肾茶种质资源遗传多样性的ISSR分析

罗灿; 于旭东; 吴繁花; 高鑫; 王童欣

doi:10.15886/j.cnki.rdswxb.2015.02.016

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肾茶种质资源遗传多样性的ISSR分析

罗灿, 于旭东, 吴繁花, 高鑫, 王童欣

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罗灿, 于旭东, 吴繁花, 高鑫, 王童欣. 肾茶种质资源遗传多样性的ISSR分析[J]. 热带生物学报（中英文）, 2015, 6(2): 204-222. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2015.02.016

引用本文:

罗灿, 于旭东, 吴繁花, 高鑫, 王童欣. 肾茶种质资源遗传多样性的ISSR分析[J]. 热带生物学报（中英文）, 2015, 6(2): 204-222. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2015.02.016

LUO Can, YU Xudong, WU Fanhua, GAO Xin, WANG Tongxin. Genetic Diversity in Clerodendranthus spicatus（Thunb.）Based on ISSR Markers[J]. Journal of Tropical Biology, 2015, 6(2): 204-222. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2015.02.016

Citation:

LUO Can, YU Xudong, WU Fanhua, GAO Xin, WANG Tongxin. Genetic Diversity in Clerodendranthus spicatus（Thunb.）Based on ISSR Markers[J]. Journal of Tropical Biology, 2015, 6(2): 204-222. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2015.02.016

肾茶种质资源遗传多样性的ISSR分析

DOI: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2015.02.016

罗灿¹,
于旭东^1,2,3, ,,
吴繁花²,
高鑫³,
王童欣²

1 海南大学园艺园林学院/热带作物种质资源保护与开发利用教育部重点实验室, 海南海口 570228;
2 海南大学农学院/热带珍稀植物资源开发与利用实验室, 海南海口 570228;
3 海南大学应用科技学院, 海南儋州 571737

基金项目:

海南大学应用科技学院(儋州校区)基金项目“裂掌榕种质资源调查及资源圃的建立”(HYK1524)

海南省中西部高校提升综合实力工作资金项目“农艺应用型本科实践教学创新团队”(201417)

海南省产学研一体化专项“海南木棉产业发展关键技术集成与示范”(CXY20140027)

海南省星火产业带专项“海南肾茶高效栽培与示范”(HNXH201319)

国家级大学生创新创业训练计划项目“爱吾园生物除醛创艺坊”(201421)

详细信息

第一作者:
罗灿(1988-),男,硕士研究生

通信作者:
于旭东(1973-),男,副教授,博士研究生,研究方向:资源植物学.E-mail:doeast@163.com

中图分类号: S326

Genetic Diversity in Clerodendranthus spicatus（Thunb.）Based on ISSR Markers

LUO Can¹,
YU Xudong^{1,2,3
, ,},
WU Fanhua²,
GAO Xin³,
WANG Tongxin²

1. College of Horticulture and Landscape Architecture, Hainan University, Haikou, 570228;
2. Laboratory for Development and Utilization of Tropical Rare Plants Resources, College of Agronomy, Hainan University, Haikou, 570228;
3. College of Applied Science and Technology, Hainan University, Danzhou, 571737, China

摘要: 为了探讨中国肾茶种质资源的遗传多样性,本研究采用100条ISSR引物对87份肾茶种质资源进行试验分析,发现20条引物能扩增出清晰条带。在87份供试材料中,20个ISSR引物共产生144条扩增条带,其中多态性条带120条,多态率83.3%,平均每个ISSR标记能产生6.0条多态性片段。87份材料间的遗传相似系数变化范围为0.48～0.98,但6份栽培品种间遗传相似系数为0.88～0.98,显示出栽培种的遗传基础相对狭窄。利用UPGMA聚类分析,供试材料可聚为2类,其中栽培品种单独聚成1类,野生材料聚为1类。结果显示,中国野生肾茶种质资源遗传多样性丰富,具有较高的开发利用价值。
- 肾茶 /
- CTAB法 /
- ISSR /
- 遗传多样性
Abstract: In order to analyze the genetic diversity of Clerodendranthus spicatus（ Thunb.） C. Y. Wu. in China,a total of 87 accessions of C. spicatus（ Thunb.） C. Y. Wu were analyzed by using ISSR markers. One hundred of ISSR primers were designed to produce amplification products of the accessions,among which 20 primers produced distinct amplification products. The 20 primers yielded a total of 144 bands in the 87 accessions,of which 120 bands（ 83. 3%） were polymorphic（ 6. 0 polymorphic bands per primer）. The ISSR-based genetic similarity（ GS） values of the 87 C. spicatus accessions ranged from 0. 48 to 0. 98,but the GS values of six accessions of cultivars ranged from 0. 88- 0. 98. This result indicated that the genetic basis was comparatively narrow among the cultivars. Moreover,the 87 accessions were clustered into two groups by UPGMA,among which the cultivars were classified into one group and the wild species into another group. It is concluded that the wild germplasm resources of C. spicatus in China are more genetically diverse and hence have a great potential for further exploitation and utilization.
- Clerodendranthus spicatus（Thunb.） C.Y.Wu. /
- CTAB methods /
- ISSR /
- genetic diversity

[1]	朱思奇, 段继煜, 唐亮. 龙脑香科青梅小尺度空间遗传结构研究 . 热带生物学报（中英文）, 2026, 17(): 1-11. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.20250182
[2]	孟丽华, 何子婷, 张育华, 李轲祎, 吴金烽, 吴奕彤, 罗敏, 胡平. 基于mt COⅠ序列的广西松材线虫遗传多样性和遗传分化的初探 . 热带生物学报（中英文）, 2026, 17(1): 101-107. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.20240135
[3]	毛珺旸, 向婷, 魏二强, 王建华, 李薇, 曾军, 戴好富. 不同白木香种质表型性状遗传多样性分析 . 热带生物学报（中英文）, 2026, 17(): 1-13. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.20250200
[4]	黎文昌, 陈馷嶂, 钟昊天, 严森, 张哲. 人居环境下海南钻喙兰种群的遗传多样性 . 热带生物学报（中英文）, 2025, 17(): 1-8. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.20250142
[5]	高龙翔, 殷梓博, 刘炬松, 骆焱平. 肾茶乙醇提取物抗氧化及对秀丽隐杆线虫的活性研究 . 热带生物学报（中英文）, 2025, 16(): 1-8. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.20250001
[6]	邓树庆, 蔡杏伟, 王韩, 符成慧, 张清凤, 申志新, 李高俊, 李芳远. 保亭近腹吸鳅遗传多样性及保护建议 . 热带生物学报（中英文）, 2024, 15(4): 419-426. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.20230112
[7]	柯宏基, 陈傅晓, 李向民, 樊佳伟, 王永波, 符书源, 谭围. 基于线粒体控制区的海南岛3种弹涂鱼的遗传多样性 . 热带生物学报（中英文）, 2023, 14(2): 203-213. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2023.02.010
[8]	商瑞, 毛佳, 王延谦, 白亭亭, 杨春勇, 王红卫, 王艳芳, 郭睿, 李戈. 肾茶叶枯病病原的分离与鉴定 . 热带生物学报（中英文）, 2023, 14(2): 229-233. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2023.02.013
[9]	蔡颖, 段继煜, 朱思奇, 任明迅, 唐亮. 基于SSR标记的无翼坡垒遗传多样性研究 . 热带生物学报（中英文）, 2022, 13(2): 127-135. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2022.02.004
[10]	侯祥文, 徐诗涛, 王德立, 梁靖雯, 司更花. 海南岛鸟巢蕨自然种群遗传多样性SRAP分析 . 热带生物学报（中英文）, 2021, 12(1): 25-32. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2021.01.004
[11]	姚宇, 李娟玲, 李碧英, 罗志平, 李丽辉, 李文革. 广藿香⁶⁰Co-γ诱变体植株遗传多样性的ISSR分析 . 热带生物学报（中英文）, 2017, 8(3): 277-283. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2017.03.005
[12]	傅学丽, 刘加慧, 刘建勇. 九孔鲍5个家系遗传多样性的AFLP分析 . 热带生物学报（中英文）, 2016, 7(4): 422-426. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2016.04.003
[13]	陈英, 吴友根, 张军锋, 杨东梅, 林尤奋. 广藿香生物活性和遗传多样性研究进展 . 热带生物学报（中英文）, 2013, 4(3): 276-288. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2013.03.005
[14]	廖承红, 郑继平, 韦双双, 周海龙. 家鸡起源和遗传多样性的研究进展 . 热带生物学报（中英文）, 2013, 4(1): 94-98. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2013.01.013
[15]	田建平, 李娟玲, 胡远艳, 刘国民. 冬青属植物系统学及遗传多样性研究进展 . 热带生物学报（中英文）, 2013, 4(4): 393-400. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2013.04.009
[16]	彭铁成, 徐芳, 罗静瑶, 陈云云, 汤华. 基于叶绿体基因的香蕉遗传多样性研究 . 热带生物学报（中英文）, 2012, 3(4): 293-297. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2012.04.013
[17]	高建明, 代真真, 江程记, 张世清, 陈河龙, 郑金龙, 刘巧莲, 易克贤. 芦笋DNA提取方法的比较研究 . 热带生物学报（中英文）, 2011, 2(2): 153-156. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2011.02.014
[18]	李传代. 女贞ISSR分子标记的引物筛选 . 热带生物学报（中英文）, 2010, 1(2): 183-186,192. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2010.02.013
[19]	邱丰艳, 邓用川, 林栖凤, 刘国民. 胡萝卜ISSR反应体系优化的研究 . 热带生物学报（中英文）, 2010, 1(4): 301-306,313. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2010.04.009
[20]	李传代, 陈飞, 王天地, 刘国民. 女贞ISSR-PCR反应体系的建立与优化 . 热带生物学报（中英文）, 2010, 1(2): 99-104. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2010.02.012

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肾茶种质资源遗传多样性的ISSR分析

DOI: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2015.02.016

1 海南大学园艺园林学院/热带作物种质资源保护与开发利用教育部重点实验室, 海南海口 570228;

2 海南大学农学院/热带珍稀植物资源开发与利用实验室, 海南海口 570228;

3 海南大学应用科技学院, 海南儋州 571737

基金项目:

海南大学应用科技学院(儋州校区)基金项目“裂掌榕种质资源调查及资源圃的建立”(HYK1524)

海南省中西部高校提升综合实力工作资金项目“农艺应用型本科实践教学创新团队”(201417)

海南省产学研一体化专项“海南木棉产业发展关键技术集成与示范”(CXY20140027)

海南省星火产业带专项“海南肾茶高效栽培与示范”(HNXH201319)

国家级大学生创新创业训练计划项目“爱吾园生物除醛创艺坊”(201421)

作者简介:
罗灿(1988-),男,硕士研究生

通讯作者: 于旭东(1973-),男,副教授,博士研究生,研究方向:资源植物学.E-mail:doeast@163.com

收稿日期: 2015-02-01

中图分类号: S326

关键词:

肾茶 /

CTAB法 /

ISSR /

遗传多样性

摘要: 为了探讨中国肾茶种质资源的遗传多样性,本研究采用100条ISSR引物对87份肾茶种质资源进行试验分析,发现20条引物能扩增出清晰条带。在87份供试材料中,20个ISSR引物共产生144条扩增条带,其中多态性条带120条,多态率83.3%,平均每个ISSR标记能产生6.0条多态性片段。87份材料间的遗传相似系数变化范围为0.48～0.98,但6份栽培品种间遗传相似系数为0.88～0.98,显示出栽培种的遗传基础相对狭窄。利用UPGMA聚类分析,供试材料可聚为2类,其中栽培品种单独聚成1类,野生材料聚为1类。结果显示,中国野生肾茶种质资源遗传多样性丰富,具有较高的开发利用价值。

English Abstract

Genetic Diversity in Clerodendranthus spicatus（Thunb.）Based on ISSR Markers

1. College of Horticulture and Landscape Architecture, Hainan University, Haikou, 570228;

2. Laboratory for Development and Utilization of Tropical Rare Plants Resources, College of Agronomy, Hainan University, Haikou, 570228;

3. College of Applied Science and Technology, Hainan University, Danzhou, 571737, China

Received Date: 2015-02-01

Keywords:

Clerodendranthus spicatus（Thunb.） C.Y.Wu. /
CTAB methods /
ISSR /
genetic diversity

Abstract: In order to analyze the genetic diversity of Clerodendranthus spicatus（ Thunb.） C. Y. Wu. in China,a total of 87 accessions of C. spicatus（ Thunb.） C. Y. Wu were analyzed by using ISSR markers. One hundred of ISSR primers were designed to produce amplification products of the accessions,among which 20 primers produced distinct amplification products. The 20 primers yielded a total of 144 bands in the 87 accessions,of which 120 bands（ 83. 3%） were polymorphic（ 6. 0 polymorphic bands per primer）. The ISSR-based genetic similarity（ GS） values of the 87 C. spicatus accessions ranged from 0. 48 to 0. 98,but the GS values of six accessions of cultivars ranged from 0. 88- 0. 98. This result indicated that the genetic basis was comparatively narrow among the cultivars. Moreover,the 87 accessions were clustered into two groups by UPGMA,among which the cultivars were classified into one group and the wild species into another group. It is concluded that the wild germplasm resources of C. spicatus in China are more genetically diverse and hence have a great potential for further exploitation and utilization.

罗灿, 于旭东, 吴繁花, 高鑫, 王童欣. 肾茶种质资源遗传多样性的ISSR分析[J]. 热带生物学报（中英文）, 2015, 6(2): 204-222. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2015.02.016

引用本文:

罗灿, 于旭东, 吴繁花, 高鑫, 王童欣. 肾茶种质资源遗传多样性的ISSR分析[J]. 热带生物学报（中英文）, 2015, 6(2): 204-222. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2015.02.016

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肾茶种质资源遗传多样性的ISSR分析

DOI: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2015.02.016

第一作者: 罗灿(1988-),男,硕士研究生

通信作者: 于旭东(1973-),男,副教授,博士研究生,研究方向:资源植物学.E-mail:doeast@163.com

Genetic Diversity in Clerodendranthus spicatus（Thunb.）Based on ISSR Markers

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出版历程

肾茶种质资源遗传多样性的ISSR分析

DOI: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2015.02.016

1 海南大学园艺园林学院/热带作物种质资源保护与开发利用教育部重点实验室, 海南海口 570228; 2 海南大学农学院/热带珍稀植物资源开发与利用实验室, 海南海口 570228; 3 海南大学应用科技学院, 海南儋州 571737

作者简介: 罗灿(1988-),男,硕士研究生

通讯作者: 于旭东(1973-),男,副教授,博士研究生,研究方向:资源植物学.E-mail:doeast@163.com

English Abstract

Genetic Diversity in Clerodendranthus spicatus（Thunb.）Based on ISSR Markers

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目录

喜报！《热带生物学报（中英文）》影响因子稳步攀升，再创历史新高！

第一作者:
罗灿(1988-),男,硕士研究生

通信作者:
于旭东(1973-),男,副教授,博士研究生,研究方向:资源植物学.E-mail:doeast@163.com

1 海南大学园艺园林学院/热带作物种质资源保护与开发利用教育部重点实验室, 海南海口 570228;

2 海南大学农学院/热带珍稀植物资源开发与利用实验室, 海南海口 570228;

3 海南大学应用科技学院, 海南儋州 571737

作者简介:
罗灿(1988-),男,硕士研究生