火龙果果肉颜色相关MYB转录因子的表达分析

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火龙果果肉颜色相关MYB转录因子的表达分析

曾灿彬, 徐敏, 齐钊, 闫臻, 熊睿, 程玉, 阮云泽, 汤华

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曾灿彬, 徐敏, 齐钊, 闫臻, 熊睿, 程玉, 阮云泽, 汤华. 火龙果果肉颜色相关MYB转录因子的表达分析[J]. 热带生物学报, 2017, 8(2): 153-158. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2017.02.004

引用本文:

曾灿彬, 徐敏, 齐钊, 闫臻, 熊睿, 程玉, 阮云泽, 汤华. 火龙果果肉颜色相关MYB转录因子的表达分析[J]. 热带生物学报, 2017, 8(2): 153-158. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2017.02.004

ZENG Canbin, XU Min, QI Zhao, YAN Zhen, XIONG Rui, CHENG Yu, RUAN Yunze, TANG Hua. Expression Analysis of MYB Transcription Factors Related to Flesh Color of Pitaya Fruit[J]. Journal of Tropical Biology, 2017, 8(2): 153-158. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2017.02.004

Citation:

ZENG Canbin, XU Min, QI Zhao, YAN Zhen, XIONG Rui, CHENG Yu, RUAN Yunze, TANG Hua. Expression Analysis of MYB Transcription Factors Related to Flesh Color of Pitaya Fruit[J]. Journal of Tropical Biology, 2017, 8(2): 153-158. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2017.02.004

火龙果果肉颜色相关MYB转录因子的表达分析

doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2017.02.004

海南大学热带农林学院/海南热带生物资源可持续利用国家重点实验室培育基地, 海口 570228

基金项目:

海南省重大科技项目(ZDZX2013023)

国家自然科学基金资助项目(31360364)

第一作者:
曾灿彬(1989-),男,海南大学热带农林学院2014级硕士研究生.E-mail:zengcanb@126.com

通信作者:
汤华(1974-),男,海南大学热带农林学院教授.研究方向:作物遗传育种与分子生物学.E-mail:th-tiger@163.com

中图分类号: Q786

Expression Analysis of MYB Transcription Factors Related to Flesh Color of Pitaya Fruit

College of Tropical Agriculture and Forestry/Hainan Key Laboratory of Sustainable Utilization of Tropical Biological Resources, Hainan University, Haikou, Hainan 570228, China

摘要: 对红肉与白肉火龙果的果实进行转录组测序,通过数据的分析与筛选,得到30个差异表达的MYB类转录因子。运用生物信息学进行了MYB转录因子序列的比对、基因注释分析、进化树分析、基因表达情况分析等,通过qRT-PCR验证,探究红肉与白肉火龙果果实颜色的代谢差异与MYB转录因子之间的调控关系。结果表明:火龙果果肉颜色差异可能受MYB转录因子家族部分成员的调控。
- 火龙果 /
- 果肉颜色 /
- 转录组测序 /
- MYB转录因子 /
- 生物信息分析
Abstract: Transcriptome sequencing of red-flesh and white-flesh pitaya fruit was conducted,and the data of the sequences were analyzed,from which 30 MYB transcription factors differentially expressed were selected. The MYB transcription factors were analyzed by using bioinformatics such as alignment,gene annotation analysis,phylogenetic analysis,gene expression analysis,etc. The bioinformatic analysis was verified by qRT-PCR to explore the regulatory relationships between metabolism difference and MYB transcription factors of white-or redflesh pitaya fruit. The results showed that the differences in pitaya flesh color may be regulated by some members of the MYB family of transcription factors.
- Pitaya /
- fruit colour /
- transcriptome sequencing /
- MYB transcription factor /
- bioinformatics

[1]	赵奥特, 林慧婷, 张宇霆, 黄小龙, 吴文墙, 夏薇, 黄东益. 参薯BBR-BPC基因家族的挖掘和特征分析 . 热带生物学报, 2025, 16(): 1-9. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.20250026
[2]	姜森荣, 康绍玲, 丁一, 羊壮家, 王猛, 王周雯, 韦双双, 汤华. 火龙果果实鳞片保绿和果实质量增加的植物生长调节剂筛选 . 热带生物学报, 2025, 16(): 1-10. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.20230135
[3]	李佳雪, 丁一, 王猛, 李涛, 郭攀阳, 刘成立, 韦双双, 黄家权, 李洪立, 胡文斌, 汤华. 火龙果HubHLH基因家族的全基因组分析及其对冬季补光诱导开花的表达响应 . 热带生物学报, 2024, 15(2): 198-209. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.20220108
[4]	龚文坤, 伍巧慧, 王钢, 杨劲明, 吕荣婷, 王蓓蓓. 火龙果根际促生微生物筛选及其效应 . 热带生物学报, 2024, 15(5): 632-638. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.20230138
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[7]	李涛, 王猛, 李佳雪, 王周雯, 丁一, 胡文斌, 李洪立, 汤华. 火龙果果实与种子产量性状的相关性研究 . 热带生物学报, 2022, 13(3): 259-263. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2022.03.008
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[12]	程玉, 徐敏, 熊睿, 林家年, 阮云泽, 任太军, 赵鹏飞, 汤华. 滴灌条件下氮肥用量对火龙果果实的影响 . 热带生物学报, 2020, 11(1): 25-30. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2020.01.005
[13]	熊睿, 徐敏, 刘成立, 林家年, 程玉, 韦双双, 汤华. 海南冬季诱导火龙果开花的补光条件 . 热带生物学报, 2019, 10(1): 60-65. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2019.01.010
[14]	陈弟, 李可增, 吴琼, 何应对, 殷晓敏. 火龙果根际土壤微生物2种DNA提取方法的比较 . 热带生物学报, 2019, 10(2): 184-189. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2019.02.014
[15]	程玉, 徐敏, 熊睿, 刘成立, 林家年, 阮云泽, 任太军, 王国洪, 赵鹏飞, 汤华. 氮肥施用量对火龙果枝条生长及养分积累的影响 . 热带生物学报, 2018, 9(4): 427-432. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2018.04.010
[16]	齐钊, 闫臻, 徐敏, 刘成立, 程玉, 熊睿, 骆娟, 汤华. 火龙果干旱胁迫下根和茎的基因差异表达 . 热带生物学报, 2018, 9(3): 320-327. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2018.03.008
[17]	闫臻, 齐钊, 熊睿, 刘成立, 徐敏, 韦双双, 阮云泽, 汤华. 火龙果根系在淹水胁迫下的基因差异表达 . 热带生物学报, 2018, 9(3): 312-319. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2018.03.007
[18]	林贤桂, 翟金玲, 黄惜. 巴西橡胶树HbMYBs转录因子的克隆及表达分析 . 热带生物学报, 2018, 9(1): 12-20. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2018.01.002
[19]	李可, 熊茜, 肖晓蓉, 李玉敏, 牛晓磊, 李春霞, 陈银华. 木薯25个WRKY家族转录因子在生物胁迫下的表达分析 . 热带生物学报, 2017, 8(1): 14-21,28. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2017.01.003
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火龙果果肉颜色相关MYB转录因子的表达分析

doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2017.02.004

海南大学热带农林学院/海南热带生物资源可持续利用国家重点实验室培育基地, 海口 570228

基金项目:

海南省重大科技项目(ZDZX2013023)

国家自然科学基金资助项目(31360364)

作者简介:
曾灿彬(1989-),男,海南大学热带农林学院2014级硕士研究生.E-mail:zengcanb@126.com

通讯作者: 汤华(1974-),男,海南大学热带农林学院教授.研究方向:作物遗传育种与分子生物学.E-mail:th-tiger@163.com

收稿日期: 2017-01-06
修回日期: 2017-04-21

中图分类号: Q786

关键词:

转录组测序 /

MYB转录因子 /

生物信息分析

摘要: 对红肉与白肉火龙果的果实进行转录组测序,通过数据的分析与筛选,得到30个差异表达的MYB类转录因子。运用生物信息学进行了MYB转录因子序列的比对、基因注释分析、进化树分析、基因表达情况分析等,通过qRT-PCR验证,探究红肉与白肉火龙果果实颜色的代谢差异与MYB转录因子之间的调控关系。结果表明:火龙果果肉颜色差异可能受MYB转录因子家族部分成员的调控。

English Abstract

曾灿彬, 徐敏, 齐钊, 闫臻, 熊睿, 程玉, 阮云泽, 汤华. 火龙果果肉颜色相关MYB转录因子的表达分析[J]. 热带生物学报, 2017, 8(2): 153-158. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2017.02.004

引用本文:

曾灿彬, 徐敏, 齐钊, 闫臻, 熊睿, 程玉, 阮云泽, 汤华. 火龙果果肉颜色相关MYB转录因子的表达分析[J]. 热带生物学报, 2017, 8(2): 153-158. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2017.02.004

ZENG Canbin, XU Min, QI Zhao, YAN Zhen, XIONG Rui, CHENG Yu, RUAN Yunze, TANG Hua. Expression Analysis of MYB Transcription Factors Related to Flesh Color of Pitaya Fruit[J]. Journal of Tropical Biology, 2017, 8(2): 153-158. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2017.02.004

Citation:

ZENG Canbin, XU Min, QI Zhao, YAN Zhen, XIONG Rui, CHENG Yu, RUAN Yunze, TANG Hua. Expression Analysis of MYB Transcription Factors Related to Flesh Color of Pitaya Fruit[J]. Journal of Tropical Biology, 2017, 8(2): 153-158. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2017.02.004

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