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火龙果42份种质资源的倍性鉴定及基因组大小分析

丁一 王周雯 康绍玲 姜森荣 王猛 黄家权 李洪立 胡文斌 汤华

丁一, 王周雯, 康绍玲, 姜森荣, 王猛, 黄家权, 李洪立, 胡文斌, 汤华. 火龙果42份种质资源的倍性鉴定及基因组大小分析[J]. 热带生物学报, 2024, 15(3): 306-314. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.20230118
引用本文: 丁一, 王周雯, 康绍玲, 姜森荣, 王猛, 黄家权, 李洪立, 胡文斌, 汤华. 火龙果42份种质资源的倍性鉴定及基因组大小分析[J]. 热带生物学报, 2024, 15(3): 306-314. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.20230118
DING Yi, WANG Zhouwen, KANG Shaoling, JIANG Senrong, WANG Meng, HUANG Jiaquan, LI Hongli, HU Wenbin, TANG Hua. Ploidy identification and genome size analysis of 42 Pitaya germplasm resources[J]. Journal of Tropical Biology, 2024, 15(3): 306-314. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.20230118
Citation: DING Yi, WANG Zhouwen, KANG Shaoling, JIANG Senrong, WANG Meng, HUANG Jiaquan, LI Hongli, HU Wenbin, TANG Hua. Ploidy identification and genome size analysis of 42 Pitaya germplasm resources[J]. Journal of Tropical Biology, 2024, 15(3): 306-314. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.20230118

火龙果42份种质资源的倍性鉴定及基因组大小分析

doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.20230118
基金项目: 

海南省自然科学基金高层次人才项目 320RC487

海南省重大科技计划项目 ZDKJ2021014

详细信息
    第一作者:

    丁一(1997-), 男, 海南大学热带农林学院2021级硕士研究生。E-mail: crystaldylj@163.com

    通信作者:

    汤华(1974-), 男, 教授, 博士研究生导师。研究方向: 火龙果遗传育种与分子生物学。E-mail: thtiger@163.com

  • 潘学峰
  • 中图分类号: S667.9

Ploidy identification and genome size analysis of 42 Pitaya germplasm resources

  • 摘要: 为了满足火龙果的产业发展需求,必须开展火龙果高产优质新品种的选育工作。收集和评价火龙果种质资源,并开展火龙果的杂交育种,是火龙果育种的主要路径。火龙果种质资源多样,遗传倍性情况不明,对种质资源的倍性进行鉴定是育种创新不可缺少的环节。本研究建立了火龙果茎尖染色体制片体系,并采用茎尖染色体制片技术以及流式细胞技术对42份火龙果种质资源进行倍性鉴定。结果表明:1)火龙果茎尖染色体制片在前低渗时间为2 h、解离时间为1.5 h、酶解时间为1 h、后低渗时间为30 min时,染色体分散程度较好,背景清晰,没有出现重叠的现象,具有完整的细胞。2)火龙果茎尖倍性稳定,是最可靠的检测材料,老熟的茎条含有大量的四倍体和八倍体细胞,不宜做倍性鉴定材料。3)42份火龙果种质资源中有二倍体材料41份,四倍体材料1份,无三倍体材料。4)以‘金都一号’为参照,进行基因组大小的预估,发现有15份火龙果种质资源的1C-value(1C)≤1.34 Gb,为极小型基因组,27份火龙果种质资源的1C值在1.35~3.34 Gb之间,为小型基因组。
    注释:
    1)  潘学峰
  • 图  2  不同解离时间对制片效果的影响

    A:1.5 h;B:2.0 h。

    Fig.  2  The effect of microscopical preparation by different dissociation times

    图  3  不同酶解时间对制片效果的影响

    A:0.5 h;B:1.0 h;C:1.5 h。

    Fig.  3  The effect of microscopical preparation by different enzymatic hydrolysis times

    图  4  不同后低渗时间对制片效果的影响

    A:20 min;B:30 min;C:40 min。

    Fig.  4  The effect of microscopical preparation by different post-hypotonic treatment times

    图  5  火龙果不同组织部位的流式细胞检测

    A:茎尖;B:幼嫩茎条;C:老熟茎条;横轴是DNA染料DAPI收到波长为532 nm的激光激发所放出的荧光强度。纵轴是细胞核数。

    Fig.  5  Flow cytometry assays for different tissues of pitaya

    Note: A: young bud tip; B: young stems; C: Old ripe stems; The horizontal axis is the fluorescence intensity emitted by the laser excitation of the DNA dye DAPI with a wavelength of 532 nm. The vertical axis is the number of nuclei.

    图  6  火龙果二倍体与四倍体细胞的对比

    A、a:二倍体;B、b:四倍体。

    Fig.  6  the comparison between diploid and tetraploid cells of pitaya

    Note: A, a: Diploid; B, b: Tetraploid

    表  1  火龙果种质资源名称及编号

    Table  1  The name and number of pitaya germplasm resources

    编号Number品种名称Name编号Number品种名称Name编号Number品种名称Name
    1澳洲黄龙Aozhouhuanglong15红水晶Hongshuijing29偷心6号Touxin No.6
    2白肉Bairou16黄皮Huangpi30陀2Tuo No.2
    3白水晶Baishuijing17金都一号Jindu No.131陀红肉小果Tuohongrouxiaoguo
    4粗砂Cusha18玫瑰1号Meigui No.132无刺红龙Wucihonglong
    5大红Dahong19玫红4号Meihong No.433无刺黄龙Wucihuanglong
    6帝龙Dilong20美龙Meilong34细致Xizhi
    7富贵红450 Fuguihong45021美龙3号Meilong No.335香蜜龙Xiangmilong
    8光明白肉Guangmingbairou22蜜宝Mibao36小圆果Xiaoyuanguo
    9光明红肉Guangminghongrou23蜜玄龙Mixuanlong37燕窝果Yanwoguo
    10广西450Guangxi 45024蔷薇3号Qiangwei No.338越南白肉Yuenanbairou
    11桂红龙Guihonglong25软枝大红Ruanzhidahong39紫蜜龙Zimilong
    12红宝龙Hongbaolong26石火泉Shihuoquan40紫肉Zirou
    13红皮Hongpi27双色Shuangse41紫肉1号Zirou No.1
    14红肉Hongrou28台湾红肉Taiwanhongrou42紫肉2号Zirou No.2
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    表  2  不同火龙果种质资源的基因组大小、倍性及染色体数目

    Table  2  The genome size, ploidy and chromosome number of different pitaya germplasm resources

    品种Variety name染色体数目/条Chromosome number峰值荧光强度Peak fluorescence intensityDNA含量/%DNA content/%预估基因组大小(1C)/GbGenome size/Gb倍性Ploidy
    金都一号Jindu No.12n=2x=225 121100.001.40二倍体2X
    澳洲黄龙Aozhouhuanglong2n=2x=225 09799.531.39二倍体2X
    白肉Bairou2n=2x=225 313103.751.45二倍体2X
    白水晶Baishuijing2n=2x=226 035117.851.65二倍体2X
    粗砂Cusha2n=2x=225 121100.001.40二倍体2X
    大红Dahong2n=2x=225 205101.641.42二倍体2X
    帝龙Dilong2n=2x=224 71292.011.29二倍体2X
    富贵红450Fuguihong4502n=2x=225 10999.771.40二倍体2X
    光明白肉Guangmingbairou2n=2x=224 94196.491.35二倍体2X
    光明红肉Guangminghongrou2n=2x=224 49687.801.23二倍体2X
    广西450Guangxi 4502n=2x=224 78493.421.31二倍体2X
    桂红龙Guihonglong2n=2x=224 34084.751.19二倍体2X
    红宝龙Hongbaolong2n=2x=225 409105.621.48二倍体2X
    红皮Hongpi2n=2x=226 311123.241.73二倍体2X
    红肉Hongrou2n=2x=225 02598.131.37二倍体2X
    红水晶Hongshuijing2n=2x=224 59289.671.26二倍体2X
    续表2 Tab.2 Continued
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    品种Variety name染色体数目/条Chromosome number峰值荧光强度Peak fluorescence intensityDNA含量/%DNA content/%预估基因组大小(1C)/GbGenome size/Gb倍性Ploidy
    黄皮Huangpi2n=2x=224 48487.561.23二倍体2X
    玫瑰1号Meigui No.12n=2x=225 349104.451.46二倍体2X
    玫红4号Meihong No.42n=2x=224 52088.261.24二倍体2X
    美龙Meilong2n=2x=225 506107.521.51二倍体2X
    美龙3号Meilong No.32n=2x=226 107119.251.67二倍体2X
    蜜宝Mibao2n=2x=224 21982.391.15二倍体2X
    蜜玄龙Mixuanlong2n=2x=225 602109.391.53二倍体2X
    蔷薇3号Qiangwei No.32n=2x=224 49687.801.23二倍体2X
    软枝大红Ruanzhidahong2n=2x=224 94196.491.35二倍体2X
    石火泉Shihuoquan2n=2x=224 74892.721.30二倍体2X
    双色Shuangse2n=2x=225 397105.391.48二倍体2X
    台湾红肉Taiwanhongrou2n=2x=224 83294.361.32二倍体2X
    偷心6号Touxin No.62n=2x=225 277103.051.44二倍体2X
    陀2Tuo No.22n=2x=224 90595.781.34二倍体2X
    陀红肉小果Tuohongrouxiaoguo2n=2x=226 503126.991.78二倍体2X
    无刺红龙Wucihonglong2n=2x=225 854114.311.60二倍体2X
    无刺黄龙Wucihuanglong2n=2x=225 446106.351.49二倍体2X
    细致Xizhi2n=2x=226 612129.121.81二倍体2X
    香蜜龙Xiangmilong2n=2x=225 446106.351.49二倍体2X
    小圆果Xiaoyuanguo2n=2x=224 48487.561.23二倍体2X
    燕窝果Yanwoguo2n=4x=4410 939213.612.99四倍体4X
    越南白肉Yuenanbairou2n=2x=224 49687.801.23二倍体2X
    紫蜜龙Zimilong2n=2x=226 503126.991.78二倍体2X
    紫肉Zirou2n=2x=225 217101.871.43二倍体2X
    续表2 Tab.2 Continued
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    品种Variety name染色体数目/条Chromosome number峰值荧光强度Peak fluorescence intensityDNA含量/%DNA content/%预估基因组大小(1C)/GbGenome size/Gb倍性Ploidy
    紫肉2号Zirou No.12n=2x=225 049105.621.48二倍体2X
    紫色1号Zirou No.22n=2x=224 34084.751.19二倍体2X
    注:‘金都一号’为对照。
    Note: ‘Jindu-1’ was selected as control.
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出版历程
  • 收稿日期:  2023-10-18
  • 修回日期:  2023-12-20
  • 刊出日期:  2024-05-25

火龙果42份种质资源的倍性鉴定及基因组大小分析

doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.20230118
    基金项目:

    海南省自然科学基金高层次人才项目 320RC487

    海南省重大科技计划项目 ZDKJ2021014

    作者简介:

    丁一(1997-), 男, 海南大学热带农林学院2021级硕士研究生。E-mail: crystaldylj@163.com

    通讯作者: 汤华(1974-), 男, 教授, 博士研究生导师。研究方向: 火龙果遗传育种与分子生物学。E-mail: thtiger@163.com
  • 潘学峰
  • 中图分类号: S667.9

摘要: 为了满足火龙果的产业发展需求,必须开展火龙果高产优质新品种的选育工作。收集和评价火龙果种质资源,并开展火龙果的杂交育种,是火龙果育种的主要路径。火龙果种质资源多样,遗传倍性情况不明,对种质资源的倍性进行鉴定是育种创新不可缺少的环节。本研究建立了火龙果茎尖染色体制片体系,并采用茎尖染色体制片技术以及流式细胞技术对42份火龙果种质资源进行倍性鉴定。结果表明:1)火龙果茎尖染色体制片在前低渗时间为2 h、解离时间为1.5 h、酶解时间为1 h、后低渗时间为30 min时,染色体分散程度较好,背景清晰,没有出现重叠的现象,具有完整的细胞。2)火龙果茎尖倍性稳定,是最可靠的检测材料,老熟的茎条含有大量的四倍体和八倍体细胞,不宜做倍性鉴定材料。3)42份火龙果种质资源中有二倍体材料41份,四倍体材料1份,无三倍体材料。4)以‘金都一号’为参照,进行基因组大小的预估,发现有15份火龙果种质资源的1C-value(1C)≤1.34 Gb,为极小型基因组,27份火龙果种质资源的1C值在1.35~3.34 Gb之间,为小型基因组。

注释:
1)  潘学峰

English Abstract

丁一, 王周雯, 康绍玲, 姜森荣, 王猛, 黄家权, 李洪立, 胡文斌, 汤华. 火龙果42份种质资源的倍性鉴定及基因组大小分析[J]. 热带生物学报, 2024, 15(3): 306-314. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.20230118
引用本文: 丁一, 王周雯, 康绍玲, 姜森荣, 王猛, 黄家权, 李洪立, 胡文斌, 汤华. 火龙果42份种质资源的倍性鉴定及基因组大小分析[J]. 热带生物学报, 2024, 15(3): 306-314. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.20230118
DING Yi, WANG Zhouwen, KANG Shaoling, JIANG Senrong, WANG Meng, HUANG Jiaquan, LI Hongli, HU Wenbin, TANG Hua. Ploidy identification and genome size analysis of 42 Pitaya germplasm resources[J]. Journal of Tropical Biology, 2024, 15(3): 306-314. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.20230118
Citation: DING Yi, WANG Zhouwen, KANG Shaoling, JIANG Senrong, WANG Meng, HUANG Jiaquan, LI Hongli, HU Wenbin, TANG Hua. Ploidy identification and genome size analysis of 42 Pitaya germplasm resources[J]. Journal of Tropical Biology, 2024, 15(3): 306-314. doi: 10.15886/j.cnki.rdswxb.20230118
  • 主持人:朱国鹏

    火龙果是仙人掌科(Cactaceae)量天尺属(Hylocereus)或蛇鞭柱属(Seleniereus)的植物,原产于中美洲热带地区,是热带地区重要的经济作物[1-3]。随着消费升级,人们对火龙果的品质要求越来越高,火龙果新品种的研发也日益重要。火龙果育种中,不同种属、不同倍性材料的杂交是常用方法,对火龙果种质资源及杂交后代进行倍性鉴定是火龙果新品种选育的重要环节。黄黎芳等[4]对18份火龙果种质资源及8份杂交后代的倍性进行鉴定,发现自然界种主要存在二倍体和四倍体,杂交后代中存在三倍体。刘顺枝等[5-6]利用火龙果根尖和气生根对红肉火龙果和白肉火龙果进行核型分析,发现2种火龙果都是二倍体,染色体数目均为2n=2x=22。常规的植物倍性鉴定是采用染色体制片技术和染色体核型分析,火龙果的染色体制片多选择根尖和气生根为材料,但火龙果根多为须根,操作困难;气生根难以催生,获取不易。Soltis等[7]将未复制的配子核基因组中的DNA含量称为1C-value(1C),并根据1C值大小将基因组分成5大类,分别是极小型基因组(1C≤1.34 Gb)、小型基因组(1.35 Gb≤1C≤3.34 Gb)、中型基因组(3.35 Gb≤1C≤13.36 Gb)、大型基因组(13.37 Gb≤1C≤33.42 Gb)、特大型基因组(1C≥33.43 Gb)。流式细胞技术可以快速鉴定植物种质资源的倍性,预估基因组大小[8]。科学家使用流式细胞技术对草莓(Fragaria ananassa[9]、油茶(Camellia oleifera[10]、石斛(Dendrobium nobile[11]、猕猴桃(Actinidia chinensis[12]等植物进行倍性鉴定,证明流式细胞技术在植物倍性鉴定中的可行性。但流式细胞技术在火龙果方面的研究少有报道。本研究利用茎尖染色体制片技术与流式细胞技术对42份火龙果种质资源进行倍性鉴定以及基因组大小的估测,旨在为火龙果杂交育种亲本材料的选择提供参考。

    • 供试的42份种质资源材料取自海南恩红农业科技有限公司的种质资源圃(表1)。对照材料‘金都一号’的基因组大小为1.4 Gb。

      表 1  火龙果种质资源名称及编号

      Table 1.  The name and number of pitaya germplasm resources

      编号Number品种名称Name编号Number品种名称Name编号Number品种名称Name
      1澳洲黄龙Aozhouhuanglong15红水晶Hongshuijing29偷心6号Touxin No.6
      2白肉Bairou16黄皮Huangpi30陀2Tuo No.2
      3白水晶Baishuijing17金都一号Jindu No.131陀红肉小果Tuohongrouxiaoguo
      4粗砂Cusha18玫瑰1号Meigui No.132无刺红龙Wucihonglong
      5大红Dahong19玫红4号Meihong No.433无刺黄龙Wucihuanglong
      6帝龙Dilong20美龙Meilong34细致Xizhi
      7富贵红450 Fuguihong45021美龙3号Meilong No.335香蜜龙Xiangmilong
      8光明白肉Guangmingbairou22蜜宝Mibao36小圆果Xiaoyuanguo
      9光明红肉Guangminghongrou23蜜玄龙Mixuanlong37燕窝果Yanwoguo
      10广西450Guangxi 45024蔷薇3号Qiangwei No.338越南白肉Yuenanbairou
      11桂红龙Guihonglong25软枝大红Ruanzhidahong39紫蜜龙Zimilong
      12红宝龙Hongbaolong26石火泉Shihuoquan40紫肉Zirou
      13红皮Hongpi27双色Shuangse41紫肉1号Zirou No.1
      14红肉Hongrou28台湾红肉Taiwanhongrou42紫肉2号Zirou No.2
    • 用Tris-MgCl2解离缓冲液作为处理流式细胞样品的处理液,解离缓冲液所需试剂的配制方法如下。1)1 mol·L-1 Tris-HCl的制备:称取120.11 g Tris,加浓盐酸充分搅拌调节pH至8.0,双蒸水定容至1 000 mL,灭菌,温室保存。2)1 mol·L-1MgCl2的制备:称取1.9 g MgCl2,溶于20 mL双蒸水中,充分搅拌,室温下保存。

      将1 mol·L-1 Tris-HCl(200 mmol·L-1),1 mol·L-1 MgCl2(4 mmol·L-1),TritionX-100(0.5%)按含量混合,使用1 mol·L-1的HCl将解离缓冲液调节pH至7.5,用0.22 μm的滤膜进行过滤去除杂菌,放置冰箱4 ℃保存备用。

      采用Sysmex公司的CyFlow Ploidy Analyser流式细胞仪进行细胞倍性检测。然后用CyFlow Cube(Sysemex公司)软件获取数据,用FlowJo-V10.6.2软件进行结果分析。

    • (1)取材、预处理:选取健康、幼嫩的火龙果植株茎尖,并利用锋利的刀片去除外围的肉质幼叶,得到火龙果植株的中心茎尖;将解剖得到的火龙果植株茎尖放入0.2%的秋水仙素与0.002 mol·L-1的8-羟基喹啉混合液中,常温下静置2 h。

      (2)前低渗:用蒸馏水清洗2~3次后转入0.075 mol·L-1的KCl在常温下分别浸泡1.5、2、2.5 h,以确定适宜的前低渗时间。

      (3)前固定:将低渗后的茎尖放入卡诺氏固定液(V无水乙醇V冰醋酸= 3∶1)中,置于4 ℃条件下冷藏固定12 h以上。

      (4)解离:用蒸馏水清洗2~3次,将清洗去除卡诺氏固定液后的茎尖放入1 mol·L-1的HCl中,在常温下分别解离1、1.5、2 h,确定解离时间。

      (5)酶解:将解离后的茎尖用蒸馏水清洗2~3次,并放入2.5%的纤维素酶和果胶酶混合液(m纤维素酶m果胶酶=1∶1)中,在常温下分别处理0.5、1、1.5 h,确定酶解的时间;

      (6)后低渗:用蒸馏水清洗2~3次后,放入蒸馏水中分别低渗20、30、40 min,以确定后低渗时间。

      (7)后固定:将后低渗的茎尖放入卡诺氏固定液中,在4 ℃下冷藏固定30 min,固定结束后如不能及时进行制片使用,则将茎尖漂洗之后放入75%的酒精中保存(4 ℃);

      (8)染色、制片、观察:将茎尖置于载玻片上,轻轻切取尖端部位2~3 mm,并用锋利的刀将其尽可能的切碎,之后滴加10%改良苯酚品红颜色液,盖上盖玻片,染色20~40 min。染色结束后,用蒸馏水洗去多余染料,并用滤纸吸去多余液体。压片过程中使用带有橡皮的铅笔轻轻敲击盖玻片,使得茎尖组织和细胞可以均匀的分散在载玻片上,最后使用显微镜进行观察拍照。

    • (1)以已知二倍体材料‘金都一号’为内参,称取约100 mg的火龙果茎组织,去除表面蜡质层,放入预冷的培养皿中,加入预冷的解离缓冲液2 mL,用锋利的刀片竖直快速一次性切碎,整个过程中待测材料需要完全浸没于解离缓冲液中。(2)吸取培养皿中的解离缓冲液,用300目的过滤网过滤到流式细胞仪上机用的试管中。(3)将流式细胞仪的光源波长调节为532 nm,加入100 μL DAPI(4',6-二脒基-2-苯基吲哚)染液对细胞核DNA进行荧光标记,立即使用流式细胞仪进行样品检测,每个样品检测3次重复。(4)利用FlowJo-V10.6.2软件进行结果分析,以已知基因组大小的火龙果‘金都一号’为参照样本,计算待测样品的基因组大小(待测样品基因组大小等于参照样本基因组大小乘以待测样品平均荧光强度除以参照样品平均荧光强度)。

    • 研究发现,染色体周围往往附着比较多的细胞质,妨碍染色体的充分铺展,因此为了促使染色体可以更好的分散,笔者采用前将材料经过0.075 mol·L-1的KCl的处理,来利用细胞内外渗透压的不同,使细胞经过吸收充分膨胀,从而获得染色体分散更加良好的细胞。从图1可以看出,茎尖经过前低渗1.5 h后染色体聚集,不易分散;前低渗2 h后,染色体可以很好的分散;经过前低渗2.5 h的处理后,发现低渗时间过长会导致染色体出现损伤。

      图  1  不同前低渗时间对制片效果的影响

      Figure 1.  The effects of microscopical preparation by different pre-hypotonic treatment times

    • 解离的目的是为了更好的使细胞分离,材料软化易于制片以及单细胞的观察。从图2可知,当解离时间为1 h时,火龙果茎尖细胞解离不充分,在进行制片时细胞难以压散,且容易造成气泡残留,难以进行观察。当解离时间为2 h时,细胞易于分散,但由于解离时间过长,造成细胞破裂或者染色体出现断裂的现象。当解离时间为1.5 h时,细胞易于分散,没有出现重叠的现象,且染色体完好,背景清晰,易于观察和计数,适合用于核型分析。

      图  2  不同解离时间对制片效果的影响

      Figure 2.  The effect of microscopical preparation by different dissociation times

    • 观察中发现,火龙果茎尖存在大量果胶,并且火龙果茎尖中心部位属于木质部,细胞壁较厚不易于破除,因此在试验过程中使用纤维素酶和果胶酶混合液对火龙果茎尖进行处理。如图3所示,在酶解时间为0.5 h时,材料趋于硬化,并且存在果胶的残留,对制片过程造成了一定阻碍,且镜检后发现细胞存在重叠,不易于染色体的观察与计数。当酶解1.5 h时,在材料处理过程中容易在成断裂,从而遗失制片所需要的尖端部位,同时经过制片后观察发现,虽然可以得到单个细胞而且方便观察染色体,但是由于酶解时间过长造成细胞壁溶解消失,无法观测到细胞边界。当酶解时间为1 h时,材料的制备过程中硬度适中不容易断裂,制片时也可以获得分散的细胞,且细胞壁没有破裂的现象,可以更容易分辨出单细胞,适合用于核型分析。

      图  3  不同酶解时间对制片效果的影响

      Figure 3.  The effect of microscopical preparation by different enzymatic hydrolysis times

    • 后低渗的目的是为了使细胞吸水膨胀,从而使染色体更加的分散,但是为了防止细胞过度吸水,导致细胞涨破,所以仍需要确定后低渗的合适时间。从图4中可以发现,火龙果茎尖经过后低渗20 min,染色体依然存在较为集中,出现缠绕、重叠等现象,对后续的核型分析造成影响。当后低渗时间为40 min时,细胞吸水涨破,容易造成染色体缺失。当后低渗时间为30 min时,染色体分散程度较好,且细胞完整,易于后续的计数与计算,适用于核型分析。

      图  4  不同后低渗时间对制片效果的影响

      Figure 4.  The effect of microscopical preparation by different post-hypotonic treatment times

    • 本实验以已经确定的火龙果二倍体材料‘金都一号’为参照品种材料,对其茎尖、幼嫩茎条、老熟茎条进行检测,选取优质的实验材料。从图5可知,茎尖的流式细胞检测有良好的二倍体单峰。而幼嫩茎条与老熟茎条则有3个峰值,且相对于幼嫩茎条,老熟茎条则有更多的八倍体细胞。同时,在检测过程中发现幼嫩茎条和老熟茎条的杂质较多,导致获得有效的细胞核数降低。

      图  5  火龙果不同组织部位的流式细胞检测

      Figure 5.  Flow cytometry assays for different tissues of pitaya

      幼嫩茎条和老熟茎条相比,老熟茎条的八倍体细胞对应峰值比四倍体细胞对应峰值高,因此在进行倍性鉴定时,老熟茎条容易造成判断错误。幼嫩茎条的四倍体细胞对应的峰值比二倍体细胞对应的峰值高。在火龙果流式细胞技术的检测上,茎尖最适宜作为试验材料,其次是幼嫩茎条,老熟茎条不适合作为火龙果流式细胞检测材料。

    • 以已知的二倍体‘金都一号’(2n=2x=22)为对照材料,对42份火龙果种质资源进行流式细胞倍性鉴定,测得‘金都一号’染色体的峰值荧光强度为5 121,其具有良好的二倍体单峰;四倍体品种染色体的峰值荧光强度在2倍的二倍体荧光强度处有较好的单峰,且四倍体品种的DNA相对含量也是二倍体含量的2倍(图6)。

      图  6  火龙果二倍体与四倍体细胞的对比

      Figure 6.  the comparison between diploid and tetraploid cells of pitaya

      经流式细胞检测收集的42份火龙果种质资源的染色体倍性见表2。其中,有41份荧光强度值在4 219~6 612之间,呈二倍体荧光强度(0.82~1.29),为二倍体材料;1份荧光强度值为10 939,是2.14倍的二倍体的荧光强度值,为四倍体材料。四倍体材料为‘燕窝果’。在42份火龙果种质资源材料中并未发现三倍体材料。

      表 2  不同火龙果种质资源的基因组大小、倍性及染色体数目

      Table 2.  The genome size, ploidy and chromosome number of different pitaya germplasm resources

      品种Variety name染色体数目/条Chromosome number峰值荧光强度Peak fluorescence intensityDNA含量/%DNA content/%预估基因组大小(1C)/GbGenome size/Gb倍性Ploidy
      金都一号Jindu No.12n=2x=225 121100.001.40二倍体2X
      澳洲黄龙Aozhouhuanglong2n=2x=225 09799.531.39二倍体2X
      白肉Bairou2n=2x=225 313103.751.45二倍体2X
      白水晶Baishuijing2n=2x=226 035117.851.65二倍体2X
      粗砂Cusha2n=2x=225 121100.001.40二倍体2X
      大红Dahong2n=2x=225 205101.641.42二倍体2X
      帝龙Dilong2n=2x=224 71292.011.29二倍体2X
      富贵红450Fuguihong4502n=2x=225 10999.771.40二倍体2X
      光明白肉Guangmingbairou2n=2x=224 94196.491.35二倍体2X
      光明红肉Guangminghongrou2n=2x=224 49687.801.23二倍体2X
      广西450Guangxi 4502n=2x=224 78493.421.31二倍体2X
      桂红龙Guihonglong2n=2x=224 34084.751.19二倍体2X
      红宝龙Hongbaolong2n=2x=225 409105.621.48二倍体2X
      红皮Hongpi2n=2x=226 311123.241.73二倍体2X
      红肉Hongrou2n=2x=225 02598.131.37二倍体2X
      红水晶Hongshuijing2n=2x=224 59289.671.26二倍体2X
      续表2 Tab.2 Continued
    • 根据植物基因组的1C值大小,将基因组分成5类。以‘金都一号’为对照,对其余41种火龙果基因组大小进行预估,发现预估基因组大小在1.15~2.99 Gb之间(表2),预估基因组的平均大小为1.45 Gb,其中有15份火龙果种质资源的1C≤1.34 Gb,属于极小型基因组;其余27份火龙果种质资源的1C值在1.35 Gb~3.34 Gb之间,属于小型基因组。42份火龙果种质资源的预估基因组大小主要集中在1.35~3.34 Gb之间,其次在1.15~1.34 Gb之间,并未发现其他种类的基因组,其中‘蜜宝’的基因组最小,仅有1.15 Gb;‘燕窝果’的基因组最大,达到了2.99 Gb。两者的预估基因组大小相差2.6倍。

      品种Variety name染色体数目/条Chromosome number峰值荧光强度Peak fluorescence intensityDNA含量/%DNA content/%预估基因组大小(1C)/GbGenome size/Gb倍性Ploidy
      黄皮Huangpi2n=2x=224 48487.561.23二倍体2X
      玫瑰1号Meigui No.12n=2x=225 349104.451.46二倍体2X
      玫红4号Meihong No.42n=2x=224 52088.261.24二倍体2X
      美龙Meilong2n=2x=225 506107.521.51二倍体2X
      美龙3号Meilong No.32n=2x=226 107119.251.67二倍体2X
      蜜宝Mibao2n=2x=224 21982.391.15二倍体2X
      蜜玄龙Mixuanlong2n=2x=225 602109.391.53二倍体2X
      蔷薇3号Qiangwei No.32n=2x=224 49687.801.23二倍体2X
      软枝大红Ruanzhidahong2n=2x=224 94196.491.35二倍体2X
      石火泉Shihuoquan2n=2x=224 74892.721.30二倍体2X
      双色Shuangse2n=2x=225 397105.391.48二倍体2X
      台湾红肉Taiwanhongrou2n=2x=224 83294.361.32二倍体2X
      偷心6号Touxin No.62n=2x=225 277103.051.44二倍体2X
      陀2Tuo No.22n=2x=224 90595.781.34二倍体2X
      陀红肉小果Tuohongrouxiaoguo2n=2x=226 503126.991.78二倍体2X
      无刺红龙Wucihonglong2n=2x=225 854114.311.60二倍体2X
      无刺黄龙Wucihuanglong2n=2x=225 446106.351.49二倍体2X
      细致Xizhi2n=2x=226 612129.121.81二倍体2X
      香蜜龙Xiangmilong2n=2x=225 446106.351.49二倍体2X
      小圆果Xiaoyuanguo2n=2x=224 48487.561.23二倍体2X
      燕窝果Yanwoguo2n=4x=4410 939213.612.99四倍体4X
      越南白肉Yuenanbairou2n=2x=224 49687.801.23二倍体2X
      紫蜜龙Zimilong2n=2x=226 503126.991.78二倍体2X
      紫肉Zirou2n=2x=225 217101.871.43二倍体2X
      续表2 Tab.2 Continued
      品种Variety name染色体数目/条Chromosome number峰值荧光强度Peak fluorescence intensityDNA含量/%DNA content/%预估基因组大小(1C)/GbGenome size/Gb倍性Ploidy
      紫肉2号Zirou No.12n=2x=225 049105.621.48二倍体2X
      紫色1号Zirou No.22n=2x=224 34084.751.19二倍体2X
      注:‘金都一号’为对照。
      Note: ‘Jindu-1’ was selected as control.
    • 在对火龙果染色体制片材料的选择中发现火龙果根系多为须根系,根系较细且木质化严重,不易切割制片;火龙果枝条的气生根相对较粗且质地柔软,方便制片,但火龙果气生根并没有稳定的催生技术,获取不易。本研究为建立方便、快捷、稳定的火龙果制片技术体系,以火龙果茎尖为材料进行火龙果染色体制片。本研究发现,火龙果茎尖染色体制片在前低渗时间为2 h;解离时间为1.5 h;酶解时间为1 h;后低渗时间为30 min时,染色体分散程度较好,背景清晰,没有出现重叠的现象,具有完整的细胞。

      流式细胞技术在植物倍性鉴定方面具有操作简单、效率高、结果准确的特点[13]。为了获得准确的倍性鉴定结果,样品的选择是其中的关键。本试验对火龙果流式细胞检测的材料进行筛选比较,发现幼芽茎尖具有较好的二倍体荧光图像。幼嫩茎条与老熟茎条都存才较多的杂峰,且细胞核数显著降低,存在较多的四倍体细胞和八倍体细胞,影响流式细胞检测的准确性。

      在种质资源评价中,染色体的倍性鉴定是其中重要的环节,染色体的倍性鉴定对新品种选育及品种资源的科学利用具有重要意义[14]。本研究利用染色体制片技术和流式细胞技术,同时对42份火龙果种质资源进行倍性鉴定,取得一致性的研究结果,其中41份种质资源为二倍体(2n=2x=22)材料,1份四倍体(2n=4x=44)材料,未发现三倍体种质资源。42份火龙果种质资源中仅有1份四倍体材料,预估基因组大小为‘燕窝果’(2.99 Gb)。所有二倍体材料中‘细致’的预估基因组最大,大小为1.81 Gb;‘蜜宝’的预估基因组最小,为1.15 Gb。

      随着火龙果产业的发展,火龙果优质新品种的选育显得尤为重要。本研究利用茎尖染色体制片技术和流式细胞技术,对42份火龙果种质资源进行倍性鉴定以及基因组大小研究,既能为培育优质火龙果品种和开展人工授粉杂交、转基因等工作提供参考,也能为火龙果的全基因组测序以及细胞遗传学研究提供依据。

参考文献 (14)

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