1C值在1.35~3.34 Gb之间,为小型基因组。Abstract: In order to meet the needs of development of pitaya industry, it is necessary to develop numerous commercial varieties of pitaya with high yield and high quality through breeding and selection. The main way for pitaya breeding is to collect and evaluate pitaya germplasm resources for cross-breeding. Pitaya germplasm is diverse, and its genetic ploidy is unknown. The ploidy identification is indispensable to breeding innovation. Forty two accessions of pitaya germplasm were collected and their ploidy was identified by stem tip chromosome preparation technique and flow cytometry. When the current hypotonic time is 2 h, the dissociation time is 1.5 h, the enzymatic hydrolysis time is 1 h, and the post-hypotonic time is 30 min, the cells prepared are intact with good chromosome dispersion and clear background and without overlapping. The ploidy of the pitaya stem tip is stable, and the stem tip is the most reliable material for chromosome determination. The mature stems contain a large number of tetraploid and octaploid cells, and are hence not suitable for ploidy identification. Among the 42 accessions of pitaya germplasm there are 41 accessions diploid, 1 tetraploid and no triploid. The genome size was estimated with accession ‘Jindu No.1’ as a reference. It was found that 15 accessions of pitaya germplasm were very small in genome size with the 1C-value (1C) being ≤1.34 Gb while 27 accessions of pitaya germplasm were small in genome size with the 1C being in the range of 1.35 Gb~3.34 Gb. The identification of the ploidy of 42 accessions of pitaya germplasm might provide some reference for parent selection in pitaya cross breeding.
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Key words:
- pitaya /
- germplasm resources /
- chromosome preparation technique /
- flow cytometry /
- genetic ploidy /
- genome size
注释:1) 潘学峰 -
图 5 火龙果不同组织部位的流式细胞检测
A:茎尖;B:幼嫩茎条;C:老熟茎条;横轴是DNA染料DAPI收到波长为532 nm的激光激发所放出的荧光强度。纵轴是细胞核数。
Fig. 5 Flow cytometry assays for different tissues of pitaya
Note: A: young bud tip; B: young stems; C: Old ripe stems; The horizontal axis is the fluorescence intensity emitted by the laser excitation of the DNA dye DAPI with a wavelength of 532 nm. The vertical axis is the number of nuclei.
表 1 火龙果种质资源名称及编号
Table 1 The name and number of pitaya germplasm resources
编号Number 品种名称Name 编号Number 品种名称Name 编号Number 品种名称Name 1 澳洲黄龙Aozhouhuanglong 15 红水晶Hongshuijing 29 偷心6号Touxin No.6 2 白肉Bairou 16 黄皮Huangpi 30 陀2Tuo No.2 3 白水晶Baishuijing 17 金都一号Jindu No.1 31 陀红肉小果Tuohongrouxiaoguo 4 粗砂Cusha 18 玫瑰1号Meigui No.1 32 无刺红龙Wucihonglong 5 大红Dahong 19 玫红4号Meihong No.4 33 无刺黄龙Wucihuanglong 6 帝龙Dilong 20 美龙Meilong 34 细致Xizhi 7 富贵红450 Fuguihong450 21 美龙3号Meilong No.3 35 香蜜龙Xiangmilong 8 光明白肉Guangmingbairou 22 蜜宝Mibao 36 小圆果Xiaoyuanguo 9 光明红肉Guangminghongrou 23 蜜玄龙Mixuanlong 37 燕窝果Yanwoguo 10 广西450Guangxi 450 24 蔷薇3号Qiangwei No.3 38 越南白肉Yuenanbairou 11 桂红龙Guihonglong 25 软枝大红Ruanzhidahong 39 紫蜜龙Zimilong 12 红宝龙Hongbaolong 26 石火泉Shihuoquan 40 紫肉Zirou 13 红皮Hongpi 27 双色Shuangse 41 紫肉1号Zirou No.1 14 红肉Hongrou 28 台湾红肉Taiwanhongrou 42 紫肉2号Zirou No.2 表 2 不同火龙果种质资源的基因组大小、倍性及染色体数目
Table 2 The genome size, ploidy and chromosome number of different pitaya germplasm resources
品种Variety name 染色体数目/条Chromosome number 峰值荧光强度Peak fluorescence intensity DNA含量/%DNA content/% 预估基因组大小(1C)/GbGenome size/Gb 倍性Ploidy 金都一号Jindu No.1 2n=2x=22 5 121 100.00 1.40 二倍体2X 澳洲黄龙Aozhouhuanglong 2n=2x=22 5 097 99.53 1.39 二倍体2X 白肉Bairou 2n=2x=22 5 313 103.75 1.45 二倍体2X 白水晶Baishuijing 2n=2x=22 6 035 117.85 1.65 二倍体2X 粗砂Cusha 2n=2x=22 5 121 100.00 1.40 二倍体2X 大红Dahong 2n=2x=22 5 205 101.64 1.42 二倍体2X 帝龙Dilong 2n=2x=22 4 712 92.01 1.29 二倍体2X 富贵红450Fuguihong450 2n=2x=22 5 109 99.77 1.40 二倍体2X 光明白肉Guangmingbairou 2n=2x=22 4 941 96.49 1.35 二倍体2X 光明红肉Guangminghongrou 2n=2x=22 4 496 87.80 1.23 二倍体2X 广西450Guangxi 450 2n=2x=22 4 784 93.42 1.31 二倍体2X 桂红龙Guihonglong 2n=2x=22 4 340 84.75 1.19 二倍体2X 红宝龙Hongbaolong 2n=2x=22 5 409 105.62 1.48 二倍体2X 红皮Hongpi 2n=2x=22 6 311 123.24 1.73 二倍体2X 红肉Hongrou 2n=2x=22 5 025 98.13 1.37 二倍体2X 红水晶Hongshuijing 2n=2x=22 4 592 89.67 1.26 二倍体2X 续表2 Tab.2 Continued 品种Variety name 染色体数目/条Chromosome number 峰值荧光强度Peak fluorescence intensity DNA含量/%DNA content/% 预估基因组大小(1C)/GbGenome size/Gb 倍性Ploidy 黄皮Huangpi 2n=2x=22 4 484 87.56 1.23 二倍体2X 玫瑰1号Meigui No.1 2n=2x=22 5 349 104.45 1.46 二倍体2X 玫红4号Meihong No.4 2n=2x=22 4 520 88.26 1.24 二倍体2X 美龙Meilong 2n=2x=22 5 506 107.52 1.51 二倍体2X 美龙3号Meilong No.3 2n=2x=22 6 107 119.25 1.67 二倍体2X 蜜宝Mibao 2n=2x=22 4 219 82.39 1.15 二倍体2X 蜜玄龙Mixuanlong 2n=2x=22 5 602 109.39 1.53 二倍体2X 蔷薇3号Qiangwei No.3 2n=2x=22 4 496 87.80 1.23 二倍体2X 软枝大红Ruanzhidahong 2n=2x=22 4 941 96.49 1.35 二倍体2X 石火泉Shihuoquan 2n=2x=22 4 748 92.72 1.30 二倍体2X 双色Shuangse 2n=2x=22 5 397 105.39 1.48 二倍体2X 台湾红肉Taiwanhongrou 2n=2x=22 4 832 94.36 1.32 二倍体2X 偷心6号Touxin No.6 2n=2x=22 5 277 103.05 1.44 二倍体2X 陀2Tuo No.2 2n=2x=22 4 905 95.78 1.34 二倍体2X 陀红肉小果Tuohongrouxiaoguo 2n=2x=22 6 503 126.99 1.78 二倍体2X 无刺红龙Wucihonglong 2n=2x=22 5 854 114.31 1.60 二倍体2X 无刺黄龙Wucihuanglong 2n=2x=22 5 446 106.35 1.49 二倍体2X 细致Xizhi 2n=2x=22 6 612 129.12 1.81 二倍体2X 香蜜龙Xiangmilong 2n=2x=22 5 446 106.35 1.49 二倍体2X 小圆果Xiaoyuanguo 2n=2x=22 4 484 87.56 1.23 二倍体2X 燕窝果Yanwoguo 2n=4x=44 10 939 213.61 2.99 四倍体4X 越南白肉Yuenanbairou 2n=2x=22 4 496 87.80 1.23 二倍体2X 紫蜜龙Zimilong 2n=2x=22 6 503 126.99 1.78 二倍体2X 紫肉Zirou 2n=2x=22 5 217 101.87 1.43 二倍体2X 续表2 Tab.2 Continued 品种Variety name 染色体数目/条Chromosome number 峰值荧光强度Peak fluorescence intensity DNA含量/%DNA content/% 预估基因组大小(1C)/GbGenome size/Gb 倍性Ploidy 紫肉2号Zirou No.1 2n=2x=22 5 049 105.62 1.48 二倍体2X 紫色1号Zirou No.2 2n=2x=22 4 340 84.75 1.19 二倍体2X 注: ‘金都一号’为对照。Note: ‘Jindu-1’ was selected as control. -
[1] 吴征镒. 中国植物志[M]. 北京:科学出版社, 1999. [2] MIZRAHI Y, NERD A, NOBE P S. Cacti as crops[J]. Horticultural reviews, 1997, 18: 291-391. [3] HERBACH K M, ROHE M, STINTZING F C, et al. Structural and chromatic stability of purple pitaya (Hylocereus polyrhizus[Weber]Britton & Rose) betacyanins as affected by the juice matrix and selected additives[J]. Food Research International, 2006, 39(6): 667-677. [4] 黄黎芳, 武志江, 梁桂东, 等. 利用流式细胞术对29份火龙果种质染色体的倍性鉴定[J]. 热带作物学报, 2021, 42(4): 966-970. [5] 刘顺枝, 刘政浩, 林润怡, 等. 白肉火龙果染色体制片技术及核型分析[J]. 广东农业科学, 2015, 42(3): 115-118. [6] 刘顺枝, 周浩彬, 林润怡, 等. 红肉火龙果气生根染色体制片优化及核型分析[J]. 北方园艺, 2015(12): 71-76. [7] SOLTIS D E, SOLTIS P S, BENNETT M D, et al. Evolution of genome size in the angiosperms[J]. American Journal of Botany, 2003, 90(11): 1596-1603. [8] 宋云连, 张惠云, 王跃全, 等. 流式细胞术应用及植物种质资源倍性研究进展[J]. 陕西农业科学, 2020, 66(8): 76-80. [9] 周历萍, 王淑珍, 阮松林, 等. 草莓流式细胞检测提取方法的优化[J]. 浙江农业学报, 2015, 27(11): 2024-2028. [10] 叶天文, 袁德义, 李艳民, 等. 海南油茶的倍性鉴定[J]. 林业科学, 2021, 57(7): 61-69. [11] 熊文艳, 普冉, 刘云礼, 等. 基于流式细胞术对27种石斛的倍性鉴定和基因组大小分析[J]. 热带作物学报, 2022, 43(11): 2249-2257. [12] 刘振盼. 利用流式细胞术鉴定软枣猕猴桃倍性的方法[J]. 辽宁林业科技, 2021(2): 23-25. [13] 杨丽, 孙浩元, 张俊环, 等. 利用流式细胞术鉴定杏及其部分近缘植物的倍性[J]. 西北农业学报, 2021, 30(10): 1504-1513. [14] 裴丹, 葛孟清, 董天宇, 等. 208个葡萄品种染色体倍性的流式细胞分析[J]. 中外葡萄与葡萄酒, 2019(5): 21-28.