利用DNAStar软件预测热带无爪螨主要致敏原Blo t 5的抗原表位

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利用DNAStar软件预测热带无爪螨主要致敏原Blo t 5的抗原表位

王晓哲, 肖正泮, 韦双双, 王大勇, 裴业春

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王晓哲, 肖正泮, 韦双双, 王大勇, 裴业春. 利用DNAStar软件预测热带无爪螨主要致敏原Blo t 5的抗原表位[J]. 热带生物学报, 2017, 8(1): 107-112. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2017.01.017

引用本文:

王晓哲, 肖正泮, 韦双双, 王大勇, 裴业春. 利用DNAStar软件预测热带无爪螨主要致敏原Blo t 5的抗原表位[J]. 热带生物学报, 2017, 8(1): 107-112. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2017.01.017

WANG Xiaozhe, XIAO Zhengpan, WEI Shuangshuang, WANG Dayong, PEI Yechun. Prediction of Eiptopes of the Major Allergen Blo t 5 from Blomia tropicalis by Using DNAStar Software[J]. Journal of Tropical Biology, 2017, 8(1): 107-112. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2017.01.017

Citation:

WANG Xiaozhe, XIAO Zhengpan, WEI Shuangshuang, WANG Dayong, PEI Yechun. Prediction of Eiptopes of the Major Allergen Blo t 5 from Blomia tropicalis by Using DNAStar Software[J]. Journal of Tropical Biology, 2017, 8(1): 107-112. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2017.01.017

利用DNAStar软件预测热带无爪螨主要致敏原Blo t 5的抗原表位

doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2017.01.017

1. 海南大学热带农林学院动物科技学院, 海口 570228;
2. 海南大学热带农林学院生物学院, 海口 570228

基金项目:

国家自然科学基金青年项目(31402257)

海南省自然科学基金项目(20153084)

第一作者:
王晓哲(1995-),男,海南大学热带农林学院动物科技学院2014级本科生,海南大学热带农林学院卓越人才班入选学生

通信作者:
裴业春(1985-),男,博士,硕士生导师.研究方向:生物技术与分子药理学.E-mail:ycpei@hainu.edu.cn

中图分类号: R384.4

Prediction of Eiptopes of the Major Allergen Blo t 5 from Blomia tropicalis by Using DNAStar Software

1. College of Animal Science and Technology, Tropical Agriculture and Forestry College, Hainan University, Haikou, Hainan 570228, China;
2. College of Biological Science, Tropical Agriculture and Forestry College, Hainan University, Haikou, Hainan 570228, China

摘要: 利用DNAStar Protean软件对热带无爪螨主要致敏原Blo t 5的二级结构和表面特性进行分析,如理化性质、亲水性、表面可及性、可塑性等,预测Blo t 5蛋白的B抗原表位和T抗原表位。实验结果表明,Blo t 5蛋白的二级结构以α螺旋为主,存在6个潜在的B抗原表位位点,可能的B抗原表位区域有:18-31,39-48,56-77,86-101,105-112,117-133氨基酸残基或其附近。含有7个潜在的T细胞抗原表位区域:32-37,40-44,57-65,70-79,86-95,100-104,115-120氨基酸残基或其附近。笔者应用Protean软件预测了热带无爪螨主要致敏原Blo t 5的抗原表位,为进一步研究Blo t 5致敏原的结构与功能,研制针对热带螨的预防性和治疗性疫苗、开发相应的诊断试剂盒奠定了基础。
- 热带无爪螨 /
- 抗原表位 /
- Blo t 5 /
- DNAStar软件
Abstract: The secondary structure and surface properties of Blo t 5 allergen from Blomia tropicalis,such as physical and chemical characters,hydrophilicity,surface probability,flexible regions and antigenicity,were analyzed by using the DNAStar Protean software to predict B-cell and T-cell epitopes of Blo t. 5. The secondary structure of Blo t 5 was rich in alpha helix,and the Blo t 5 contained six potential B cell epitopes located at 18-31,39-48,56-77,86-101,105-112,117-133 amino acid residues or nearby. There were seven potential T cell epitopes located at 32-37,40-44,57-65,70-79,86-95,100-104,115-120 amino acid residues or nearby. The epitopes of the major allergen Blo t 5 from B. tropicalis were predicted by using the Protean software.The results can provide a base for the studies of structure and function of the allergen Blo t 5,and development of preventive and therapeutic vaccines for Blomia tropicalis and diagnostic kits for detection of allergens induced by B. tropicalis.
- Blomia tropicalis /
- epitope /
- Blo t 5 /
- DNAStar software

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[2]	翁可欣, 张明亮, 李力. 微生物合成5-羟基色氨酸的研究进展 . 热带生物学报, 2023, 14(1): 42-49. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2023.01.016
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[8]	赵帅, 阙艳鹏, 夏栋楠, 符文英. 5个海巴戟种质低温胁迫下的抗寒性评价 . 热带生物学报, 2018, 9(1): 69-75. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2018.01.09
[9]	何书婷, 贺锐林, 王立, 李秀竹, 宋海超, 敖苏, 史学群. 5种入侵植物提取物对2种芒果病原真菌的抑制作用 . 热带生物学报, 2017, 8(1): 22-28. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2017.01.004
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利用DNAStar软件预测热带无爪螨主要致敏原Blo t 5的抗原表位

doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2017.01.017

1. 海南大学热带农林学院动物科技学院, 海口 570228;

2. 海南大学热带农林学院生物学院, 海口 570228

基金项目:

国家自然科学基金青年项目(31402257)

海南省自然科学基金项目(20153084)

作者简介:
王晓哲(1995-),男,海南大学热带农林学院动物科技学院2014级本科生,海南大学热带农林学院卓越人才班入选学生

通讯作者: 裴业春(1985-),男,博士,硕士生导师.研究方向:生物技术与分子药理学.E-mail:ycpei@hainu.edu.cn

收稿日期: 2016-11-14
修回日期: 2016-12-13

中图分类号: R384.4

关键词:

热带无爪螨 /

摘要: 利用DNAStar Protean软件对热带无爪螨主要致敏原Blo t 5的二级结构和表面特性进行分析,如理化性质、亲水性、表面可及性、可塑性等,预测Blo t 5蛋白的B抗原表位和T抗原表位。实验结果表明,Blo t 5蛋白的二级结构以α螺旋为主,存在6个潜在的B抗原表位位点,可能的B抗原表位区域有:18-31,39-48,56-77,86-101,105-112,117-133氨基酸残基或其附近。含有7个潜在的T细胞抗原表位区域:32-37,40-44,57-65,70-79,86-95,100-104,115-120氨基酸残基或其附近。笔者应用Protean软件预测了热带无爪螨主要致敏原Blo t 5的抗原表位,为进一步研究Blo t 5致敏原的结构与功能,研制针对热带螨的预防性和治疗性疫苗、开发相应的诊断试剂盒奠定了基础。

English Abstract

王晓哲, 肖正泮, 韦双双, 王大勇, 裴业春. 利用DNAStar软件预测热带无爪螨主要致敏原Blo t 5的抗原表位[J]. 热带生物学报, 2017, 8(1): 107-112. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2017.01.017

引用本文:

王晓哲, 肖正泮, 韦双双, 王大勇, 裴业春. 利用DNAStar软件预测热带无爪螨主要致敏原Blo t 5的抗原表位[J]. 热带生物学报, 2017, 8(1): 107-112. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2017.01.017

WANG Xiaozhe, XIAO Zhengpan, WEI Shuangshuang, WANG Dayong, PEI Yechun. Prediction of Eiptopes of the Major Allergen Blo t 5 from Blomia tropicalis by Using DNAStar Software[J]. Journal of Tropical Biology, 2017, 8(1): 107-112. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2017.01.017

Citation:

WANG Xiaozhe, XIAO Zhengpan, WEI Shuangshuang, WANG Dayong, PEI Yechun. Prediction of Eiptopes of the Major Allergen Blo t 5 from Blomia tropicalis by Using DNAStar Software[J]. Journal of Tropical Biology, 2017, 8(1): 107-112. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2017.01.017

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