基于叶绿体基因的香蕉遗传多样性研究

彭铁成; 徐芳; 罗静瑶; 陈云云; 汤华

doi:10.15886/j.cnki.rdswxb.2012.04.013

《中国科技核心期刊》数据库收录期刊
《中国学术期刊（光盘版）》全文收录期刊
《中文科技期刊数据库》收录期刊
《美国乌利希国际期刊指南（Ulrichsweb）》数据库收录期刊

高级检索

留言板

尊敬的读者、作者、审稿人, 关于本刊的投稿、审稿、编辑和出版的任何问题, 您可以本页添加留言。我们将尽快给您答复。谢谢您的支持!

姓名
邮箱
手机号码
标题
留言内容
验证码

基于叶绿体基因的香蕉遗传多样性研究

彭铁成, 徐芳, 罗静瑶, 陈云云, 汤华

文章导航 > 热带生物学报 > 2012 > 3(4): 293-297

彭铁成, 徐芳, 罗静瑶, 陈云云, 汤华. 基于叶绿体基因的香蕉遗传多样性研究[J]. 热带生物学报, 2012, 3(4): 293-297. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2012.04.013

引用本文:

彭铁成, 徐芳, 罗静瑶, 陈云云, 汤华. 基于叶绿体基因的香蕉遗传多样性研究[J]. 热带生物学报, 2012, 3(4): 293-297. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2012.04.013

PENG Tiecheng, XU Fang, LUO Jingyao, CHEN Yunyun, TANG Hua. Genetic Diversity of Banana Varieties Based on Genes from Chloroplast[J]. Journal of Tropical Biology, 2012, 3(4): 293-297. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2012.04.013

Citation:

PENG Tiecheng, XU Fang, LUO Jingyao, CHEN Yunyun, TANG Hua. Genetic Diversity of Banana Varieties Based on Genes from Chloroplast[J]. Journal of Tropical Biology, 2012, 3(4): 293-297. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2012.04.013

基于叶绿体基因的香蕉遗传多样性研究

doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2012.04.013

彭铁成^1,2,3,
徐芳³,
罗静瑶^2,3,
陈云云^2,3,
汤华^1,2,3, ,

1. 海南大学热带作物种质资源保护与开发利用教育部重点实验室, 海南海口 570228;
2. 海南大学热带生物资源可持续利用国家重点实验室培育基地, 海南海口 570228;
3. 海南大学农学院, 海南海口 570228

基金项目:

热带作物种质资源保护与开发利用教育部重点实验室开放课题(2010hckled-01)

国家自然科学基金资助项目(30860149)

教育部科学技术研究重点项目(210172)

详细信息

第一作者:
彭铁成(1984-),男,河南南阳人,海南大学农学院2009级作物遗传育种专业硕士研究生.

通信作者:
汤华(1974-),男,湖北恩施人,海南大学农学院副教授,博士.E-mail:thtiger@163.com

中图分类号: S668.1;S436.421.1⁺3

Genetic Diversity of Banana Varieties Based on Genes from Chloroplast

PENG Tiecheng^1,2,3,
XU Fang³,
LUO Jingyao^2,3,
CHEN Yunyun^2,3,
TANG Hua^{1,2,3
, ,}

1. Key Laboratory for Conservation and Utilization of Tropical Crops Germplasm Resources, Ministry of Education, Haikou 570228, China;
2. Hainan Key Laboratory for Sustainable Utilization of Tropical Bio-resources-State Key Laboratory Breeding Base, Hainan University, Haikou 570228, China;
3. College of Agronomy, Hainan University, Haikou 570228, China

摘要: 以7种不同来源的香蕉为材料,选择2个叶绿体基因组的非编码区序列(即rpl16内含子序列和psaA-ycf3基因间隔序列),进行PCR扩增、克隆转化及测序,采用邻接法(NJ)构建系统进化树,并测算了相对遗传距离。结果表明,巴西蕉与另外6个抗枯萎病香蕉品种间存在一定的遗传差异,但遗传差异程度不大。
- 香蕉 /
- 枯萎病 /
- 叶绿体基因组 /
- 遗传多样性
Abstract: Banana is the most important tropical fruit.In recent years the outbreaks of banana Fusarium wilt have great negative impact on banana production.The study of genetic diversity of banana will provide support to genetic improvement of banana for resistance to Fusarium wilt.Seven banana varieties were used as sequencing materials,and 2 non-coding chloroplast DNA sequences（Intron sequence of rpl16 gene and intergenic sequence of psaA-ycf3 genes） in these varieties were amplified by PCR,cloned by TA,sequenced and analysed by bioinformatics to study the genetic diversity of banana.Neighbor joining method was used to establish phylogenetic tree and relative genetic distance measured.Results showed that Baxi banana had different degrees of genetic diversity as against the other 6 wilt-resistant banana varieties but the difference was not significant.
- banana /
- Fusarium wilt disease /
- chloroplast genome /
- genetic diversity

[1]	KAEMMER D,AFZA R,WEISING K,et al.Oligonucleotide and amplification fingerprinting of wild species and cultivars of banana(Musa spp.)[J].Biotechnology(N Y),1992,10(9):1030-1035.
[2]	DEASCENSAO A R,DUBERY I A.Panama disease:cell wall reinforcement in banana roots in response to elicitors from fusar-ium oxysporum f.sp.cubense Race Four[J].Phytopathology,2000,90(10):1173-1180.
[3]	陈厚彬,冯奇瑞,徐春香,等.抗枯萎病香蕉种质筛选[J].华南农业大学学报,2006(1):9-12.
[4]	严定平,柳晓磊,汤华.香蕉枯萎病及其抗病育种研究进展[J].海南大学学报:自然科学版,2008,26(3):290-295.
[5]	SWANGPOL S,VOLKAERT H,SOTTO R C,et al.Utility of selected non-coding chloroplast DNA sequences for lineage as-sessment of Musa interspecific hybrids[J].J Biochem Mol Biol,2007,40(4):577-587.
[6]	ZHANG W.Phylogeny of the grass family(Poaceae)from rpl16intron sequence data[J].Mol Phylogenet Evol,2000,15(1):135-146.
[7]	SUMMER H,PFANNSCHMIDT T,LINK G.Transcripts and sequence elements suggest differential promoter usage within the ycf3-psaAB gene cluster on mustard(Sinapis alba L.)chloroplast DNA[J].Curr Genet,2000,37(1):45-52.

[1]	黄思豪, 王丽霞, 刘永霞, 姜成君, 宋可欣, 赵艳, 何应对. 基于机器学习算法预测香蕉产量 . 热带生物学报, 2025, 16(1): 21-30. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.20240031
[2]	孟丽华, 何子婷, 张育华, 李轲祎, 吴金烽, 吴奕彤, 罗敏, 胡平. 基于mt COI序列的广西松材线虫遗传多样性和遗传分化的初探 . 热带生物学报, 2025, 16(): 1-7. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.20240135
[3]	赵阳, 刘爽, 王志彪, 伍俊宇, 陈代朋, 郑丽. 香蕉枯萎病菌候选效应蛋白FoSSP80能抑制植物免疫反应 . 热带生物学报, 2025, 16(1): 87-97. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.20240019
[4]	邓树庆, 蔡杏伟, 王韩, 符成慧, 张清凤, 申志新, 李高俊, 李芳远. 保亭近腹吸鳅遗传多样性及保护建议 . 热带生物学报, 2024, 15(4): 419-426. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.20230112
[5]	柯宏基, 陈傅晓, 李向民, 樊佳伟, 王永波, 符书源, 谭围. 基于线粒体控制区的海南岛3种弹涂鱼的遗传多样性 . 热带生物学报, 2023, 14(2): 203-213. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2023.02.010
[6]	蔡颖, 段继煜, 朱思奇, 任明迅, 唐亮. 基于SSR标记的无翼坡垒遗传多样性研究 . 热带生物学报, 2022, 13(2): 127-135. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2022.02.004
[7]	侯祥文, 徐诗涛, 王德立, 梁靖雯, 司更花. 海南岛鸟巢蕨自然种群遗传多样性SRAP分析 . 热带生物学报, 2021, 12(1): 25-32. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2021.01.004
[8]	彭昀, 肖宇明, 刘衍超, 李增平, 王萌, 梁晓宇, 张宇. 橡胶树枯萎病病原菌室内毒力测定 . 热带生物学报, 2019, 10(3): 272-275. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2019.03.012
[9]	高刘, 余雪标, 李然, 杨青青, 崔喜博, 李思远, 王牌. 沼液配方肥对香蕉产量、品质及香蕉园土壤质量的影响 . 热带生物学报, 2017, 8(2): 209-215. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2017.02.014
[10]	姚宇, 李娟玲, 李碧英, 罗志平, 李丽辉, 李文革. 广藿香⁶⁰Co-γ诱变体植株遗传多样性的ISSR分析 . 热带生物学报, 2017, 8(3): 277-283. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2017.03.005
[11]	傅学丽, 刘加慧, 刘建勇. 九孔鲍5个家系遗传多样性的AFLP分析 . 热带生物学报, 2016, 7(4): 422-426. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2016.04.003
[12]	贺瑞, 彭赟, 刘扬, 曾灿彬, 徐敏, 齐钊, 闫臻, 骆娟, 阮云泽, 何朝族, 汤华. 低氮胁迫下香蕉硝酸盐转运蛋白MaNRT2基因的克隆与表达分析 . 热带生物学报, 2016, 7(1): 76-81. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2016.01.013
[13]	彭赟, 龙海飞, 贺瑞, 徐敏, 曾灿彬, 骆娟, 齐钊, 闫臻, 阮云泽, 何朝族, 汤华. 香蕉miRNA及其靶基因的生物信息学预测 . 热带生物学报, 2016, 7(2): 237-245. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2016.02.017
[14]	黄旭, 王安邦, 苗红霞, 刘菊华, 贾彩红, 金志强, 徐碧玉. 香蕉辐射诱变抗寒株系果实中淀粉和糖含量的变化 . 热带生物学报, 2015, 6(3): 269-272. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2015.03.008
[15]	罗灿, 于旭东, 吴繁花, 高鑫, 王童欣. 肾茶种质资源遗传多样性的ISSR分析 . 热带生物学报, 2015, 6(2): 204-222. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2015.02.016
[16]	李佳潼, 黄绵佳, 吴岚芳, 张瑜文, 谢学立. 诱导香蕉离体叶片衰老过程转化酶基因和衰老基因的分子表达 . 热带生物学报, 2015, 6(4): 444-448. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2015.04.014
[17]	田建平, 李娟玲, 胡远艳, 刘国民. 冬青属植物系统学及遗传多样性研究进展 . 热带生物学报, 2013, 4(4): 393-400. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2013.04.009
[18]	廖承红, 郑继平, 韦双双, 周海龙. 家鸡起源和遗传多样性的研究进展 . 热带生物学报, 2013, 4(1): 94-98. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2013.01.013
[19]	薛玉潇, 贾慧升, 王国芬, 刘磊, 黄俊生. 接种生防菌和病原菌对香蕉抗枯萎病的诱导 . 热带生物学报, 2012, 3(1): 62-65,68. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2012.01.007
[20]	王芳, 过建春. 香蕉专业合作社绩效评价研究 . 热带生物学报, 2011, 2(2): 178-186. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2011.02.004

点击查看大图

计量

文章访问数: 2
HTML全文浏览量: 0
PDF下载量: 0
被引次数: 0

基于叶绿体基因的香蕉遗传多样性研究

doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2012.04.013

1. 海南大学热带作物种质资源保护与开发利用教育部重点实验室, 海南海口 570228;

2. 海南大学热带生物资源可持续利用国家重点实验室培育基地, 海南海口 570228;

3. 海南大学农学院, 海南海口 570228

基金项目:

热带作物种质资源保护与开发利用教育部重点实验室开放课题(2010hckled-01)

国家自然科学基金资助项目(30860149)

教育部科学技术研究重点项目(210172)

作者简介:
彭铁成(1984-),男,河南南阳人,海南大学农学院2009级作物遗传育种专业硕士研究生.

通讯作者: 汤华(1974-),男,湖北恩施人,海南大学农学院副教授,博士.E-mail:thtiger@163.com

收稿日期: 2012-10-25

中图分类号: S668.1;S436.421.1⁺3

关键词:

香蕉 /

枯萎病 /

叶绿体基因组 /

遗传多样性

摘要: 以7种不同来源的香蕉为材料,选择2个叶绿体基因组的非编码区序列(即rpl16内含子序列和psaA-ycf3基因间隔序列),进行PCR扩增、克隆转化及测序,采用邻接法(NJ)构建系统进化树,并测算了相对遗传距离。结果表明,巴西蕉与另外6个抗枯萎病香蕉品种间存在一定的遗传差异,但遗传差异程度不大。