多年生白木香茎干不同部位总RNA提取方法的改良

侯晓婉; 刘培卫; 孙佩文; 孟慧; 张争

doi:10.15886/j.cnki.rdswxb.2016.03.018

《中国科技核心期刊》数据库收录期刊
《中国学术期刊（光盘版）》全文收录期刊
《中文科技期刊数据库》收录期刊
《美国乌利希国际期刊指南（Ulrichsweb）》数据库收录期刊

高级检索

留言板

尊敬的读者、作者、审稿人, 关于本刊的投稿、审稿、编辑和出版的任何问题, 您可以本页添加留言。我们将尽快给您答复。谢谢您的支持!

姓名
邮箱
手机号码
标题
留言内容
验证码

多年生白木香茎干不同部位总RNA提取方法的改良

侯晓婉, 刘培卫, 孙佩文, 孟慧, 张争

文章导航 > 热带生物学报 > 2016 > 7(3): 376-380

侯晓婉, 刘培卫, 孙佩文, 孟慧, 张争. 多年生白木香茎干不同部位总RNA提取方法的改良[J]. 热带生物学报, 2016, 7(3): 376-380. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2016.03.018

引用本文:

侯晓婉, 刘培卫, 孙佩文, 孟慧, 张争. 多年生白木香茎干不同部位总RNA提取方法的改良[J]. 热带生物学报, 2016, 7(3): 376-380. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2016.03.018

HOU Xiaowan, ZHANG Peiwei, SUN Peiwen, MENG Hui, ZHANG Zheng. Improved Method for Extracting High Quality Total RNA from Different Stem Parts of Aquilaria sinensis[J]. Journal of Tropical Biology, 2016, 7(3): 376-380. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2016.03.018

Citation:

HOU Xiaowan, ZHANG Peiwei, SUN Peiwen, MENG Hui, ZHANG Zheng. Improved Method for Extracting High Quality Total RNA from Different Stem Parts of Aquilaria sinensis[J]. Journal of Tropical Biology, 2016, 7(3): 376-380. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2016.03.018

多年生白木香茎干不同部位总RNA提取方法的改良

doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2016.03.018

1. 中国热带农业科学院南亚热带作物研究所, 广东湛江 524091;
2. 中国医学科学院北京协和医学院药用植物研究所海南分所, 海口 570311;
3. 中国医学科学院北京协和医学院药用植物研究所, 北京 100193

基金项目:

教育部新世纪优秀人才支持计划项目(2008)

高等学校博士学科点专项科研基金项目(20091106120009)

北京市自然科学基金项目(6102024)

“十二五”国家科技支撑计划项(2011BAI01B07)

海南省中药现代化专项项目(2010ZY001,2012ZY002)

海南省重大科技研发专项(ZDZX20100006)

国家自然科学基金项目(31000136,81173481)

详细信息

第一作者:
侯晓婉(1987-),女,研究实习员,主要从事生物化学与分子生物学基因功能相关研究.E-mail:yimiyangguanghxw@163.com

通信作者:
张争(1979-),男,副研究员,主要从事伤害及微生物侵染诱导白木香结香研究.E-mail:zhang-zheng321@126.com

中图分类号: Q522

Improved Method for Extracting High Quality Total RNA from Different Stem Parts of Aquilaria sinensis

1. South subtropical crops research institute, Chinese academy of tropical agricultural sciences, Zhanjiang, Guangdong 524091, China;
2. Hainan Branch, Institute of Medicinal Plant Development, Chinese Academy of Medical Sciences & Peking Union Medical College, Haikou, Hainan 570311;
3. Institute of Medicinal Plant Development, Chinese Academy of Medical Sciences & Peking Union Medical College, Beijing 100193, China

摘要: 运用"通体结香"技术诱导处理10年生白木香,以处理15 d结香后的茎干白木层(H)、过渡层及结香层(A+T)为材料,对艾德莱EASY-spin plus RN38试剂盒RNA提取过程进行改良,并对比分析改良前后2种方法提取RNA质量的差异。结果表明:改良法提取的总RNA质量、纯度和完整性等均较RN38试剂盒好,其中28S和18S条带清晰无杂质污染,无降解,A₂₆₀/A₂₈₀接近2.0,RIN值大于6。说明改良后的方法适用于多年生白木香不同结香部位总RNA的提取,能满足转录组数据分析。
- 白木香 /
- 结香部位 /
- 通体结香 /
- 总RNA提取 /
- 茎干
Abstract: A ten-year-old plant of agarwood（ Aquilaria sinensis） was induced by liquid transfusion technology,using healthy layer,transition and agarwood layers of the stems transfusion treated for 15 days as materials. Aidlab EASY-spin plus RN38 RNA extraction kits was modified in many key steps to improve the total RNA product qualities which were analyzed and then compared with those of the unmodified RNA extraction method. The results showed that the total RNA extracted by the modified RNA extraction method had better quality,purity and integrity than that of the unmodified method,in which the 28 S and 18 S bands were more legible with no impurity nor degradation,A₂₆₀/ A₂₈₀ was approximated to 2. 0,and the RIN greater than 6. This suggests that the modified method for extracting total RNA in different A. sinensis tissues transfusion treated produces high quality total RNA which can be used for transcriptome data analysis.
- Aquilaria sinensis /
- agarwood layer /
- liquid transfusion treatment /
- total RNA extraction /
- stem

[1]	刘珍, 王祝年, 王茂媛, 汤欢. 不同生长年份牛大力根部总皂苷的含量测定与抗氧化活性研究 . 热带生物学报, 2025, 16(): 1-8. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.20240088
[2]	周向荣, 江定心. 白纹伊蚊对四氟甲醚菊酯抗性适合度代价分析 . 热带生物学报, 2025, 16(3): 343-348. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.20240152
[3]	陈媚, 张荣萍, 高玲, 刘迪发, 徐丽, 冯红玉, 赵亚南. 不同农用酵素对百香果品质及产量的影响 . 热带生物学报, 2025, 16(): 1-8. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.20250008
[4]	李香凝, 赵瑾, 李东栋, 郑育声. 槟榔愈伤中槟榔碱的提取方法 . 热带生物学报, 2024, 15(1): 36-41. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.20230038
[5]	吉南焕, 侯耀辉, 王开济, 赖杭桂, 庞真真. 不同施肥模式对越南油茶饼的总多酚含量和抗氧化活性的影响 . 热带生物学报, 2024, 15(2): 165-170. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.20220045
[6]	童立豪, 黄良夫, 吴翔宇, 石耀华, 唐贤明. 切段部位、长度和培养温度对琼枝藻繁殖的影响 . 热带生物学报, 2024, 15(3): 361-367. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.20230102
[7]	王龙仁, 曾军, 刘双龙, 王雅丽, 孙会举, 王熙, 杨福孙, 戴好富. 白木香人工结香初期营养元素及叶片叶绿素含量的变化 . 热带生物学报, 2021, 12(3): 326-332. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2021.03.008
[8]	李祥燕, 郑妍妍, 侯志文, 张欢, 廖飞雄. 白掌叶片生长定量分析与生长模型的构建 . 热带生物学报, 2020, 11(4): 461-469. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2020.04.009
[9]	沈恬安, 杨德友, 骆焱平, 王兰英. 单叶蔓荆子提取物的抑菌活性 . 热带生物学报, 2019, 10(3): 222-225. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2019.03.002
[10]	潘英文, 张凌, 王安石, 李佳潼, 谢添伟, 陈施明, 刘福秀, 林明光. 濒危兰科植物DNA的提取方法 . 热带生物学报, 2019, 10(1): 94-98. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2019.01.016
[11]	宋佳昱, 杨小波, 李东海, 张丽, 高博钰. 海南白石岭野生植物的调查及其园林价值 . 热带生物学报, 2019, 10(4): 406-416. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2019.04.015
[12]	陈品品, 陈日忠, 吴辉煌, 林文忠, 马晓娟, 刘靓, 庄卫东. 白木香不同结香方法所得沉香的精油成分分析 . 热带生物学报, 2019, 10(2): 190-196. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2019.02.015
[13]	陆露, 蒋细旺. 白妙樱的组织培养和快速繁殖 . 热带生物学报, 2018, 9(3): 333-338. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2018.03.010
[14]	王宇光, 王军, 杨锦玲, 梅文莉, 戴好富. 白木香天然虫漏和人工砍伤所产沉香的GC-MS分析 . 热带生物学报, 2017, 8(4): 459-465. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2017.04.014
[15]	梁振益, 嵇莎莎, 陈祎平, 林昭华, 刘平怀. 双水相体系萃取油楠种子总皂苷的研究 . 热带生物学报, 2016, 7(2): 270-273. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2016.02.022
[16]	谢冬惠, 徐静, 李治明, 梁振益. 小叶榕气生根总酚酸和总黄酮含量测定及其抗氧化活性比较 . 热带生物学报, 2016, 7(3): 373-375. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2016.03.017
[17]	郑云柯, 胡翔宇, 宋希强, 王健. 石斛属植物基因组DNA提取方法的对比 . 热带生物学报, 2015, 6(2): 168-172. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2015.02.011
[18]	蔡彩虹, 梅文莉, 王辉, 董文化, 谭光宏, 戴好富. 钩枝藤提取物的生物活性 . 热带生物学报, 2015, 6(2): 163-167. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2015.02.010
[19]	范玉龙, 姜达, 李明容, 黄惜, 夏志辉. 适合于高通量测序的槟榔总RNA的提取方法 . 热带生物学报, 2015, 6(1): 87-90. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2015.01.013
[20]	杨锦玲, 梅文莉, 李薇, 余海谦, 左文健, 戴好富. 国产沉香TLC的指纹图谱分析 . 热带生物学报, 2015, 6(2): 189-196. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2015.02.014

点击查看大图

计量

文章访问数: 2
HTML全文浏览量: 0
PDF下载量: 0
被引次数: 0

多年生白木香茎干不同部位总RNA提取方法的改良

doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2016.03.018

1. 中国热带农业科学院南亚热带作物研究所, 广东湛江 524091;

2. 中国医学科学院北京协和医学院药用植物研究所海南分所, 海口 570311;

3. 中国医学科学院北京协和医学院药用植物研究所, 北京 100193

基金项目:

教育部新世纪优秀人才支持计划项目(2008)

高等学校博士学科点专项科研基金项目(20091106120009)

北京市自然科学基金项目(6102024)

“十二五”国家科技支撑计划项(2011BAI01B07)

海南省中药现代化专项项目(2010ZY001,2012ZY002)

海南省重大科技研发专项(ZDZX20100006)

国家自然科学基金项目(31000136,81173481)

作者简介:
侯晓婉(1987-),女,研究实习员,主要从事生物化学与分子生物学基因功能相关研究.E-mail:yimiyangguanghxw@163.com

通讯作者: 张争(1979-),男,副研究员,主要从事伤害及微生物侵染诱导白木香结香研究.E-mail:zhang-zheng321@126.com

收稿日期: 2016-01-16

中图分类号: Q522

关键词:

白木香 /

摘要: 运用"通体结香"技术诱导处理10年生白木香,以处理15 d结香后的茎干白木层(H)、过渡层及结香层(A+T)为材料,对艾德莱EASY-spin plus RN38试剂盒RNA提取过程进行改良,并对比分析改良前后2种方法提取RNA质量的差异。结果表明:改良法提取的总RNA质量、纯度和完整性等均较RN38试剂盒好,其中28S和18S条带清晰无杂质污染,无降解,A₂₆₀/A₂₈₀接近2.0,RIN值大于6。说明改良后的方法适用于多年生白木香不同结香部位总RNA的提取,能满足转录组数据分析。

English Abstract

Improved Method for Extracting High Quality Total RNA from Different Stem Parts of Aquilaria sinensis

1. South subtropical crops research institute, Chinese academy of tropical agricultural sciences, Zhanjiang, Guangdong 524091, China;

2. Hainan Branch, Institute of Medicinal Plant Development, Chinese Academy of Medical Sciences & Peking Union Medical College, Haikou, Hainan 570311;

3. Institute of Medicinal Plant Development, Chinese Academy of Medical Sciences & Peking Union Medical College, Beijing 100193, China

Received Date: 2016-01-16

Keywords:

Abstract: A ten-year-old plant of agarwood（ Aquilaria sinensis） was induced by liquid transfusion technology,using healthy layer,transition and agarwood layers of the stems transfusion treated for 15 days as materials. Aidlab EASY-spin plus RN38 RNA extraction kits was modified in many key steps to improve the total RNA product qualities which were analyzed and then compared with those of the unmodified RNA extraction method. The results showed that the total RNA extracted by the modified RNA extraction method had better quality,purity and integrity than that of the unmodified method,in which the 28 S and 18 S bands were more legible with no impurity nor degradation,A₂₆₀/ A₂₈₀ was approximated to 2. 0,and the RIN greater than 6. This suggests that the modified method for extracting total RNA in different A. sinensis tissues transfusion treated produces high quality total RNA which can be used for transcriptome data analysis.

侯晓婉, 刘培卫, 孙佩文, 孟慧, 张争. 多年生白木香茎干不同部位总RNA提取方法的改良[J]. 热带生物学报, 2016, 7(3): 376-380. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2016.03.018

引用本文:

侯晓婉, 刘培卫, 孙佩文, 孟慧, 张争. 多年生白木香茎干不同部位总RNA提取方法的改良[J]. 热带生物学报, 2016, 7(3): 376-380. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2016.03.018

Citation:

全文HTML

下载: 全尺寸图片幻灯片

返回文章

用微信扫码二维码

分享至好友和朋友圈

x 关闭永久关闭

《热带生物学报》编辑部参与2025年热区高校联盟年会

留言板

多年生白木香茎干不同部位总RNA提取方法的改良

doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2016.03.018

第一作者: 侯晓婉(1987-),女,研究实习员,主要从事生物化学与分子生物学基因功能相关研究.E-mail:yimiyangguanghxw@163.com

通信作者: 张争(1979-),男,副研究员,主要从事伤害及微生物侵染诱导白木香结香研究.E-mail:zhang-zheng321@126.com

Improved Method for Extracting High Quality Total RNA from Different Stem Parts of Aquilaria sinensis

计量

出版历程

多年生白木香茎干不同部位总RNA提取方法的改良

doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2016.03.018

1. 中国热带农业科学院南亚热带作物研究所, 广东湛江 524091; 2. 中国医学科学院北京协和医学院药用植物研究所海南分所, 海口 570311; 3. 中国医学科学院北京协和医学院药用植物研究所, 北京 100193

作者简介: 侯晓婉(1987-),女,研究实习员,主要从事生物化学与分子生物学基因功能相关研究.E-mail:yimiyangguanghxw@163.com

通讯作者: 张争(1979-),男,副研究员,主要从事伤害及微生物侵染诱导白木香结香研究.E-mail:zhang-zheng321@126.com

English Abstract

Improved Method for Extracting High Quality Total RNA from Different Stem Parts of Aquilaria sinensis

全文HTML

目录

第一作者:
侯晓婉(1987-),女,研究实习员,主要从事生物化学与分子生物学基因功能相关研究.E-mail:yimiyangguanghxw@163.com

通信作者:
张争(1979-),男,副研究员,主要从事伤害及微生物侵染诱导白木香结香研究.E-mail:zhang-zheng321@126.com

1. 中国热带农业科学院南亚热带作物研究所, 广东湛江 524091;

2. 中国医学科学院北京协和医学院药用植物研究所海南分所, 海口 570311;

3. 中国医学科学院北京协和医学院药用植物研究所, 北京 100193

作者简介:
侯晓婉(1987-),女,研究实习员,主要从事生物化学与分子生物学基因功能相关研究.E-mail:yimiyangguanghxw@163.com