文昌鸡<i>MHC B-G</i>基因第2外显子序列多态性分析

廖承红; 郑继平; 伍剑鸿; 梁浩; 张建行

doi:10.15886/j.cnki.rdswxb.2012.04.021

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文昌鸡MHC B-G基因第2外显子序列多态性分析

廖承红, 郑继平, 伍剑鸿, 梁浩, 张建行

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廖承红, 郑继平, 伍剑鸿, 梁浩, 张建行. 文昌鸡MHC B-G基因第2外显子序列多态性分析[J]. 热带生物学报, 2012, 3(4): 314-317. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2012.04.021

引用本文:

廖承红, 郑继平, 伍剑鸿, 梁浩, 张建行. 文昌鸡MHC B-G基因第2外显子序列多态性分析[J]. 热带生物学报, 2012, 3(4): 314-317. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2012.04.021

LIAO Chenghong, ZHENG Jiping, WU Jianhong, LIANG Hao, ZHANG Jianxing. Sequence Polymorphism of Second Exon of MHC B-G Gene in Wenchang Chicken[J]. Journal of Tropical Biology, 2012, 3(4): 314-317. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2012.04.021

Citation:

LIAO Chenghong, ZHENG Jiping, WU Jianhong, LIANG Hao, ZHANG Jianxing. Sequence Polymorphism of Second Exon of MHC B-G Gene in Wenchang Chicken[J]. Journal of Tropical Biology, 2012, 3(4): 314-317. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2012.04.021

文昌鸡MHC B-G基因第2外显子序列多态性分析

doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2012.04.021

廖承红^1,2,3,
郑继平^1,2,3,
伍剑鸿¹,
梁浩¹,
张建行¹

1. 海南大学农学院, 海南海口 570228;
2. 海南大学海南省热带生物资源可持续利用重点实验室/省部共建国家重点实验培育基地, 海南海口 570228;
3. 海南大学热带生物资源教育部重点实验室, 海南海口 570228

基金项目:

海南大学青年基金项目(qnjj1017)

海南省教育厅高等学校科学研究项目(Hjkj2011-11)

海南省自然科学基金项目(310036)

海南大学科研启动项目(Kyqd1116)

详细信息

第一作者:
廖承红(1977-),女,贵州盘县人,海南大学农学院讲师,博士.

中图分类号: S831.8⁺9

Sequence Polymorphism of Second Exon of MHC B-G Gene in Wenchang Chicken

1. College of Agronomy, Hainan University, Haikou 570228, China;
2. Hainan Key Laboratory for Sustainable Utilization of Tropical Bio-resources-State Key Laboratory Breeding Base, Haikou 570228, China;
3. Key Laboratory for Tropical Biological Resources, Ministry of Education, Haikou 570228, China

摘要: 根据GeneBank上红色原鸡的MHC B-G序列设计特异性引物,利用PCR-SSCP和测序方法对文昌鸡18只个体的MHC B-G基因第2外显子序列332bp区域进行序列多态性分析。通过PCR-SSCP分型得到16种基因型;测序检测到21个变异位点,其中20个位点导致16个氨基酸位点发生变异。结果表明:所有序列均未发生长度变化;文昌鸡群体内MHC B-G的多态性较丰富,主要体现在氨基酸多态性上,与其抗原多样性有密切关系。
- 文昌鸡 /
- MHC B-G /
- 第2外显子 /
- 多态性
Abstract: The sequence polymorphisms of the second exon of major hiscompatibility complex（MHC） B-G of 18 individuals in Hainan Wenchang Chicken were detected by the method of PCR-SSCP and direct sequencing with primers which were designed based on the sequence of Gallus gallaus in GenBank.These chickens were grouped into 16 genotypes by PCR-SSCP.Sequencing detected 21 polymorphic sites,20 sites of which cause 16 amino acids sites to mutate among the individuals.The results indicated that the length of MHC B-G sequences in these individuals has no variation.Wenchang Chicken population has rich polymorphisms mainly in the amino acids,which are closely related with the diversity of MHC B-G antigen.
- Wenchang chicken /
- major hiscompatibility complex /
- second exon /
- polymorphism

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文昌鸡MHC B-G基因第2外显子序列多态性分析

doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2012.04.021

1. 海南大学农学院, 海南海口 570228;

2. 海南大学海南省热带生物资源可持续利用重点实验室/省部共建国家重点实验培育基地, 海南海口 570228;

3. 海南大学热带生物资源教育部重点实验室, 海南海口 570228

基金项目:

海南大学青年基金项目(qnjj1017)

海南省教育厅高等学校科学研究项目(Hjkj2011-11)

海南省自然科学基金项目(310036)

海南大学科研启动项目(Kyqd1116)

作者简介:
廖承红(1977-),女,贵州盘县人,海南大学农学院讲师,博士.

收稿日期: 2012-10-16

中图分类号: S831.8⁺9

关键词:

文昌鸡 /

MHC B-G /

第2外显子 /

多态性

摘要: 根据GeneBank上红色原鸡的MHC B-G序列设计特异性引物,利用PCR-SSCP和测序方法对文昌鸡18只个体的MHC B-G基因第2外显子序列332bp区域进行序列多态性分析。通过PCR-SSCP分型得到16种基因型;测序检测到21个变异位点,其中20个位点导致16个氨基酸位点发生变异。结果表明:所有序列均未发生长度变化;文昌鸡群体内MHC B-G的多态性较丰富,主要体现在氨基酸多态性上,与其抗原多样性有密切关系。

English Abstract

廖承红, 郑继平, 伍剑鸿, 梁浩, 张建行. 文昌鸡MHC B-G基因第2外显子序列多态性分析[J]. 热带生物学报, 2012, 3(4): 314-317. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2012.04.021

引用本文:

廖承红, 郑继平, 伍剑鸿, 梁浩, 张建行. 文昌鸡MHC B-G基因第2外显子序列多态性分析[J]. 热带生物学报, 2012, 3(4): 314-317. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2012.04.021

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文昌鸡MHC B-G基因第2外显子序列多态性分析

doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2012.04.021

第一作者:
廖承红(1977-),女,贵州盘县人,海南大学农学院讲师,博士.

Sequence Polymorphism of Second Exon of MHC B-G Gene in Wenchang Chicken

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文昌鸡MHC B-G基因第2外显子序列多态性分析

doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2012.04.021

1. 海南大学农学院, 海南海口 570228;

2. 海南大学海南省热带生物资源可持续利用重点实验室/省部共建国家重点实验培育基地, 海南海口 570228;

3. 海南大学热带生物资源教育部重点实验室, 海南海口 570228

作者简介:
廖承红(1977-),女,贵州盘县人,海南大学农学院讲师,博士.

English Abstract

Sequence Polymorphism of Second Exon of MHC B-G Gene in Wenchang Chicken

1. College of Agronomy, Hainan University, Haikou 570228, China;

2. Hainan Key Laboratory for Sustainable Utilization of Tropical Bio-resources-State Key Laboratory Breeding Base, Haikou 570228, China;

3. Key Laboratory for Tropical Biological Resources, Ministry of Education, Haikou 570228, China

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doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2012.04.021

第一作者: 廖承红(1977-),女,贵州盘县人,海南大学农学院讲师,博士.

Sequence Polymorphism of Second Exon of MHC B-G Gene in Wenchang Chicken

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出版历程

文昌鸡MHC B-G基因第2外显子序列多态性分析

doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2012.04.021

1. 海南大学 农学院, 海南 海口 570228; 2. 海南大学 海南省热带生物资源可持续利用重点实验室/省部共建国家重点实验培育基地, 海南 海口 570228; 3. 海南大学 热带生物资源教育部重点实验室, 海南 海口 570228

作者简介: 廖承红(1977-),女,贵州盘县人,海南大学农学院讲师,博士.

English Abstract

Sequence Polymorphism of Second Exon of MHC B-G Gene in Wenchang Chicken

1. College of Agronomy, Hainan University, Haikou 570228, China; 2. Hainan Key Laboratory for Sustainable Utilization of Tropical Bio-resources-State Key Laboratory Breeding Base, Haikou 570228, China; 3. Key Laboratory for Tropical Biological Resources, Ministry of Education, Haikou 570228, China

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第一作者:
廖承红(1977-),女,贵州盘县人,海南大学农学院讲师,博士.

1. 海南大学农学院, 海南海口 570228;

2. 海南大学海南省热带生物资源可持续利用重点实验室/省部共建国家重点实验培育基地, 海南海口 570228;

3. 海南大学热带生物资源教育部重点实验室, 海南海口 570228

作者简介:
廖承红(1977-),女,贵州盘县人,海南大学农学院讲师,博士.