南海斜带石斑鱼野生群体与人工繁殖群体的微卫星分析

骆剑; 黄宗文; 陈国华; 王珺; 杨薇; 郭仁湘

doi:10.15886/j.cnki.rdswxb.2011.02.019

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南海斜带石斑鱼野生群体与人工繁殖群体的微卫星分析

骆剑, 黄宗文, 陈国华, 王珺, 杨薇, 郭仁湘

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骆剑, 黄宗文, 陈国华, 王珺, 杨薇, 郭仁湘. 南海斜带石斑鱼野生群体与人工繁殖群体的微卫星分析[J]. 热带生物学报, 2011, 2(2): 123-128. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2011.02.019

引用本文:

LUO Jian, HUANG Zongwen, CHEN Guohua, WANG Jun, YANG Wei, GUO Renxiang. Microsatellite Analyses of Wild Population and Cultivation Artificial Propagation Population in Orange-Spotted Grouper （Epinephelus coioides） in the South China Sea[J]. Journal of Tropical Biology, 2011, 2(2): 123-128. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2011.02.019

Citation:

LUO Jian, HUANG Zongwen, CHEN Guohua, WANG Jun, YANG Wei, GUO Renxiang. Microsatellite Analyses of Wild Population and Cultivation Artificial Propagation Population in Orange-Spotted Grouper （Epinephelus coioides） in the South China Sea[J]. Journal of Tropical Biology, 2011, 2(2): 123-128. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2011.02.019

南海斜带石斑鱼野生群体与人工繁殖群体的微卫星分析

doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2011.02.019

骆剑^1,2,3,
黄宗文^1,2,3,
陈国华^1,2,3, ,,
王珺^1,2,3,
杨薇^1,2,3,
郭仁湘^1,2,3

海南大学海洋学院;
热带生物资源教育部重点实验室;
海洋生物国家级实验教学示范中心, 海南海口 570228

基金项目:

国家科技支撑计划(2007BAD29B01)

863计划(2010AA10A402)

海南大学科研启动项目(kyqd1018)

详细信息

第一作者:
骆剑(1980-),男,湖南衡阳人,海南大学海洋学院讲师,博士.E-mail:luojian@yahoo.cn.

通信作者:
陈国华(1956-),男,教授,研究生导师.E-mail:chguh3240@yahoo.com.cn

中图分类号: Q789

Microsatellite Analyses of Wild Population and Cultivation Artificial Propagation Population in Orange-Spotted Grouper （Epinephelus coioides） in the South China Sea

LUO Jian^1,2,3,
HUANG Zongwen^1,2,3,
CHEN Guohua^{1,2,3
, ,},
WANG Jun^1,2,3,
YANG Wei^1,2,3,
GUO Renxiang^1,2,3

College of Ocean, Hainan University;Key Laboratory of Tropic Biological Resources of Ministry of Education, Hainan University, Haikou 570228, China

摘要: 为了评估我国斜带石斑鱼野生群体与人工繁殖群体的种质现状,采用19个微卫星标记对斜带石斑鱼南海野生群体和海南人工繁殖群体进行遗传多样性研究。结果显示,在野生和人工繁殖群体中,19个基因座位的有效等位基因数(Ne)分别为1.135 0～4.516 2和1.00 0～3.982 7;群体平均观测杂合度(Ho)分别为0.706 1和0.687 5;群体平均期望杂合度(He)分别为0.480 3和0.421 5;多态信息含量(PIC)分别为0.547 5和0.493 0;2个群体间的遗传相似系数(Gst)为0.979 4,遗传距离(D)为0.020 8。这表明斜带石斑鱼南海野生群体与人工繁殖群体的遗传多样性仍然比较丰富,人工繁殖群体没有出现明显的遗传分化和种质退化的现象。
- 斜带石斑鱼 /
- 野生群体 /
- 人工繁殖群体 /
- 微卫星
Abstract: Microsatellite makers were used to evaluate genetic variations of Orange-Spotted Grouper（Epinephelus coioides） in the South China Sea wild population and the Hainan cultivation artificial propagation population,and 48 individuals in each stock were assessed at 19 SSR loci.The result showed that the wild population（W_P） and cultivation artificial propagation population（C_P）,the number of effective alleles（N_e） were 1.135 0—4.516 2 and 1.00 0—3.982 7 respectively;values of mean observed heterozygosity（H_o） were 0.7061 and 0.687 5 respectively;expected heterozygosity（H_e） was 0.480 3 and 0.421 5 respectively;polymorphic information content（PIC） were 0.547 5 and 0.493 0 respectively;genetic similarity coefficient（G_st）,genetic differentiation coefficient（F_st） and genetic distance（D） between WP and CP were 0.979 4,0.015 7 and 0.020 8 respectively.These genetic parameters suggested that the genetic variations in the South China Sea wild population of E.coioides were well conserved and the genetic differentiation and degradation were not obvious in Hainan cultivation artificial propagation population.
- Epinephelus coioides /
- wild population /
- cultivation artificial propagation population /
- microsatellite analyses.

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[2]	张龙婷, 郑智, 王尧, 高煜杰. 鞍带石斑鱼MRFs基因cDNA克隆及组织表达分析 . 热带生物学报, 2025, 16(): 1-16. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.20250030
[3]	张志伟, 朱云杰, 林龙山, 李渊, 吴钟解, 闫智聪, 唐凯, 刘兆群, 周智. 珊瑚黏液缓释剂的制备及其对太阳长棘海星群体聚集的诱导效果 . 热带生物学报, 2024, 15(6): 823-830. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.20240092
[4]	王晟, 但建国. 施铁对普通野生稻田甲烷排放的影响 . 热带生物学报, 2022, 13(5): 496-501. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2022.05.010
[5]	蔡颖, 段继煜, 朱思奇, 任明迅, 唐亮. 基于SSR标记的无翼坡垒遗传多样性研究 . 热带生物学报, 2022, 13(2): 127-135. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2022.02.004
[6]	孔凡栋, 周丽曼, 马青云, 黄圣卓, 赵友兴. 革兰阳性细菌AIP型群体感应抑制剂的研究进展 . 热带生物学报, 2017, 8(2): 236-240. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2017.02.019
[7]	林冬冬, 骆大鹏, 邢诒炫. 3个凡纳滨对虾养殖群体生长性状间的关系 . 热带生物学报, 2016, 7(1): 10-16. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2016.01.002
[8]	战欣, 陈琼, 顾志峰, 石耀华, 王爱民. 马氏珠母贝贝壳珍珠质层厚度性状与微卫星标记的相关性分析 . 热带生物学报, 2016, 7(3): 290-295. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2016.03.002
[9]	高品, 魏京广, 许濛, 陈秀丽, 秦启伟, 周永灿. 斜带石斑鱼PKR基因的克隆表达及亚细胞定位分析 . 热带生物学报, 2016, 7(3): 285-289. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2016.03.001
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[14]	吴廷昌, 冯煜, 骆剑, 刘扬溪, 黄飞, 陈国华. 斜带石斑鱼工厂化育苗水体理化因子分析 . 热带生物学报, 2013, 4(1): 1-6. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2013.01.014
[15]	周翰林, 杨森, 高川, 张磊, 张海发, 李水生, 张勇, 蒙子宁, 刘晓春, 林浩然. 两种杂交石斑鱼子一代及其亲本的线粒体COⅠ基因遗传变异分析 . 热带生物学报, 2012, 3(1): 1-10. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2012.01.016
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[17]	王永波, 符书源, 李丙顺, 郑飞, 王国福, 李向民. 池塘养殖石斑鱼鱼蛭病防治实验 . 热带生物学报, 2011, 2(1): 59-62. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2011.01.018
[18]	蔡岩, 周永灿, 张本, 谢珍玉, 王世锋. 海南野生三斑石斑鱼染色体核型分析 . 热带生物学报, 2011, 2(2): 97-100. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2011.02.018
[19]	程赞, 王梅芳, 万正平, 余祥勇. 企鹅珍珠贝主要污损生物的季节变化及对贝生长的影响 . 热带生物学报, 2011, 2(4): 305-309,315. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2011.04.020
[20]	陈诏, 王世锋, 谢珍玉, 于文媛, 周永灿. 哈氏弧菌诱导布氏石斑鱼头肾提取物的抗菌活性研究 . 热带生物学报, 2010, 1(2): 165-169. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2010.02.014

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南海斜带石斑鱼野生群体与人工繁殖群体的微卫星分析

doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2011.02.019

海南大学海洋学院;

热带生物资源教育部重点实验室;

海洋生物国家级实验教学示范中心, 海南海口 570228

基金项目:

国家科技支撑计划(2007BAD29B01)

863计划(2010AA10A402)

海南大学科研启动项目(kyqd1018)

作者简介:
骆剑(1980-),男,湖南衡阳人,海南大学海洋学院讲师,博士.E-mail:luojian@yahoo.cn.

通讯作者: 陈国华(1956-),男,教授,研究生导师.E-mail:chguh3240@yahoo.com.cn

收稿日期: 2011-04-24

中图分类号: Q789

关键词:

摘要: 为了评估我国斜带石斑鱼野生群体与人工繁殖群体的种质现状,采用19个微卫星标记对斜带石斑鱼南海野生群体和海南人工繁殖群体进行遗传多样性研究。结果显示,在野生和人工繁殖群体中,19个基因座位的有效等位基因数(Ne)分别为1.135 0～4.516 2和1.00 0～3.982 7;群体平均观测杂合度(Ho)分别为0.706 1和0.687 5;群体平均期望杂合度(He)分别为0.480 3和0.421 5;多态信息含量(PIC)分别为0.547 5和0.493 0;2个群体间的遗传相似系数(Gst)为0.979 4,遗传距离(D)为0.020 8。这表明斜带石斑鱼南海野生群体与人工繁殖群体的遗传多样性仍然比较丰富,人工繁殖群体没有出现明显的遗传分化和种质退化的现象。

English Abstract

Microsatellite Analyses of Wild Population and Cultivation Artificial Propagation Population in Orange-Spotted Grouper （Epinephelus coioides） in the South China Sea

College of Ocean, Hainan University;Key Laboratory of Tropic Biological Resources of Ministry of Education, Hainan University, Haikou 570228, China

Received Date: 2011-04-24

Keywords:

Epinephelus coioides /
wild population /
cultivation artificial propagation population /
microsatellite analyses.

Abstract: Microsatellite makers were used to evaluate genetic variations of Orange-Spotted Grouper（Epinephelus coioides） in the South China Sea wild population and the Hainan cultivation artificial propagation population,and 48 individuals in each stock were assessed at 19 SSR loci.The result showed that the wild population（W_P） and cultivation artificial propagation population（C_P）,the number of effective alleles（N_e） were 1.135 0—4.516 2 and 1.00 0—3.982 7 respectively;values of mean observed heterozygosity（H_o） were 0.7061 and 0.687 5 respectively;expected heterozygosity（H_e） was 0.480 3 and 0.421 5 respectively;polymorphic information content（PIC） were 0.547 5 and 0.493 0 respectively;genetic similarity coefficient（G_st）,genetic differentiation coefficient（F_st） and genetic distance（D） between WP and CP were 0.979 4,0.015 7 and 0.020 8 respectively.These genetic parameters suggested that the genetic variations in the South China Sea wild population of E.coioides were well conserved and the genetic differentiation and degradation were not obvious in Hainan cultivation artificial propagation population.

引用本文:

Citation:

LUO Jian, HUANG Zongwen, CHEN Guohua, WANG Jun, YANG Wei, GUO Renxiang. Microsatellite Analyses of Wild Population and Cultivation Artificial Propagation Population in Orange-Spotted Grouper （Epinephelus coioides） in the South China Sea[J]. Journal of Tropical Biology, 2011, 2(2): 123-128. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2011.02.019