多年生白木香茎干不同部位总RNA提取方法的改良

侯晓婉; 刘培卫; 孙佩文; 孟慧; 张争

doi:10.15886/j.cnki.rdswxb.2016.03.018

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多年生白木香茎干不同部位总RNA提取方法的改良

侯晓婉, 刘培卫, 孙佩文, 孟慧, 张争

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侯晓婉, 刘培卫, 孙佩文, 孟慧, 张争. 多年生白木香茎干不同部位总RNA提取方法的改良[J]. 热带生物学报（中英文）, 2016, 7(3): 376-380. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2016.03.018

引用本文:

HOU Xiaowan, ZHANG Peiwei, SUN Peiwen, MENG Hui, ZHANG Zheng. Improved Method for Extracting High Quality Total RNA from Different Stem Parts of Aquilaria sinensis[J]. Journal of Tropical Biology, 2016, 7(3): 376-380. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2016.03.018

Citation:

HOU Xiaowan, ZHANG Peiwei, SUN Peiwen, MENG Hui, ZHANG Zheng. Improved Method for Extracting High Quality Total RNA from Different Stem Parts of Aquilaria sinensis[J]. Journal of Tropical Biology, 2016, 7(3): 376-380. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2016.03.018

多年生白木香茎干不同部位总RNA提取方法的改良

DOI: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2016.03.018

1. 中国热带农业科学院南亚热带作物研究所, 广东湛江 524091;
2. 中国医学科学院北京协和医学院药用植物研究所海南分所, 海口 570311;
3. 中国医学科学院北京协和医学院药用植物研究所, 北京 100193

基金项目:

教育部新世纪优秀人才支持计划项目(2008)

高等学校博士学科点专项科研基金项目(20091106120009)

北京市自然科学基金项目(6102024)

“十二五”国家科技支撑计划项(2011BAI01B07)

海南省中药现代化专项项目(2010ZY001,2012ZY002)

海南省重大科技研发专项(ZDZX20100006)

国家自然科学基金项目(31000136,81173481)

详细信息

第一作者:
侯晓婉(1987-),女,研究实习员,主要从事生物化学与分子生物学基因功能相关研究.E-mail:yimiyangguanghxw@163.com

通信作者:
张争(1979-),男,副研究员,主要从事伤害及微生物侵染诱导白木香结香研究.E-mail:zhang-zheng321@126.com

中图分类号: Q522

Improved Method for Extracting High Quality Total RNA from Different Stem Parts of Aquilaria sinensis

1. South subtropical crops research institute, Chinese academy of tropical agricultural sciences, Zhanjiang, Guangdong 524091, China;
2. Hainan Branch, Institute of Medicinal Plant Development, Chinese Academy of Medical Sciences & Peking Union Medical College, Haikou, Hainan 570311;
3. Institute of Medicinal Plant Development, Chinese Academy of Medical Sciences & Peking Union Medical College, Beijing 100193, China

摘要: 运用"通体结香"技术诱导处理10年生白木香,以处理15 d结香后的茎干白木层(H)、过渡层及结香层(A+T)为材料,对艾德莱EASY-spin plus RN38试剂盒RNA提取过程进行改良,并对比分析改良前后2种方法提取RNA质量的差异。结果表明:改良法提取的总RNA质量、纯度和完整性等均较RN38试剂盒好,其中28S和18S条带清晰无杂质污染,无降解,A₂₆₀/A₂₈₀接近2.0,RIN值大于6。说明改良后的方法适用于多年生白木香不同结香部位总RNA的提取,能满足转录组数据分析。
- 白木香 /
- 结香部位 /
- 通体结香 /
- 总RNA提取 /
- 茎干
Abstract: A ten-year-old plant of agarwood（ Aquilaria sinensis） was induced by liquid transfusion technology,using healthy layer,transition and agarwood layers of the stems transfusion treated for 15 days as materials. Aidlab EASY-spin plus RN38 RNA extraction kits was modified in many key steps to improve the total RNA product qualities which were analyzed and then compared with those of the unmodified RNA extraction method. The results showed that the total RNA extracted by the modified RNA extraction method had better quality,purity and integrity than that of the unmodified method,in which the 28 S and 18 S bands were more legible with no impurity nor degradation,A₂₆₀/ A₂₈₀ was approximated to 2. 0,and the RIN greater than 6. This suggests that the modified method for extracting total RNA in different A. sinensis tissues transfusion treated produces high quality total RNA which can be used for transcriptome data analysis.
- Aquilaria sinensis /
- agarwood layer /
- liquid transfusion treatment /
- total RNA extraction /
- stem

[1]	朱思奇, 段继煜, 唐亮. 龙脑香科青梅小尺度空间遗传结构研究 . 热带生物学报（中英文）, 2026, 17(5): 905-914. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.20250182
[2]	陈媚, 张荣萍, 高玲, 刘迪发, 徐丽, 冯红玉, 赵亚南. 不同农用酵素对百香果品质及产量的影响 . 热带生物学报（中英文）, 2026, 17(1): 49-56. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.20250008
[3]	许恬, 莫丽文, 杨泉光, 黄怡婷, 李德祥. 篦齿苏铁古树群雌雄株茎干特征分析 . 热带生物学报（中英文）, 2026, 17(1): 128-135. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.20250053
[4]	毛珺旸, 向婷, 魏二强, 王建华, 李薇, 曾军, 戴好富. 不同白木香种质表型性状遗传多样性分析 . 热带生物学报（中英文）, 2026, 17(): 1-13. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.20250200
[5]	刘月阳, 郭冬, 王颖, 吴文丽, 李玉姬, 徐诗涛, 朱家红. 白木香AsABCG1基因的克隆与表达分析 . 热带生物学报（中英文）, 2026, 17(3): 422-430. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.20250126
[6]	徐国良, 黄念钧, 曾晓辉, 许国燕, 周志光. 江西唇形科一新变种——腺毛裂苞香科科 . 热带生物学报（中英文）, 2025, 16(5): 738-742. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.20240150
[7]	暴正瀚, 樊小红, 马天娇, 孟慧, 魏建和, 吕菲菲, 杨云. 白木香奇楠种质CNTPS18基因克隆及伤害诱导表达分析 . 热带生物学报（中英文）, 2025, 16(6): 855-864. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.20250078
[8]	童立豪, 黄良夫, 吴翔宇, 石耀华, 唐贤明. 切段部位、长度和培养温度对琼枝藻繁殖的影响 . 热带生物学报（中英文）, 2024, 15(3): 361-367. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.20230102
[9]	王龙仁, 曾军, 刘双龙, 王雅丽, 孙会举, 王熙, 杨福孙, 戴好富. 白木香人工结香初期营养元素及叶片叶绿素含量的变化 . 热带生物学报（中英文）, 2021, 12(3): 326-332. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2021.03.008
[10]	宋佳昱, 杨小波, 李东海, 张丽, 高博钰. 海南白石岭野生植物的调查及其园林价值 . 热带生物学报（中英文）, 2019, 10(4): 406-416. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2019.04.015
[11]	陈品品, 陈日忠, 吴辉煌, 林文忠, 马晓娟, 刘靓, 庄卫东. 白木香不同结香方法所得沉香的精油成分分析 . 热带生物学报（中英文）, 2019, 10(2): 190-196. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2019.02.015
[12]	陆露, 蒋细旺. 白妙樱的组织培养和快速繁殖 . 热带生物学报（中英文）, 2018, 9(3): 333-338. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2018.03.010
[13]	梁鹏, 李响, 何其光, 刘文波, 缪卫国, 郑服丛. 橡胶树白粉病菌在疏水介质表面的侵染特征和RNA提取 . 热带生物学报（中英文）, 2017, 8(2): 147-152,167. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2017.02.003
[14]	程华民, 杨婷寒, 项楠, 赵洪伟, 周海龙, 刁晓平. 不同方法提取珊瑚总蛋白质的比较 . 热带生物学报（中英文）, 2017, 8(2): 225-231. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2017.02.017
[15]	王宇光, 王军, 杨锦玲, 梅文莉, 戴好富. 白木香天然虫漏和人工砍伤所产沉香的GC-MS分析 . 热带生物学报（中英文）, 2017, 8(4): 459-465. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2017.04.014
[16]	范玉龙, 姜达, 李明容, 黄惜, 夏志辉. 适合于高通量测序的槟榔总RNA的提取方法 . 热带生物学报（中英文）, 2015, 6(1): 87-90. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2015.01.013
[17]	杨锦玲, 梅文莉, 李薇, 余海谦, 左文健, 戴好富. 国产沉香TLC的指纹图谱分析 . 热带生物学报（中英文）, 2015, 6(2): 189-196. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2015.02.014
[18]	彭军, 黄俊生. 植物内源小RNA及其介导的基因沉默途径 . 热带生物学报（中英文）, 2011, 2(2): 187-192. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2011.02.002
[19]	袁媛, 庞玉新, 王文全, 张影波, 俞敬波. 中国艾纳香属植物资源调查 . 热带生物学报（中英文）, 2011, 2(1): 78-82. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2011.01.011
[20]	王甲水, 张建斌, 贾彩虹, 刘菊华, 金志强. 一种适合香蕉根系总RNA提取的方法 . 热带生物学报（中英文）, 2010, 1(3): 202-205,209. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2010.03.009

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多年生白木香茎干不同部位总RNA提取方法的改良

DOI: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2016.03.018

1. 中国热带农业科学院南亚热带作物研究所, 广东湛江 524091;

2. 中国医学科学院北京协和医学院药用植物研究所海南分所, 海口 570311;

3. 中国医学科学院北京协和医学院药用植物研究所, 北京 100193

基金项目:

教育部新世纪优秀人才支持计划项目(2008)

高等学校博士学科点专项科研基金项目(20091106120009)

北京市自然科学基金项目(6102024)

“十二五”国家科技支撑计划项(2011BAI01B07)

海南省中药现代化专项项目(2010ZY001,2012ZY002)

海南省重大科技研发专项(ZDZX20100006)

国家自然科学基金项目(31000136,81173481)

作者简介:
侯晓婉(1987-),女,研究实习员,主要从事生物化学与分子生物学基因功能相关研究.E-mail:yimiyangguanghxw@163.com

通讯作者: 张争(1979-),男,副研究员,主要从事伤害及微生物侵染诱导白木香结香研究.E-mail:zhang-zheng321@126.com

收稿日期: 2016-01-16

中图分类号: Q522

关键词:

白木香 /

摘要: 运用"通体结香"技术诱导处理10年生白木香,以处理15 d结香后的茎干白木层(H)、过渡层及结香层(A+T)为材料,对艾德莱EASY-spin plus RN38试剂盒RNA提取过程进行改良,并对比分析改良前后2种方法提取RNA质量的差异。结果表明:改良法提取的总RNA质量、纯度和完整性等均较RN38试剂盒好,其中28S和18S条带清晰无杂质污染,无降解,A₂₆₀/A₂₈₀接近2.0,RIN值大于6。说明改良后的方法适用于多年生白木香不同结香部位总RNA的提取,能满足转录组数据分析。

English Abstract

Improved Method for Extracting High Quality Total RNA from Different Stem Parts of Aquilaria sinensis

1. South subtropical crops research institute, Chinese academy of tropical agricultural sciences, Zhanjiang, Guangdong 524091, China;

2. Hainan Branch, Institute of Medicinal Plant Development, Chinese Academy of Medical Sciences & Peking Union Medical College, Haikou, Hainan 570311;

3. Institute of Medicinal Plant Development, Chinese Academy of Medical Sciences & Peking Union Medical College, Beijing 100193, China

Received Date: 2016-01-16

Keywords:

Abstract: A ten-year-old plant of agarwood（ Aquilaria sinensis） was induced by liquid transfusion technology,using healthy layer,transition and agarwood layers of the stems transfusion treated for 15 days as materials. Aidlab EASY-spin plus RN38 RNA extraction kits was modified in many key steps to improve the total RNA product qualities which were analyzed and then compared with those of the unmodified RNA extraction method. The results showed that the total RNA extracted by the modified RNA extraction method had better quality,purity and integrity than that of the unmodified method,in which the 28 S and 18 S bands were more legible with no impurity nor degradation,A₂₆₀/ A₂₈₀ was approximated to 2. 0,and the RIN greater than 6. This suggests that the modified method for extracting total RNA in different A. sinensis tissues transfusion treated produces high quality total RNA which can be used for transcriptome data analysis.

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多年生白木香茎干不同部位总RNA提取方法的改良

DOI: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2016.03.018

第一作者: 侯晓婉(1987-),女,研究实习员,主要从事生物化学与分子生物学基因功能相关研究.E-mail:yimiyangguanghxw@163.com

通信作者: 张争(1979-),男,副研究员,主要从事伤害及微生物侵染诱导白木香结香研究.E-mail:zhang-zheng321@126.com

Improved Method for Extracting High Quality Total RNA from Different Stem Parts of Aquilaria sinensis

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多年生白木香茎干不同部位总RNA提取方法的改良

DOI: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2016.03.018

1. 中国热带农业科学院南亚热带作物研究所, 广东湛江 524091; 2. 中国医学科学院北京协和医学院药用植物研究所海南分所, 海口 570311; 3. 中国医学科学院北京协和医学院药用植物研究所, 北京 100193

作者简介: 侯晓婉(1987-),女,研究实习员,主要从事生物化学与分子生物学基因功能相关研究.E-mail:yimiyangguanghxw@163.com

通讯作者: 张争(1979-),男,副研究员,主要从事伤害及微生物侵染诱导白木香结香研究.E-mail:zhang-zheng321@126.com

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Improved Method for Extracting High Quality Total RNA from Different Stem Parts of Aquilaria sinensis

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第一作者:
侯晓婉(1987-),女,研究实习员,主要从事生物化学与分子生物学基因功能相关研究.E-mail:yimiyangguanghxw@163.com

通信作者:
张争(1979-),男,副研究员,主要从事伤害及微生物侵染诱导白木香结香研究.E-mail:zhang-zheng321@126.com

1. 中国热带农业科学院南亚热带作物研究所, 广东湛江 524091;

2. 中国医学科学院北京协和医学院药用植物研究所海南分所, 海口 570311;

3. 中国医学科学院北京协和医学院药用植物研究所, 北京 100193

作者简介:
侯晓婉(1987-),女,研究实习员,主要从事生物化学与分子生物学基因功能相关研究.E-mail:yimiyangguanghxw@163.com