火龙果根系在淹水胁迫下的基因差异表达

闫臻; 齐钊; 熊睿; 刘成立; 徐敏; 韦双双; 阮云泽; 汤华

doi:10.15886/j.cnki.rdswxb.2018.03.007

中国科技核心期刊（中国科技论文统计源期刊）
中国学术期刊（光盘版）全文收录
RCCSE中国核心学术期刊（B+）
中国科技期刊卓越行动计划（二期）集群化试点项目
国际数据库：AGRIS、CABI、EBSCO、Ulrichsweb、J-gate

高级检索

留言板

尊敬的读者、作者、审稿人, 关于本刊的投稿、审稿、编辑和出版的任何问题, 您可以本页添加留言。我们将尽快给您答复。谢谢您的支持!

姓名
邮箱
手机号码
标题
留言内容
验证码

火龙果根系在淹水胁迫下的基因差异表达

闫臻, 齐钊, 熊睿, 刘成立, 徐敏, 韦双双, 阮云泽, 汤华

文章导航 > 热带生物学报（中英文） > 2018 > 9(3): 312-319

闫臻, 齐钊, 熊睿, 刘成立, 徐敏, 韦双双, 阮云泽, 汤华. 火龙果根系在淹水胁迫下的基因差异表达[J]. 热带生物学报（中英文）, 2018, 9(3): 312-319. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2018.03.007

引用本文:

YAN Zhen, QI Zhao, XIONG Rui, LIU Chengli, XU Min, WEI Shuangshuang, RUAN Yunze, TANG Hua. Differential Gene Expression of Pitaya Root Induced Under Flooding Stress[J]. Journal of Tropical Biology, 2018, 9(3): 312-319. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2018.03.007

Citation:

YAN Zhen, QI Zhao, XIONG Rui, LIU Chengli, XU Min, WEI Shuangshuang, RUAN Yunze, TANG Hua. Differential Gene Expression of Pitaya Root Induced Under Flooding Stress[J]. Journal of Tropical Biology, 2018, 9(3): 312-319. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2018.03.007

火龙果根系在淹水胁迫下的基因差异表达

DOI: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2018.03.007

海南大学热带农林学院/海南热带生物资源可持续利用国家重点实验室, 海口 570228

基金项目:

海南省重点研发项目(ZDYF2018080)

国家自然科学基金(31360364)

详细信息

第一作者:
闫臻(1993-),女,海南大学热带农林学院2015级硕士研究生.E-mail:yanzhen_yz@126.com

通信作者:
汤华(1974-),男,教授.研究方向:作物遗传育种与分子生物学.E-mail:thtiger@163.com

中图分类号: Q786

Differential Gene Expression of Pitaya Root Induced Under Flooding Stress

Institute of Tropical Agriculture and Forestry/Hainan Key Laboratory of Sustainable Utilization of Tropical Biological Resources, Hainan University, Haikou, Hainan 570228, China

摘要: 运用RNA-Seq测序技术对淹水胁迫下的火龙果根系进行转录组测序,对淹水处理组与对照组的基因表达量进行差异比较分析,并采用qRT-PCR对差异表达基因的表达特性进行分析验证,结果表明:淹水胁迫下火龙果根系中有1 481个差异表达的基因,其中,上调表达925个,下调表达556个,其功能多富集于糖代谢、碳代谢、氮代谢、乙醇代谢、氨基酸生物合成、苯丙氨酸代谢、植物激素信号转导等方面。可见,淹水胁迫对火龙果根系的基础代谢影响较大,但火龙果根系能够通过糖酵解、乙醇发酵及丙氨酸发酵途径来提供火龙果植株生存所需能量以减轻淹水胁迫对其造成的不良影响,并能够诱导乙烯合成来调控火龙果的逆境应答,从而使火龙果植株表现出一定的淹水耐受性。
- 火龙果 /
- 淹水胁迫 /
- 转录组测序 /
- 差异表达基因
Abstract: The RNA-Seq sequencing technique was used to sequence the root system of pitaya under flooding stress,and the difference of gene expression between the flooded group and the control group was compared. The expression characteristics of the differentially expressed genes were analyzed and verified by qRT-PCR to explore the molecular mechanism of flooding stress and explore genes related to flooding tolerance. The results showed that there were 1 481 differentially expressed genes in the root system of pitaya under flooding stress,including 925 up-regulated genes and 556 down-regulated genes. Their functions were mainly enriched in sugar metabolism,carbon metabolism,nitrogen metabolism,ethanol metabolism,amino acid biosynthesis,phenylalanine metabolism,plant hormone signal transduction and so on. It can be seen that flooding stress has a great effect on the basic metabolism of pitaya root,but the root system of pitaya can provide the energy required for the survival of pitaya through glycolysis,ethanol fermentation and alanine fermentation to reduce the adverse effects of flooding stress on pitaya. And flooding stress induced ethylene synthesis to regulate the stress response of pitaya so that the pitaya showed a certain tolerance to flooding stress.
- Pitaya /
- flooding stress /
- transcriptome sequencing /
- differentially expressed gene

[1]	杨欣, 刘会, 张荣飞, 陈垂日, 路洁, 王俏, 黄怡顺, 王华锋. 三种火龙果品种间的最佳授粉效率研究 . 热带生物学报（中英文）, 2026, 17(2): 198-206. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.20230113
[2]	杨敏, 黄婧, 曹毓杰, 李东栋, 郑育声. 基于转录组的蛇皮果雌雄株差异基因的筛选和性别鉴定 . 热带生物学报（中英文）, 2025, 16(1): 13-20. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.20240110
[3]	吴昊龙, 符厚隆, 符君玉, 廖道龙, 周斌, 刘子凡, 弭宝彬. 南瓜嫁接提高冬瓜枯萎病抗性的转录组分析 . 热带生物学报（中英文）, 2025, 16(6): 829-841. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.20250040
[4]	姜森荣, 康绍玲, 丁一, 羊壮家, 王猛, 王周雯, 韦双双, 汤华. 火龙果果实鳞片保绿和果实增重的植物生长调节剂筛选 . 热带生物学报（中英文）, 2025, 16(3): 451-460. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.20230135
[5]	贾新蕾, 黄增朝, 杨林狄, 吕静, 李妍萍, 简纪常, 黄郁葱. 不同培养温度的鱼源海豚链球菌转录组分析 . 热带生物学报（中英文）, 2024, 15(1): 109-121. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.20230027
[6]	龚文坤, 伍巧慧, 王钢, 杨劲明, 吕荣婷, 王蓓蓓. 火龙果根际促生微生物筛选及其效应 . 热带生物学报（中英文）, 2024, 15(5): 632-638. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.20230138
[7]	李佳雪, 丁一, 王猛, 李涛, 郭攀阳, 刘成立, 韦双双, 黄家权, 李洪立, 胡文斌, 汤华. 火龙果HubHLH基因家族的全基因组分析及其对冬季补光诱导开花的表达响应 . 热带生物学报（中英文）, 2024, 15(2): 198-209. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.20220108
[8]	丁一, 王周雯, 康绍玲, 姜森荣, 王猛, 黄家权, 李洪立, 胡文斌, 汤华. 火龙果42份种质资源的倍性鉴定及基因组大小分析 . 热带生物学报（中英文）, 2024, 15(3): 306-314. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.20230118
[9]	李涛, 王猛, 李佳雪, 王周雯, 丁一, 胡文斌, 李洪立, 汤华. 火龙果果实与种子产量性状的相关性研究 . 热带生物学报（中英文）, 2022, 13(3): 259-263. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2022.03.008
[10]	董晨, 魏永赞, 王弋, 郑雪文, 李伟才. 转录组荔枝Dof基因家族的鉴定及其表达 . 热带生物学报（中英文）, 2021, 12(1): 7-14. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2021.01.002
[11]	葛春晖, 尤文静, 蒋泽橙, 成梓瑜, 汤月, 邵远志. 火龙果采后病原菌的鉴定及其防控处理的优化 . 热带生物学报（中英文）, 2021, 12(2): 228-235. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2021.02.012
[12]	于婧, 李敏, 高兆银, 弓德强, 张绍刚, 洪小雨, 花静静, 胡美姣. 抑制火龙果果腐病病菌桃吉尔霉的植物精油筛选(简报) . 热带生物学报（中英文）, 2021, 12(1): 72-74. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2021.01.010
[13]	程玉, 徐敏, 熊睿, 林家年, 阮云泽, 任太军, 赵鹏飞, 汤华. 滴灌条件下氮肥用量对火龙果果实的影响 . 热带生物学报（中英文）, 2020, 11(1): 25-30. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2020.01.005
[14]	陈弟, 李可增, 吴琼, 何应对, 殷晓敏. 火龙果根际土壤微生物2种DNA提取方法的比较 . 热带生物学报（中英文）, 2019, 10(2): 184-189. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2019.02.014
[15]	熊睿, 徐敏, 刘成立, 林家年, 程玉, 韦双双, 汤华. 海南冬季诱导火龙果开花的补光条件 . 热带生物学报（中英文）, 2019, 10(1): 60-65. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2019.01.010
[16]	程玉, 徐敏, 熊睿, 刘成立, 林家年, 阮云泽, 任太军, 王国洪, 赵鹏飞, 汤华. 氮肥施用量对火龙果枝条生长及养分积累的影响 . 热带生物学报（中英文）, 2018, 9(4): 427-432. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2018.04.010
[17]	齐钊, 闫臻, 徐敏, 刘成立, 程玉, 熊睿, 骆娟, 汤华. 火龙果干旱胁迫下根和茎的基因差异表达 . 热带生物学报（中英文）, 2018, 9(3): 320-327. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2018.03.008
[18]	曾灿彬, 徐敏, 齐钊, 闫臻, 熊睿, 程玉, 阮云泽, 汤华. 火龙果果肉颜色相关MYB转录因子的表达分析 . 热带生物学报（中英文）, 2017, 8(2): 153-158. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2017.02.004
[19]	贺瑞, 彭赟, 刘扬, 曾灿彬, 徐敏, 齐钊, 闫臻, 骆娟, 阮云泽, 何朝族, 汤华. 低氮胁迫下香蕉硝酸盐转运蛋白MaNRT2基因的克隆与表达分析 . 热带生物学报（中英文）, 2016, 7(1): 76-81. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2016.01.013
[20]	高慧颖, 王琦, 余亚白. 火龙果花的研究现状与开发前景 . 热带生物学报（中英文）, 2012, 3(3): 281-286. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2012.03.016

点击查看大图

计量

文章访问数: 356
HTML全文浏览量: 85
PDF下载量: 3
被引次数: 0

火龙果根系在淹水胁迫下的基因差异表达

DOI: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2018.03.007

海南大学热带农林学院/海南热带生物资源可持续利用国家重点实验室, 海口 570228

基金项目:

海南省重点研发项目(ZDYF2018080)

国家自然科学基金(31360364)

作者简介:
闫臻(1993-),女,海南大学热带农林学院2015级硕士研究生.E-mail:yanzhen_yz@126.com

通讯作者: 汤华(1974-),男,教授.研究方向:作物遗传育种与分子生物学.E-mail:thtiger@163.com

收稿日期: 2018-06-01
修回日期: 2017-06-11

中图分类号: Q786

关键词:

火龙果 /

淹水胁迫 /

转录组测序 /

差异表达基因

摘要: 运用RNA-Seq测序技术对淹水胁迫下的火龙果根系进行转录组测序,对淹水处理组与对照组的基因表达量进行差异比较分析,并采用qRT-PCR对差异表达基因的表达特性进行分析验证,结果表明:淹水胁迫下火龙果根系中有1 481个差异表达的基因,其中,上调表达925个,下调表达556个,其功能多富集于糖代谢、碳代谢、氮代谢、乙醇代谢、氨基酸生物合成、苯丙氨酸代谢、植物激素信号转导等方面。可见,淹水胁迫对火龙果根系的基础代谢影响较大,但火龙果根系能够通过糖酵解、乙醇发酵及丙氨酸发酵途径来提供火龙果植株生存所需能量以减轻淹水胁迫对其造成的不良影响,并能够诱导乙烯合成来调控火龙果的逆境应答,从而使火龙果植株表现出一定的淹水耐受性。

English Abstract

Differential Gene Expression of Pitaya Root Induced Under Flooding Stress

Institute of Tropical Agriculture and Forestry/Hainan Key Laboratory of Sustainable Utilization of Tropical Biological Resources, Hainan University, Haikou, Hainan 570228, China

Received Date: 2018-06-01
Rev Recd Date: 2017-06-11

Keywords:

Abstract: The RNA-Seq sequencing technique was used to sequence the root system of pitaya under flooding stress,and the difference of gene expression between the flooded group and the control group was compared. The expression characteristics of the differentially expressed genes were analyzed and verified by qRT-PCR to explore the molecular mechanism of flooding stress and explore genes related to flooding tolerance. The results showed that there were 1 481 differentially expressed genes in the root system of pitaya under flooding stress,including 925 up-regulated genes and 556 down-regulated genes. Their functions were mainly enriched in sugar metabolism,carbon metabolism,nitrogen metabolism,ethanol metabolism,amino acid biosynthesis,phenylalanine metabolism,plant hormone signal transduction and so on. It can be seen that flooding stress has a great effect on the basic metabolism of pitaya root,but the root system of pitaya can provide the energy required for the survival of pitaya through glycolysis,ethanol fermentation and alanine fermentation to reduce the adverse effects of flooding stress on pitaya. And flooding stress induced ethylene synthesis to regulate the stress response of pitaya so that the pitaya showed a certain tolerance to flooding stress.

引用本文:

Citation:

全文HTML

下载: 全尺寸图片幻灯片

返回文章

用微信扫码二维码

分享至好友和朋友圈

x 关闭永久关闭

严正声明

喜讯 | 我刊入选中国COAJ及国际权威数据库！

喜报 | 祝贺Tropical Plants首获影响因子2.9，跻身植物科学Q2

共谋热带期刊高质量发展热区高校联盟·期刊发展研讨会顺利召开

张铁明理事长、张月红编审莅临学报编辑部指导期刊建设工作

喜报！《热带生物学报（中英文）》影响因子稳步攀升，再创历史新高！

留言板

火龙果根系在淹水胁迫下的基因差异表达

DOI: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2018.03.007

第一作者: 闫臻(1993-),女,海南大学热带农林学院2015级硕士研究生.E-mail:yanzhen_yz@126.com

通信作者: 汤华(1974-),男,教授.研究方向:作物遗传育种与分子生物学.E-mail:thtiger@163.com

Differential Gene Expression of Pitaya Root Induced Under Flooding Stress

计量

出版历程

火龙果根系在淹水胁迫下的基因差异表达

DOI: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2018.03.007

海南大学热带农林学院/海南热带生物资源可持续利用国家重点实验室, 海口 570228

作者简介: 闫臻(1993-),女,海南大学热带农林学院2015级硕士研究生.E-mail:yanzhen_yz@126.com

通讯作者: 汤华(1974-),男,教授.研究方向:作物遗传育种与分子生物学.E-mail:thtiger@163.com

English Abstract

Differential Gene Expression of Pitaya Root Induced Under Flooding Stress

Institute of Tropical Agriculture and Forestry/Hainan Key Laboratory of Sustainable Utilization of Tropical Biological Resources, Hainan University, Haikou, Hainan 570228, China

全文HTML

目录

喜报！《热带生物学报（中英文）》影响因子稳步攀升，再创历史新高！

第一作者:
闫臻(1993-),女,海南大学热带农林学院2015级硕士研究生.E-mail:yanzhen_yz@126.com

通信作者:
汤华(1974-),男,教授.研究方向:作物遗传育种与分子生物学.E-mail:thtiger@163.com

作者简介:
闫臻(1993-),女,海南大学热带农林学院2015级硕士研究生.E-mail:yanzhen_yz@126.com