海南岛华石斛根部可培养的共生细菌的多样性

李骜; 宋希强

doi:10.15886/j.cnki.rdswxb.2015.03.010

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海南岛华石斛根部可培养的共生细菌的多样性

李骜, 宋希强

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李骜, 宋希强. 海南岛华石斛根部可培养的共生细菌的多样性[J]. 热带生物学报（中英文）, 2015, 6(3): 279-284. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2015.03.010

引用本文:

李骜, 宋希强. 海南岛华石斛根部可培养的共生细菌的多样性[J]. 热带生物学报（中英文）, 2015, 6(3): 279-284. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2015.03.010

LI Ao, SONG Xiqiang. Diversity of Culturable Endophytic Bacteria Isolated from the Roots of Dendrobium sinense（ Orchidaceae） Inhabiting Hainan Island[J]. Journal of Tropical Biology, 2015, 6(3): 279-284. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2015.03.010

Citation:

LI Ao, SONG Xiqiang. Diversity of Culturable Endophytic Bacteria Isolated from the Roots of Dendrobium sinense（ Orchidaceae） Inhabiting Hainan Island[J]. Journal of Tropical Biology, 2015, 6(3): 279-284. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2015.03.010

海南岛华石斛根部可培养的共生细菌的多样性

DOI: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2015.03.010

李骜,
宋希强^,

海南大学园艺园林学院/热带作物种质资源保护与开发利用教育部重点实验室, 海南海口 570228

基金项目:

国家自然科学基金(31160178)

海南省自然科学基金(314051)

详细信息

第一作者:
李骜(1990-),女,海南大学园艺园林学院2012级硕士研究生.E-mail:liningao@126.com

通信作者:
宋希强(1972-),男,教授,博士.研究方向:园林植物资源与利用.E-mail:song.strong@163.com

中图分类号: Q938.1⁺5

Diversity of Culturable Endophytic Bacteria Isolated from the Roots of Dendrobium sinense（ Orchidaceae） Inhabiting Hainan Island

LI Ao,
SONG Xiqiang^,

College of Horticulture and Landscape Architecture/Key Laboratory of Protection, Development and Utilization of Tropical Crop Germplasm Resources, Hainan university, Haikou 571737, China

摘要: 采集3个居群的野生华石斛根系,从中分离到130株内生细菌,并对细菌进行16S r DNA序列谱系分析,结果表明:华石斛根部内生细菌主要有:芽孢杆菌属(Bacillus)、伯克氏菌属(Burkholderia)、泛菌属(Pantoea)、肠杆菌属(Enterobacter)、藤黄杆菌属(Luteibacter)、沙雷氏菌属(Serratia)和西地西菌属(Cedecea)7个属的15个种。其中优势类群为Bacillus,次优势类群为Enterobacter和Burkholderia。优势内生细菌Bacillus spp.在3个不同的居群华石斛根部均有出现,且频率相近。环境因子差异最大、附生宿主组成最相近的霸王岭与吊罗山之间,华石斛根部内生细菌群落物种组成相似性最高。说明附生宿主植物差异是附生植物根部内生细菌物种组成差异的重要驱动因子。
- 内生细菌 /
- 多样性 /
- 相似性系数 /
- 芽孢杆菌 /
- 华石斛居群
Abstract: Endophytic bacteria are equally important as mycorrhizal fungi for orchid plant species in the ecological process of seed germination and seedling establishment. To investigate diversity of endophytic bacteria associated with Dendrobium sinense,inhabiting tropical forest in Hainan Island,root samples were collected for bacteria culturing,DNA extraction,16 S rDNA amplification,and sequencing. A total of 130 strains of endophytic bacteria were isolated from the roots of D. sinense in Jianfengling,Bawangling and Diaoluoshan mountains. Phylogenetic analysis of 16 S rDNA sequences revealed that the roots-associated endophytic bacteria community was comprised of 15 species of 7 genera: Bacillus,Burkholderia,Pantoea,Enterobacter,Luteibacter,Serratia and Cedecea. Of these bacteria,Bacillus is the most frequently isolated endophytic bacterium,followed by Enterobacter and Burkholderia. All the Bacillus spp. occurred in the three habitats at a roughly equal frequency. Compositional similarity of endophytic bacterial community associated with D. sinense is highest in between the Bawangling and Diaoluoshan mountains,where similarity is lowest in their environmental factors but highest in their host plant species composition is highest in similarity. This suggests that the difference in host plants is responsible for the difference in endophytic bacterial species composition of the roots of the host plants.
- endophytic bacteria /
- diversity /
- similarity coefficient /
- Bacillus /
- Dendrobium sinense populations

[1]	汪心雨, 孙明凯, 谢佳, 张洁, 张太宇, 郭雨昭, 范咏梅. 生防菌 FCA-1 的分离、鉴定及其对草地贪夜蛾肠道菌群多样性的影响 . 热带生物学报（中英文）, 2026, 17(4): 627-637. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.20250094
[2]	陈逸, 孙浩晏, 侯若楠, 吴晴晴, 吴玲兵. 海南热带雨林国家公园霸王岭片区蝴蝶多样性海拔梯度格局及影响因子 . 热带生物学报（中英文）, 2026, 17(): 1-9. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.20250173
[3]	刘辉曜, 罗天雄, 王玲, 杨福孙. 金钗石斛菌根真菌和内生细菌自然共生关系探究 . 热带生物学报（中英文）, 2025, 16(2): 243-253. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.20240098
[4]	罗竹慧, 吴春玲, 王艳丽, 李萃玲, 万玲, 丁琼. 宿主身份与叶性状对海南热带山地雨林樟科和壳斗科植物叶内生真菌群落的影响 . 热带生物学报（中英文）, 2024, 15(1): 52-59. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.20220109
[5]	冯亚亭, 张逸杰, 林南方, 陈银华, 骆凯. 木薯不同组织内生细菌多样性的比较分析 . 热带生物学报（中英文）, 2024, 15(2): 141-149. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.20230077
[6]	林祺英, 李芳, 蔡汝鹏, 张蕾, 黎瑶, 李焕苓, 王家保. 海南荔枝资源叶片性状多样性分析 . 热带生物学报（中英文）, 2023, 14(6): 628-635. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.20220126
[7]	左世友, 朱美惠, 詹震霖, 王华锋. 海南嘉宝果种质资源多样性分析 . 热带生物学报（中英文）, 2023, 14(5): 530-535. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.20220070
[8]	方发之, 吴二焕, 桂慧颖. 海南滨海盐生植物资源与多样性 . 热带生物学报（中英文）, 2023, 14(4): 347-356. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2023.04.001
[9]	陈燕艳, 徐诗涛, 王德立, 王军, 周元元, 侯祥文. 不同种植地胆木根际的细菌群落结构和多样性 . 热带生物学报（中英文）, 2022, 13(5): 488-495. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2022.05.009
[10]	陈皓祥, 邓益琴, 程长洪, 马红玲, 郭志勋, 冯娟. 养殖池塘14株芽孢杆菌的分离鉴定及抑菌效果 . 热带生物学报（中英文）, 2022, 13(6): 605-613. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2022.06.010
[11]	陈耀丽, 俞龙春, 钱悦, 宋希强, 张哲. 大尖囊蝴蝶兰内生真菌和细菌的分离与鉴定 . 热带生物学报（中英文）, 2019, 10(4): 372-379. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2019.04.011
[12]	吴川良, 李长青, 张文勇, 耿涛年, 李颖, 刘亚星, 田晶晶. 三亚国家级珊瑚礁自然保护区珊瑚礁资源的多样性 . 热带生物学报（中英文）, 2019, 10(1): 14-21. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2019.01.003
[13]	王童欣, 戚山江, 宋希强, 孟千万, 于旭东. 华石斛种群动态与繁殖策略的相关性分析 . 热带生物学报（中英文）, 2018, 9(2): 189-197. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2018.02.010
[14]	肖贝文, 叶琳雄, 胡荣, 王岩, 周裕云, 李加慧. 海南南丽湖国家湿地公园蝴蝶种类及区系分析 . 热带生物学报（中英文）, 2017, 8(3): 341-347. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2017.03.015
[15]	胡亚强, 丁敬敬, 黄勃, 杨湘勤, 刘富欣, 马坤. 东寨港红树林夏冬季浮游动物的多样性 . 热带生物学报（中英文）, 2016, 7(1): 23-29. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2016.01.004
[16]	张芳芳, 宋希强, 丁琼, 朱国鹏. 五唇兰根部内生细菌的筛选及其促生活性 . 热带生物学报（中英文）, 2015, 6(3): 285-292. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2015.03.011
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[18]	彭铁成, 徐芳, 罗静瑶, 陈云云, 汤华. 基于叶绿体基因的香蕉遗传多样性研究 . 热带生物学报（中英文）, 2012, 3(4): 293-297. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2012.04.013
[19]	冯尔辉, 陈伟, 廖宝文, 李华亮, 陈玉军, 黄勃. 海南东寨港红树林湿地鸟类监测与研究 . 热带生物学报（中英文）, 2012, 3(1): 73-77. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2012.01.003
[20]	彭军, 黄俊生. 植物内源小RNA及其介导的基因沉默途径 . 热带生物学报（中英文）, 2011, 2(2): 187-192. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2011.02.002

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海南岛华石斛根部可培养的共生细菌的多样性

DOI: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2015.03.010

李骜,
宋希强^,

海南大学园艺园林学院/热带作物种质资源保护与开发利用教育部重点实验室, 海南海口 570228

基金项目:

国家自然科学基金(31160178)

海南省自然科学基金(314051)

作者简介:
李骜(1990-),女,海南大学园艺园林学院2012级硕士研究生.E-mail:liningao@126.com

通讯作者: 宋希强(1972-),男,教授,博士.研究方向:园林植物资源与利用.E-mail:song.strong@163.com

收稿日期: 2015-04-14

中图分类号: Q938.1⁺5

关键词:

多样性 /

摘要: 采集3个居群的野生华石斛根系,从中分离到130株内生细菌,并对细菌进行16S r DNA序列谱系分析,结果表明:华石斛根部内生细菌主要有:芽孢杆菌属(Bacillus)、伯克氏菌属(Burkholderia)、泛菌属(Pantoea)、肠杆菌属(Enterobacter)、藤黄杆菌属(Luteibacter)、沙雷氏菌属(Serratia)和西地西菌属(Cedecea)7个属的15个种。其中优势类群为Bacillus,次优势类群为Enterobacter和Burkholderia。优势内生细菌Bacillus spp.在3个不同的居群华石斛根部均有出现,且频率相近。环境因子差异最大、附生宿主组成最相近的霸王岭与吊罗山之间,华石斛根部内生细菌群落物种组成相似性最高。说明附生宿主植物差异是附生植物根部内生细菌物种组成差异的重要驱动因子。

English Abstract

Diversity of Culturable Endophytic Bacteria Isolated from the Roots of Dendrobium sinense（ Orchidaceae） Inhabiting Hainan Island

LI Ao,
SONG Xiqiang^,

College of Horticulture and Landscape Architecture/Key Laboratory of Protection, Development and Utilization of Tropical Crop Germplasm Resources, Hainan university, Haikou 571737, China

Received Date: 2015-04-14

Keywords:

Abstract: Endophytic bacteria are equally important as mycorrhizal fungi for orchid plant species in the ecological process of seed germination and seedling establishment. To investigate diversity of endophytic bacteria associated with Dendrobium sinense,inhabiting tropical forest in Hainan Island,root samples were collected for bacteria culturing,DNA extraction,16 S rDNA amplification,and sequencing. A total of 130 strains of endophytic bacteria were isolated from the roots of D. sinense in Jianfengling,Bawangling and Diaoluoshan mountains. Phylogenetic analysis of 16 S rDNA sequences revealed that the roots-associated endophytic bacteria community was comprised of 15 species of 7 genera: Bacillus,Burkholderia,Pantoea,Enterobacter,Luteibacter,Serratia and Cedecea. Of these bacteria,Bacillus is the most frequently isolated endophytic bacterium,followed by Enterobacter and Burkholderia. All the Bacillus spp. occurred in the three habitats at a roughly equal frequency. Compositional similarity of endophytic bacterial community associated with D. sinense is highest in between the Bawangling and Diaoluoshan mountains,where similarity is lowest in their environmental factors but highest in their host plant species composition is highest in similarity. This suggests that the difference in host plants is responsible for the difference in endophytic bacterial species composition of the roots of the host plants.

李骜, 宋希强. 海南岛华石斛根部可培养的共生细菌的多样性[J]. 热带生物学报（中英文）, 2015, 6(3): 279-284. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2015.03.010

引用本文:

李骜, 宋希强. 海南岛华石斛根部可培养的共生细菌的多样性[J]. 热带生物学报（中英文）, 2015, 6(3): 279-284. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2015.03.010

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DOI: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2015.03.010

第一作者: 李骜(1990-),女,海南大学园艺园林学院2012级硕士研究生.E-mail:liningao@126.com

通信作者: 宋希强(1972-),男,教授,博士.研究方向:园林植物资源与利用.E-mail:song.strong@163.com

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海南岛华石斛根部可培养的共生细菌的多样性

DOI: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2015.03.010

海南大学园艺园林学院/热带作物种质资源保护与开发利用教育部重点实验室, 海南海口 570228

作者简介: 李骜(1990-),女,海南大学园艺园林学院2012级硕士研究生.E-mail:liningao@126.com

通讯作者: 宋希强(1972-),男,教授,博士.研究方向:园林植物资源与利用.E-mail:song.strong@163.com

English Abstract

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第一作者:
李骜(1990-),女,海南大学园艺园林学院2012级硕士研究生.E-mail:liningao@126.com

通信作者:
宋希强(1972-),男,教授,博士.研究方向:园林植物资源与利用.E-mail:song.strong@163.com

作者简介:
李骜(1990-),女,海南大学园艺园林学院2012级硕士研究生.E-mail:liningao@126.com