多脊椎蒙古羊Hoxc8 exon-1和exon-2的序列分析

陈琦; 赵静; 张立岭; 马月辉

doi:10.15886/j.cnki.rdswxb.2011.02.017

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多脊椎蒙古羊Hoxc8 exon-1和exon-2的序列分析

陈琦, 赵静, 张立岭, 马月辉

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陈琦, 赵静, 张立岭, 马月辉. 多脊椎蒙古羊Hoxc8 exon-1和exon-2的序列分析[J]. 热带生物学报, 2011, 2(2): 157-163. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2011.02.017

引用本文:

陈琦, 赵静, 张立岭, 马月辉. 多脊椎蒙古羊Hoxc8 exon-1和exon-2的序列分析[J]. 热带生物学报, 2011, 2(2): 157-163. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2011.02.017

CHEN Qi, ZHAO Jing, ZHANG Liling, MA Yuehui. Sequence Analysis of Hoxc8 Exon-1 and Exon-2 of Multi-Vertebrae Mongolia Sheep[J]. Journal of Tropical Biology, 2011, 2(2): 157-163. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2011.02.017

Citation:

CHEN Qi, ZHAO Jing, ZHANG Liling, MA Yuehui. Sequence Analysis of Hoxc8 Exon-1 and Exon-2 of Multi-Vertebrae Mongolia Sheep[J]. Journal of Tropical Biology, 2011, 2(2): 157-163. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2011.02.017

多脊椎蒙古羊Hoxc8 exon-1和exon-2的序列分析

doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2011.02.017

1. 内蒙古医学院分子生物学研究中心, 内蒙古呼和浩特 010059;
2. 内蒙古农业大学动物科学与医学学院, 内蒙古呼和浩特 010018;
3. 海南大学农学院, 海南海口 570228;
4. 中国农科院畜牧所, 北京 100193

基金项目:

国家“十一五”科技支撑项目(2006BDA13B08)

国家自然科学基金项目(30960245)

详细信息

第一作者:
陈琦(1980-),女,山东蓬莱人,内蒙古医学院分子生物学研究中心副研究员,博士.

中图分类号: S826.8⁺2

Sequence Analysis of Hoxc8 Exon-1 and Exon-2 of Multi-Vertebrae Mongolia Sheep

1. Research Center of Molecular Biology, Inner Mongolia Medical College, Hohhot 010059, China;
2. College of Animal Science and medicine, Inner Mongolia Agriculture University, Hohhot 010018, China;
3. College of Agriculture, Hainan University, Haikou, 570228, China;
4. Institute of Animal Science, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Beijing 100193, China

摘要: 参考牛的Hoxc8基因序列设计引物,扩增正常蒙古羊(胸椎数13)和多脊椎蒙古羊(胸椎数14)Hoxc8的exon-1和exon-2基因,对得到的序列进行生物信息学分析。结果表明,经序列比对二者的DNA序列,除两侧个别碱基有差异外,中间序列完全一致。蒙古羊Hoxc8的exon-1和exon-2序列分别与其他物种进行同源性比对,蒙古羊Hoxc8 exon-1与人、小鼠、大鼠、犬的同源性达到96%以上,与斑马鱼的同源性为75.8%;exon-2与大猩猩、犬、人、小鼠、大鼠的同源性达到91%以上,与斑马鱼的同源性为74%。
- 多脊椎蒙古羊 /
- 序列分析 /
- Hoxc8 exon-1 /
- Hoxc8exon-2
Abstract: In our study,according to the Hoxc8 sequence of cow,the specific primers were designed,and the sequences of Hoxc8 exon-1（432 bp）and exon-2（273 bp）of normal and multi-thoracic vertebrae mongolia sheep were obtained（Genebank accession number: EU817489 and FJ905472）.Alignment results of them indicated that the sequences were conformity except a little difference in two sides of sequences.Hoxc8 exon-1 and exon-2 were aligned with other species and the results showed that compared with other mammals（human,dog,mouse,rat and chimpanzee）,the homology were above 96%（exon-1） and 91%（exon-2）;compared with zebra fish,the homology were 75.8% and 74%.
- Multi-Vertebrae Mongolia sheep /
- sequences analysis /
- Hoxc8 exon-1 /
- Hoxc8 exon-2

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多脊椎蒙古羊Hoxc8 exon-1和exon-2的序列分析

doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2011.02.017

1. 内蒙古医学院分子生物学研究中心, 内蒙古呼和浩特 010059;

2. 内蒙古农业大学动物科学与医学学院, 内蒙古呼和浩特 010018;

3. 海南大学农学院, 海南海口 570228;

4. 中国农科院畜牧所, 北京 100193

基金项目:

国家“十一五”科技支撑项目(2006BDA13B08)

国家自然科学基金项目(30960245)

作者简介:
陈琦(1980-),女,山东蓬莱人,内蒙古医学院分子生物学研究中心副研究员,博士.

收稿日期: 2011-04-28

中图分类号: S826.8⁺2

关键词:

摘要: 参考牛的Hoxc8基因序列设计引物,扩增正常蒙古羊(胸椎数13)和多脊椎蒙古羊(胸椎数14)Hoxc8的exon-1和exon-2基因,对得到的序列进行生物信息学分析。结果表明,经序列比对二者的DNA序列,除两侧个别碱基有差异外,中间序列完全一致。蒙古羊Hoxc8的exon-1和exon-2序列分别与其他物种进行同源性比对,蒙古羊Hoxc8 exon-1与人、小鼠、大鼠、犬的同源性达到96%以上,与斑马鱼的同源性为75.8%;exon-2与大猩猩、犬、人、小鼠、大鼠的同源性达到91%以上,与斑马鱼的同源性为74%。